| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4593882 = | 38 (1.640) | 3 (0.160) | 3/202 | NT | 10.4% | intergenic (+142/+157) | mccA/PP_4068 | methylcrotonyl‑CoA carboxylase biotin‑containing subunit alpha/Cro/CI family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | 4593975 = | 21 (1.120) | intergenic (+235/+64) | mccA/PP_4068 | methylcrotonyl‑CoA carboxylase biotin‑containing subunit alpha/Cro/CI family transcriptional regulator | |||||
GGAATAACGGTGCCGGAGGGCCGCTTTGCGGCCCTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTAC > NC_002947/4593734‑4594028 | ttgaacagtaactacccggcgctgttgtgcgaagagggttgcgaatttcttggggtggtcgtgcgggtgcatggggctttttgaaagggtttgagtagtggcggcaacggtgaacggcgggtggaagttggccagcagggccggcccttt < 2:522024‑M1/2‑1 (MQ=255) aaCGGTGCCGGAGGGCCGCTTTGCGGCCTTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCAGCCGCTACCGTATTCGCgg < 1:453102/150‑1 (MQ=255) taactacccggcgctgttgtgcgaagagggttgcgaatttcttggggtggtcgtgcgggtgcatggggctttttgaaagggtttgagtagtggcggcaacggtgaacggcgggtggaagttggccagcagggccggccctTTCGCGGGTa < 2:422248‑M1/10‑1 (MQ=255) tGCCGGAGGGCCGCTTTGCGGCCCTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTaaa > 2:517955/1‑150 (MQ=255) actacccggcgctgttgtgcgaagagggttgcgaatttcttggggtggtcgtgcgggtgcatggggctttttgaaagggtttgagtagtggcggcaacggtgaacggcgggtggaagttggccagcagggccggccctTTCGCGGGTaaa < 1:609912‑M1/12‑1 (MQ=255) ccGGAGGGCCGCTTTGCGGCCCTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAAcc > 2:101237/1‑150 (MQ=255) ccGGAGGGCCGCTTTGCGGCCCTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAAcc < 1:33414/150‑1 (MQ=255) ccggcgctgttgtgcgaagagggttgcgaatttcttggggtggtcgtgcgggtgcatggggctttttgaaagggtttgagtagtggcggcaacggtgaacggcgggtggaagttggccagcagggccggccctTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:439779‑M1/17‑1 (MQ=255) ccggcgctgttgtgcgaagagggttgcgaatttcttggggtggtcgtgcgggtgcatggggctttttgaaagggtttgagtagtggcggcaacggtgaacggcgggtggaagttggccagcagggccggccctTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:433901‑M1/17‑1 (MQ=255) ggagctgttgtacggcgagcgtcgtgtatttctggggttgttcgtgcgggtgcatggggctttttgaaagggtttgagtagtggcggcaacggtgaacggcgggtggaagttggccagcagggccggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 2:439779‑M1/132‑150 (MQ=255) ggCCGCTTTGCGGCCCTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTcc > 2:608126/1‑150 (MQ=255) tttGCGGCCCTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATc > 2:31828/1‑150 (MQ=255) gCCCTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCg < 1:360510/150‑1 (MQ=255) cTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCgggg > 2:303271/1‑150 (MQ=255) gggttgcgaatttcttggggtggtcgtgcgggtgcatggggctttttgaaagggtttgagtagtggcggcaacggtgaacggcgggtggaagttggccagcagggccggccctTTcgc > 1:389993‑M1/114‑118 (MQ=255) gggttgcgaatttcttggggtggtcgtgcgggtgcatggggctttttgaaagggtttgagtagtggcggcaacggtgaacggcgggtggaagttggccagcagggccggccctTTcgc < 2:389993‑M1/5‑1 (MQ=255) cGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTgg < 2:323246/150‑1 (MQ=255) gCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGCAAACCCGCTCCTACCTCCGATCGGGGGTGGa > 1:397503/1‑150 (MQ=255) tGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAgg < 1:608126/150‑1 (MQ=255) gtcgtgcgggtgcatggggctttttgaaagggtttgagtagtggcggcaacggtgaacggcgggtggaagttggccagcagggccggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGgc < 2:358794‑M1/59‑1 (MQ=255) gCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGgc < 1:101237/150‑1 (MQ=255) cAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACTCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAg < 2:391277/150‑1 (MQ=255) cGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCcgc < 2:531095/150‑1 (MQ=255) gTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCcgcg < 1:303271/150‑1 (MQ=255) gCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAgg > 2:432541/1‑150 (MQ=255) tttttgaaagggtttgagtagtggcggcaacggtgaacggcgggtggaagttggccagcagggccggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCg > 1:358794‑M1/72‑150 (MQ=255) ttttgaaagggtttgagtagtggcggcaacggtgaacggcgggtggaagttggccagcagggccggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCgg > 2:568387‑M1/71‑150 (MQ=255) ccGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCggg > 1:525022/1‑73 (MQ=255) ccGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCggg < 2:525022/73‑1 (MQ=255) ggccTGCTAGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGggcc < 2:477713/150‑1 (MQ=255) tgctgGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGggccggcc > 2:510359/1‑150 (MQ=255) tgctgGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGggccggcc > 2:236642/1‑150 (MQ=255) ctgGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCct < 1:432541/150‑1 (MQ=255) tgGCCAATCTCTACCCGTCGCCCACCCTTGCCGCCGCTACCGAACTCGCCGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGCGGCGCACACATGTCGGTGACTAGGCACACGCCGCCCGCAGGAGCGGCTTGACCCGCGAACGGGCCGGccccg > 2:38958/1‑148 (MQ=255) gCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCctgct > 1:606454/1‑150 (MQ=255) cAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCgt < 2:504731/110‑1 (MQ=255) cAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCgt > 1:504731/1‑110 (MQ=255) tctACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCacc < 1:426877/150‑3 (MQ=255) tctACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAAc < 1:236642/150‑1 (MQ=255) ccccGGCGCTCACCGTTGCAGCCACTACCGTGTTCGCGAGTATACGCGCTCCTACCTCCGAGCGGGGGTGGACGCATGTTGGGGACTAGGCGCAGGCCGCGGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTc < 2:397503/149‑1 (MQ=21) ccGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTcc > 1:365053/1‑50 (MQ=255) ccGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 2:365053/50‑1 (MQ=255) ccGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCa > 1:422248/1‑150 (MQ=255) ccGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCa < 2:606454/150‑1 (MQ=255) ccGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCa < 1:154892/150‑1 (MQ=255) gTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCCGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGCGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGCCCAACTTCCAcc > 1:28468/1‑150 (MQ=255) aCCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCACCCGCCGtt > 1:438573/1‑150 (MQ=255) cGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCACCCGCCGTTCa < 1:517955/150‑1 (MQ=255) gcTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCACCCGCCGTTCACCGTTgccgc < 1:31828/150‑1 (MQ=255) gTATCCGCGGGCAAAACCCCTCCTACATCCGTTCGGGGGTGGACAAATGTTGGTGATTCAGCTCTGTTCGCTTGTCGCAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCTCCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCactac < 1:380766/150‑1 (MQ=18) | GGAATAACGGTGCCGGAGGGCCGCTTTGCGGCCCTAACGCAACACAAGGCCGCCCCTGCAACAGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCTACCCGTCGCTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATCCGATCGGGGGTGGACACATGTTGGTGATTAGGCGCAGGCCGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAACTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACTAC > NC_002947/4593734‑4594028 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |