New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1473864 | 31 (1.340) | 3 (0.140) | 3/234 | NT | 10.2% | coding (364/1317 nt) | algD | GDP‑mannose 6‑dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 1473895 | 24 (1.110) | coding (333/1317 nt) | algD | GDP‑mannose 6‑dehydrogenase |
TGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGATGTACTCCAGGCCCAGGTCGCCGTTTTTCTTGCTGGGGGTGCCCACGCAGATCATCGACACATCGCTGGCACGGATGGCT > NC_002947/1473715‑1474012 | tGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCG < 2:301262‑M1/150‑1 (MQ=255) gTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGATTTCACGTAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAAGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGccccac < 2:29776/150‑1 (MQ=255) gTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGCGCTGCGCACCACGATGgt < 2:330724/150‑1 (MQ=255) tCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGCTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCGTCTTCCCCGACCAGCCTTACACGACCGAGATAACCCCGTTCTTTCCAGTTCCAGACAGTGCGCTGCGGCGCACcgcgttcgtt > 2:107443/1‑144 (MQ=255) ttGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGa < 2:579370/150‑1 (MQ=255) gTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGggtg < 1:95960/150‑1 (MQ=255) ttCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTc > 1:60778/1‑150 (MQ=255) aCGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGtgacaccacccgccgtcacaccatcgtggtgcg > 2:54731‑M1/1‑117 (MQ=255) ggAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGTCCTGCTTGCTCGAGGAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGtgacatcacccgccgtcacaccatcgtggtgcgcagca < 2:224145‑M1/150‑39 (MQ=255) gAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGtgacaccacccgccgtcacaccatcgtggtgcgcagcac < 1:54731‑M1/150‑40 (MQ=255) ttCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTa > 2:19882/1‑150 (MQ=255) ccGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGc < 2:125125/150‑1 (MQ=255) cGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGcaca < 1:19882/150‑1 (MQ=255) cGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACgg > 1:27075/1‑150 (MQ=255) gACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGAt < 1:594725/150‑1 (MQ=255) ccTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGAcg > 2:58100/1‑91 (MQ=255) ccTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGAcg < 1:58100/91‑1 (MQ=255) tGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGATGTACTCCAGGCCCa > 1:302191/1‑150 (MQ=255) ccGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGATGTACTCCAGGCCCAGGt > 2:432793/1‑150 (MQ=255) aGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGATGTACTCCAGGCCCAGGTCGCCGt > 1:193208/1‑150 (MQ=255) gggATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGATGTACTCCAGGCCCAGGTCGCCGTTTTTCTTGCTgggg < 1:120491/150‑1 (MQ=255) gATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGGGATACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGATGTACTCCAGGCCCAGGTCGCCGTTTTTCTTGCTGGGGGt > 1:420295/1‑150 (MQ=255) gATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGATGTACTCCAGGCCCAGGTCGCCGTTTTTCTTGCTGGGGGt > 1:485509/1‑150 (MQ=255) tGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGATGTACTCCAGGCCCAGGTCGCCGTTTTTCTTGCTGGGGGTGc < 2:420295/150‑1 (MQ=255) ttGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGATGTACTCCAGGCCCAGGTCGCCGTTTTTCTTGCTGGGGGTGCCCACGCAGatc > 1:137455/1‑150 (MQ=255) aCGGTGCCAGGCAGTACGTTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGATGTACTCCAGGCCCAGGTCGCCGTTTTTCTTGCTGGGGGTGCCCACGCAGatcatc < 1:195754/150‑1 (MQ=255) aCGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGATGTACTCCAGGCCCAGGTCGCCGTTTTTCTTGCTGGGGGTGCCCACGCAGatcatc < 1:129227/150‑1 (MQ=255) ggTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGATGTACTCCAGGCCCAGGTCGCCGTTTTTCTTGCTGGGGGTGCCCACGCAGATCATCGa > 1:593052/1‑150 (MQ=255) tGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGATGTACTCCAGGCCCAGGTCGCCGTTTTTCTTGCTGGGGGTGCCCACGCAGATCATCGaca < 2:60778/150‑1 (MQ=255) cAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCAcgcagcac > 2:194826‑M2/1‑50 (MQ=255) cAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCAcgcagcac < 1:194826‑M2/58‑9 (MQ=255) cAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGATGTACTc < 2:314308/94‑1 (MQ=255) cAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGATGTACTc > 1:314308/1‑94 (MQ=255) aGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGATGTACTCCAGGCCCAGGTCGCCGTTTTTCTTGCTGGGGGTGCCCACGCAGATCATCGACACATc > 2:75245/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGATGTACTCCAGGCCCAGGTCGCCGTTTTTCTTGCTGGGGGTGCCCACGCAGATCATCGACACATCGCTGGCACg > 1:280419/1‑150 (MQ=255) gTGCTGCGtgacaccacccgccgtcacaccatcgtggtgcgcagcaccgtactgcctg > 2:194826‑M1/1‑8 (MQ=255) gTGCTGCGtgacaccacccgccgtcacaccatcgtggtgcgcagcaccgtactgcctg < 1:194826‑M1/58‑51 (MQ=255) gTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCAcgcagcaccgtactgcctggcaccgtcaagaacgtggtcatcccgatcctcgaagactgctcgggcaagaaggccggcgtcgacttcggcgtggcggtcaacccggaattc < 1:54731‑M2/150‑112 (MQ=255) tgctgcGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGATGTACTCCAGGCCCAGGTCGCCGTTTTTCTTGCTGGGGGTGCCCACGCAGATCATCGACACATCGCTGGCACGGa < 2:193208/150‑1 (MQ=255) tgctgcGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGATGTCAcgcagcaccgtactgcctggcaccgtcaagaacgtggtcatcccgatcctcgaagactcctcgagcaagcaggacggcgtcgacttcggcgtggcggtcaacccggaattcc < 2:224145‑M2/150‑113 (MQ=255) gctgcGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGATGTACTCCAGGCCCAGGGCGCCGTTTTTCTTGCTGGGGGTGCCCACGCAGATCATCGACACATCGCTGGCACGGAt < 1:491854/150‑1 (MQ=255) cgcACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCAcgcagcaccgtactgcctggcaccgtcaagaacgtggtcatcccgatcctcgaagactgctcgggcaagaaggccggcgtcgacttcggcgtggcggtcaacccggaattcctgcgt > 2:54731‑M2/1‑33 (MQ=255) | TGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGATGGTGTGACGGCGGGTGGTGTCACGCAGCACGTAGCCGATTTCGCGGCACACGGACTCGATGTACTCCAGGCCCAGGTCGCCGTTTTTCTTGCTGGGGGTGCCCACGCAGATCATCGACACATCGCTGGCACGGATGGCT > NC_002947/1473715‑1474012 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |