New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4667658 = | 38 (1.640) | 4 (0.180) | 4/242 | NT | 10.7% | coding (1378/1854 nt) | nuoL | NADH‑quinone oxidoreductase subunit L |
? | NC_002947 | 4667708 = | 30 (1.340) | coding (1428/1854 nt) | nuoL | NADH‑quinone oxidoreductase subunit L |
CTCGCTGTACACCTTCCGCCTGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTC > NC_002947/4667561‑4667855 | cTCGCTGTACACCTTCCGCCTGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCt < 1:549233/150‑1 (MQ=255) tCGCTGTACACCTTCCGCCTGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCACGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGAGCGTGATGGTCGTGATGTCGACGTTCCTCGTCGCCTGGATCACCCCGCCGCTg < 1:539429/150‑1 (MQ=255) cTTCCGCCTGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGtgct < 2:336365/150‑1 (MQ=255) cGCCTGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCg < 1:560702/150‑1 (MQ=255) tGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGaaa < 1:130945/150‑1 (MQ=255) tGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGaaa < 1:406229/150‑1 (MQ=255) cATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCgg > 1:339338/1‑150 (MQ=255) aTCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGc > 1:298463/1‑150 (MQ=255) aCGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTg < 1:342541/150‑1 (MQ=255) gCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGcc < 2:339338/150‑1 (MQ=255) cAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCaa > 2:595585/1‑150 (MQ=255) aGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGAGTTTCGTCGGCGCATGGATCACCCCACCACTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGAGCTGGCCATGCCGGTTGAGAAGGCAAgg > 1:28841/1‑149 (MQ=255) gCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCt > 1:591178/1‑150 (MQ=255) ccACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTc > 1:399901/1‑150 (MQ=255) cACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCg > 2:354128/1‑150 (MQ=255) cATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTgc > 2:174539/1‑150 (MQ=255) aTCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGcc > 1:51081/1‑99 (MQ=255) aTCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGcc < 2:51081/99‑1 (MQ=255) gCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTgccatcg < 1:60406/150‑1 (MQ=255) gCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTgccatcg > 1:223231/1‑150 (MQ=255) gCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGga < 1:458541/123‑1 (MQ=255) gCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGga > 2:458541/1‑123 (MQ=255) tGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCaa < 2:189286/109‑1 (MQ=255) tGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCaa > 1:189286/1‑109 (MQ=255) gGTGCTGACCGGGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCctgct > 2:223231‑M1/2‑150 (MQ=255) CGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCctgct > 1:595585‑M1/1‑150 (MQ=255) ggggtgatccaggcgccgacgaaagtcgacagcacgatcagcacgccGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCctgctg > 1:33549‑M2/48‑150 (MQ=255) atccaggcgccgacgaaagtcgacagcacgatcagcacgccGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTg > 1:613321‑M2/42‑102 (MQ=255) atccaggcgccgacgaaagtcgacagcacgatcagcacgccGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTg < 2:613321‑M2/61‑1 (MQ=255) tCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTc > 1:98111/1‑150 (MQ=255) aCTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGgt < 1:556261/39‑1 (MQ=255) aCTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGgt > 2:556261/1‑39 (MQ=255) cTTTCGTCGGCGCCTGGCCCACCCCGCCTCTCGCCGGTGCGCTTCCTGCCCGCGCCGGCCACTCCCGTGGCGACGCCAAGCACGCGCTGGAGAGCACCTCCGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCCCCCTCCTTTTCCttg < 2:28841/150‑3 (MQ=255) tttCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTgcca < 2:453225/107‑1 (MQ=255) tttCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTgcca > 1:453225/1‑107 (MQ=255) gaaagtcgacagcacgatcagcacgccGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTggg < 2:33549‑M2/123‑1 (MQ=255) ggCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGTCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGAGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAgcgc < 2:108963/150‑1 (MQ=255) cTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCtt > 2:99978/1‑150 (MQ=255) ccGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGATGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTc < 1:354128‑M2/148‑1 (MQ=255) | CTCGCTGTACACCTTCCGCCTGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTC > NC_002947/4667561‑4667855 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |