New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4276970 = | 28 (1.210) | 6 (0.270) | 6/244 | NT | 18.4% | coding (322/1236 nt) | glcF | glycolate oxidase iron‑sulfur subunit |
? | NC_002947 | 4277012 = | 26 (1.150) | coding (364/1236 nt) | glcF | glycolate oxidase iron‑sulfur subunit |
TCGAAGGCGAGCCGGTCACCGCCAGCACCCAATTGCACCTGGACCGCTGCCTGACCTGCCGCAACTGCGAAACCACCTGCCCATCGGGGGTGAAGTACCACGATCTGCTGGACATCGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGCCGCGCCCGGCACTGTTCAAGGCCCTGACCCGCAGCGGCCAGGTGCTGCGCCCGCTGCTACCGGCCTCAGTCAAACGCAAGTTGCCGGCGCA > NC_002947/4276824‑4277109 | atccggcgtgcatggcgcactgccggacgctggcccggtgtggtgacttgcgccggcaacttgcgtttgactgaggccggtagcagcgggcgcagcacctggccgctgcgggtcagggccttgaacagtgccgggcgcggcaccaccgcc < 2:209170‑M1/4‑1 (MQ=255) gCCGGTCACCGCCAGCACCCAATTGCACCTGGACCGCTGCCTGACCTGCCGCAACTGCGAAACCACCTGCCCATCGGGGGTGAAGTACCACGATCTGCTGGACATCGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCa < 2:581693/150‑1 (MQ=255) aCCGCCAGCACCCAATTGCACCTGGACCGCTGCCTGACCTGCCGCAACTGCGAAACCACCTGCCCATCGGGGGTGAAGTACCACGATCTGCTGGACATCGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTg > 1:118572/1‑150 (MQ=255) tggcccggtgtggtgacttgcgccggcaacttgcgtttgactgaggccggtagcagcgggcgcagcacctggccgctgcgggtcagggccttgaacagtgccgggcgcggcaccacCGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGcc < 2:24485‑M1/34‑1 (MQ=255) cccggtgtggtgacttgcgccggcaacttgcgtttgactgaggccggtagcagcgggcgcagcacctggccgctgcgggtcagggccttgaacagtgccgggcgcggcaccacCGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCtgc > 1:355117‑M1/114‑150 (MQ=255) aCCAGGACCGCTGGCTGACCTGCCGCAACTGCGAAACCACCTGCCCATCGGGGGTGAAGTACAACGATCTGCTGGACATCGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCtgcgtg > 2:411648/1‑150 (MQ=255) tggtgacttgcgccggcaacttgcgtttgactgaggccggtagcagcgggcgcagcacctggccgctgcgggtcagggccttgaacagtgccgggcgcggcaccacCGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCggt > 1:209170‑M1/107‑150 (MQ=255) aCCGCTGCCTGACCTGCCGCAACTGCGAAACCACCTGCCCATCGGGGGTGAAGTACCACGATCTGCTGGACATCGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTCCggtgg > 2:503158/1‑150 (MQ=255) cGCTGCCTGACCTGCCGCAACTGCGAAACCACCTGCCCATCGGGGGTGAAGTACCACGATCTGCTGGACATCGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGgtggtg > 1:485892/1‑150 (MQ=255) gCTGCCTGACCTGCCGCAACTGCGAAACCACCTGCCCATCGGGGGTGAAGTACCACGATCTGCTGGACATCGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGc > 1:409775/1‑150 (MQ=255) tgcgccggcaacttgcgtttgactgaggccggtagcagcgggcgcagcacctggccgctgcgggtcagggccttgaacagtgccgggcgcggcaccacCGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGCcgc > 1:24485‑M1/99‑150 (MQ=255) tGACCTGCCGCAACTGCGAAACCACCTGCCCATCGGGGGTGAAGTACCACGATCTGCTGGACATCGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTGCGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGGGCGGTGGTGCCGCGcc > 1:223396/1‑150 (MQ=255) tttgactgaggccggtagcagcgggcgcagcacctggccgctgcgggtcagggccttgaacagtgccgggcgcggcaccacCGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGc > 1:112552‑M1/82‑130 (MQ=255) tttgactgaggccggtagcagcgggcgcagcacctggccgctgcgggtcagggccttgaacagtgccgggcgcggcaccacCGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGc < 2:112552‑M1/49‑1 (MQ=255) cTGCCCATCGGGGGTGAAGTACCACGATCTGCTGGACATCGGCCGAGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGTCCTGCGTGCGGTGGTGCCGCGCCCGGCACTGTTCAAGGCCCTGAcctg > 1:130825/1‑148 (MQ=255) aTCGGGGGTGAAGTACCACGATCTGCTGGACATCGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGCCGCGCCCGGCACTGTTCAAGGCCCTGACCCGCAGCgg > 2:526900/1‑150 (MQ=255) ccACGATCTGCTGGACATCGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGCCGCGCCCGGCACTGTTCAAGGCCCTGACCCGCAGCGGCCAGGTGCTGCGccc > 1:302552/1‑150 (MQ=255) cGATCTGCTGGACATCGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGCCGCGCCCGGCACTGTTCAAGGCCCTGACCCGCAGCGGCCAGGTGCTGCGCCCgct > 2:537797/1‑150 (MQ=255) tCTGCTGGACATCGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCt > 2:606405/1‑72 (MQ=255) tCTGCTGGACATCGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCt < 1:606405/72‑1 (MQ=255) tgctgGACATCGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGCCGCACCCGGTAATTTTCAAGGCCCTGACCCGCAGCGGCCAGGTGCTGCGCCCGCTGCTAc > 2:173649/1‑150 (MQ=255) tgGACATCGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGCCGCGCCCGGCACTGTTCAAGGCCCTGACCCGCAGCGGCCAGGTGCTGCGCCCGCTGCTACCgg > 1:434714/1‑150 (MQ=255) ggACATCGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGCCGCGCCCGGCACTGTTCAAGGCCCTGACCCGCAGCGGCCAGGTGCTGCGCCCGCTGCTACCGGc > 1:540311/1‑150 (MQ=255) aTCGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGCCGCGCCCGGCACTGTTCAAGGCCCTGACCCGCAGCGGCCAGGTGCTGCGCCCGCTGCTACCAGCTTCa < 2:485892/150‑1 (MQ=255) tCGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGCCGCGCCCGGCACTGTTCAAGGccc < 2:271130/105‑1 (MQ=255) tCGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGCCGCGCCCGGCACTGTTCAAGGccc > 1:271130/1‑105 (MQ=255) cGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGCCGCGCCCGGCACTGTTCAAGGCCCTGACCCGCAGCGGCCAGGTGCTGCGCCCGCTGCTACCGGCCTCAGt < 2:302552/150‑1 (MQ=255) cgcgCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGCCGCGCCCGGCACTGTTCAAGGCCCTGACCCGCAGCGGCCAGGTGCTGCGCCCGCTGCTACCGGCCTCAGTCaaa < 1:537797/150‑1 (MQ=255) gcgcAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGTCTGCGTGCGGTGGTGCCGCGCCCGGCACTGTTCAAGGCCCTGACCCGCAGCGGCCAGGTGCTGCGCCCGCTGCTACCGGCCTCAGTCAAAc < 2:118572/150‑1 (MQ=255) aGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGCCGCGCCCGGCACTGTTCAAGGCCCTGACCCGCAGCGGCCAGGTGCTGCGCCCGCTGCTACCGGCCTCAGTCAAACGCaa < 2:409775/150‑1 (MQ=255) aGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGCCGCGCCCGGCACTGTTCAAGGCCCTGACCCGCAGCGGCCAGGTGCTGCGCCCGCTGCTACCGGCCTCAGTCAAACGCaa < 1:411648/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGCCGCGCCCGGCACTGTTCAAGGCCCTGACCCGCAGCGGCCAGGTGCTGCGCCCGCTGCTACCGGCCTCAGTCAAACGCAAGTTg > 1:612124/1‑150 (MQ=255) gTCGAGCAGCAGGTGACACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGCCGCGCCCGGCACTGTTCAAGGCCCTGACCCGCAGCGGCCAGGTGCTGCGCCCGCTGCTACCGGCCTCAGTCAAACGCAAGTTg > 2:458731/1‑150 (MQ=255) gAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGCCGCGCCCGGCACTGTTCAAGGCCCTGACCCGCAGCGGCCAGGTGCTGCGCCCGCTGCTACCGGCCTCAGTCAAACGCAAGTTGCCg > 1:28243/1‑150 (MQ=255) gcagGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGCCGCGCCCGGCACTGTTCAAGGCCCTGACCCGCAGCGGCCAGGTGCTGCGCCCGCTGCTACCGGCCTCAGTCAAACGCAAGTTGCCGGCGCa > 1:408603/1‑150 (MQ=255) | TCGAAGGCGAGCCGGTCACCGCCAGCACCCAATTGCACCTGGACCGCTGCCTGACCTGCCGCAACTGCGAAACCACCTGCCCATCGGGGGTGAAGTACCACGATCTGCTGGACATCGGCCGCGCAGTGGTCGAGCAGCAGGTGCCACGCCCGCTCGGCCAGCGCCTGTTGCGCCTGGGCCTGCGTGCGGTGGTGCCGCGCCCGGCACTGTTCAAGGCCCTGACCCGCAGCGGCCAGGTGCTGCGCCCGCTGCTACCGGCCTCAGTCAAACGCAAGTTGCCGGCGCA > NC_002947/4276824‑4277109 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |