New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1968086 | 14 (0.610) | 4 (0.190) | 4/224 | NT | 22.5% | intergenic (‑54/+104) | yciK/gph | putative oxidoreductase/phosphoglycolate phosphatase |
? | NC_002947 | = 1968145 | 15 (0.720) | intergenic (‑113/+45) | yciK/gph | putative oxidoreductase/phosphoglycolate phosphatase |
CTTGGCAGCCGCGGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGT > NC_002947/1967940‑1968229 | cTTGGCAGCCGCGGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTAc > 2:342638/1‑150 (MQ=255) cTTGGCAGCCGCGGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTAc > 1:135511/1‑150 (MQ=255) cTTGGCAGCCGCGGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTAc < 2:355927/150‑1 (MQ=255) tGGCAGCCGCGGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTAccc > 2:485237/1‑150 (MQ=255) ccGCGGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGTATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTCGCACCTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAt > 1:499932/1‑150 (MQ=255) gccgccccAATGGCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGAGGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGc < 2:343736/144‑1 (MQ=255) cACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTcc < 2:135511/150‑1 (MQ=255) ccACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTcacccgcgaatgcgccagcccggac > 2:558660‑M1/1‑125 (MQ=255) gccggcACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAg < 1:342638/150‑1 (MQ=255) aCCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGt > 1:1183/1‑150 (MQ=255) aGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTTGTGTGTGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGgc < 1:107271/150‑1 (MQ=255) aaggCCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaacccgc > 2:470201‑M2/2‑143 (MQ=255) gcgggcggTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTcacccgcgaatgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgcgg > 1:232376‑M1/1‑75 (MQ=255) gcgggcggTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTcacccgcgaatgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgcgg < 2:232376‑M1/131‑57 (MQ=255) gggcggTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTcacccgcgaatgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgcgggtaaacccgctcctacgatag < 1:558660‑M1/150‑78 (MQ=255) cggTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGGGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGGAAATGCGTCCGATCAGGCGTGTTGACTGCCCCGACGATCTCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGc < 1:262054/150‑1 (MQ=255) ggTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCg < 1:485237/150‑1 (MQ=255) tCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCt > 1:154260/1‑150 (MQ=255) gAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCa > 2:114324/1‑150 (MQ=255) gcggcCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAgcgc > 2:456236/1‑150 (MQ=255) ggCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGa < 2:392123/150‑1 (MQ=255) cTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaacccgctcctacgataggcccaggccgcccacacgaactcgaaggacagaaccatgttcgactacaccgccc < 1:558660‑M2/150‑74 (MQ=255) aTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACt > 1:487775/1‑150 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaac > 1:584268‑M2/1‑71 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGaac < 2:584268‑M2/74‑4 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGACGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGCGCCCGGTCATCGGTCTGTGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTgc > 2:17712/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTcacccgcgaatgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgcgggtaaacccgctcctacgataggcccaggccgcccacacgaactcgaaggacagaaccatgttcgactacaccgcccgccccggcctt > 2:470201‑M1/1‑7 (MQ=255) gggTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGtt > 2:295819/1‑109 (MQ=255) gggTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGtt < 1:295819/109‑1 (MQ=255) gTTcacccgcgaatgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgcgggtaaacccgctccta > 1:584268‑M1/1‑3 (MQ=255) gTTcacccgcgaatgcgccagcccggacaaccctggcgcctgatcggacgcattcgcgggtaaacccgctccta < 2:584268‑M1/74‑72 (MQ=255) | CTTGGCAGCCGCGGCACCAATGCCACGGCCGGCACCGGTAACCAGGATGACCCGGCCTTGCAGCAGGTCGGGGCGGGCGGTGTAGTCGAACATGGTTCTGTCCTTCGAGTTCGTGTGGGCGGCCTGGGCCTATCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCCGATCAGGCGCCAGGGTTGTCCGGGCTGGCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAAAGGGCGGTGCCCGGTCATCGGTCTGGGTTCAGCACCCGCACAGCGCGCTGTCGATCACTTTGCGCAGT > NC_002947/1967940‑1968229 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |