New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3464300 = | 23 (1.000) | 6 (0.320) | 5/202 | NT | 24.2% | coding (101/1929 nt) | PP_3078 | ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | 3464387 = | 19 (1.020) | coding (14/1929 nt) | PP_3078 | ABC transporter substrate‑binding protein |
GTGGGAGCGGCCTGGACCGTAAAGCCTATGCACGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGGTGTCGAATTCCTTGACCATCTGGCCTG > NC_002947/3464243‑3464535 | ctgctggaagtgaccagccgccaggactgattcacccctcccggtgatcagccccccTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAgggggg > 1:159648‑M1/58‑150 (MQ=255) gggAGCGGCCTGGACCGTAAAGCCTATGCACAAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCt < 1:283064/150‑1 (MQ=255) ggAGGGGCCGGGGCCGTAAAGCCTATGCACGAAAATACAAGCCACCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTg > 2:583360/1‑150 (MQ=255) gCCGGGACCGTAAAGCCTATGCACGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCAcc < 2:369384/150‑1 (MQ=255) caTGCACGAAAATCAAAGACCCCAGCATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAAGGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGt < 2:22759/149‑1 (MQ=38) aCGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCgg > 2:585258/1‑130 (MQ=255) aCGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCgg < 1:585258/130‑1 (MQ=255) aCAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGt < 1:197302/150‑1 (MQ=255) ccccACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCg < 2:439699/115‑1 (MQ=255) ccccACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCg > 1:439699/1‑115 (MQ=255) cccccctgtgggagcgggtttacccgcgaagaggccagaccagacaacctcgttgcctgctccgacgcattcgcgggtaaacccgctcccacaGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCcagcag > 1:159648‑M2/94‑150 (MQ=255) aTACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAgg < 2:240019/150‑1 (MQ=255) tACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGTTCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAggt < 1:506567/150‑1 (MQ=255) GGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCg < 1:30336‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGGGTTTCCCCGAGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACTGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAAc > 2:161698‑M1/1‑150 (MQ=255) gtttacccgcgaagaggccagaccagacaacctcgttgcctgctccgacgcattcgcgggtaaacccgctcccacaGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTggg > 1:396325‑M2/77‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggccagaccagacaacctcgttgcctgctccgacgcattcgcgggtaaacccgctcccacaGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCa > 1:181899‑M2/71‑150 (MQ=255) CCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCa < 2:410440‑M1/150‑1 (MQ=255) CGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAAGGAGGTTGTCTGGTCTGGGCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCAc > 2:410148‑M1/1‑150 (MQ=255) GAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCgg > 1:410440‑M1/1‑150 (MQ=255) ATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTATGCCTATATACCCGCTCCCACAGGGGGGCCGATCTCTGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGc > 1:599076‑M1/1‑150 (MQ=255) gTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGaa < 2:496845/87‑1 (MQ=255) gTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGaa > 1:496845/1‑87 (MQ=255) gTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTg > 2:566876/1‑150 (MQ=255) ccagacaacctcgttgcctgctccgacgcattcgcgggtaaacccgctcccacaGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGgt < 2:396325‑M2/96‑1 (MQ=255) aGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAAc > 1:281277/1‑122 (MQ=255) aGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAAc < 2:281277/122‑1 (MQ=255) ggCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTCCGCTGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGtt < 1:528967/150‑1 (MQ=255) gacaacctcgttgcctgctccgacgcattcgcgggtaaacccgctcccacaGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACCGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGtt < 2:159648‑M2/99‑1 (MQ=255) accaacctcgttgcctgctccgacgcattcgcgggtaaaccctctcccacaGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGtt < 2:181899‑M2/99‑1 (MQ=255) gTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTgc > 1:58217/1‑150 (MQ=255) tggtctggCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACAGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGaa > 2:580493/1‑150 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCg > 2:308109/1‑133 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCg < 1:308109/133‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGgtg > 2:159167/1‑150 (MQ=255) tcccacaGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGGTGTCGAATTCCTTGACCATCt > 2:47085‑M2/8‑150 (MQ=255) ccacaGGGGGGCTCATCCCCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACCTCCAGCAGGTGGCAGCCGAACTGGGTCTTCCCCGGGCCTTGCACGGGGGTGCCCGGTACGCTTAAGAGCACGGTGTCGAATTCCTTGACGATCTgg > 1:166368‑M2/6‑150 (MQ=255) cacaGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGGTGTCGAATTCCTTGACCATCTGGc > 2:611315‑M2/5‑150 (MQ=255) caGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGGTGTCGAATTCCTTGACCATCTGGCCt < 1:47085‑M2/148‑1 (MQ=255) aGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGGTGTCGAATTCCTTGACCATCTGGCCTg < 1:611315‑M2/149‑1 (MQ=255) | GTGGGAGCGGCCTGGACCGTAAAGCCTATGCACGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGGTGTCGAATTCCTTGACCATCTGGCCTG > NC_002947/3464243‑3464535 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |