| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3911640 = | 0 (0.000) | 249 (1.190) | 114/256 | 0.2 | 100% | intergenic (+66/‑59) | PP_3451/PP_3452 | hypothetical protein/GGDEF domain‑containing protein |
| ? | NC_002947 | 5218946 = | NA (NA) | intergenic (+46/‑203) | PP_4598/PP_4599 | membrane protein/transposase | |||||
Only 100 of 847 total aligned reads displayed.
AGGGTGGGTAGCGGGTGCCATGCCGAGGCAGTGTTTGCCTTGCGCTACCGGCCCTGGGCCCGGGGTATCTTGCCACAGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAGTAGTAGCCTCAGGAGCCCACCGATGTTCAAGACCATCGAAGCCCACATACGCCAGCAGGTCGCGCCCGCCGCCCTGCGCGCCGAGTTCCGCCAGCACGAATTCGAGTCCATGC > NC_002947/3911491‑3911789 | cttgcttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaa > 2:1360160‑M1/150‑150 (MQ=255) ttgcttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAg < 2:3364147‑M1/2‑1 (MQ=255) cttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCgg > 1:4875105‑M1/146‑150 (MQ=255) cttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCgg > 2:3495246‑M1/146‑150 (MQ=255) cttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCgg > 1:5049855‑M1/146‑150 (MQ=255) cttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggcccccctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCgg > 1:1239222‑M1/146‑150 (MQ=255) ttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCggg > 2:4697550‑M1/145‑150 (MQ=255) ttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCggg < 2:274882‑M1/6‑1 (MQ=255) ttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCgg < 1:4471955‑M1/5‑1 (MQ=255) ttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCgg > 2:4471955‑M1/145‑149 (MQ=255) ttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgtagaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggacctactcctcccttcaagtcctaccatacaAGCggg < 2:681456‑M1/6‑1 (MQ=255) tctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGt < 1:2890377‑M1/7‑1 (MQ=255) ctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGtt < 1:1172380‑M1/8‑1 (MQ=255) ctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttataggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccataaaAGCGGGtt < 1:4963723‑M1/8‑1 (MQ=255) tattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGttt > 2:1196224‑M1/142‑150 (MQ=255) ttgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTAc > 1:665514‑M1/140‑150 (MQ=255) ttgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTAc < 2:141601‑M1/11‑1 (MQ=255) gggTGCCATGCCGAGACAGTGTTTGCCTTGCGCTACCGGCCCTGGGCCCGGGGTATCTTGCCACAGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggcc < 1:2192049‑M2/150‑12 (MQ=255) tcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCcg < 2:1619946‑M1/14‑1 (MQ=255) tcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCcg < 1:3748786‑M1/14‑1 (MQ=255) tGCCATGCCGAGGCAGTGTTTGCCTTGCGCTACCGGCCCTGGGCCCGGGGTATCTTGCCACAGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccgga < 2:2289068‑M2/150‑15 (MQ=255) tGCCATGCCGAGGCAGTGTTTGCCTTGCGCTACCGGCCCTGGGCCCGGGGTATCTTGCCACAGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccgga > 1:140450‑M2/1‑136 (MQ=255) gcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCcgcg < 1:1795264‑M1/16‑1 (MQ=255) ttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGaa > 1:4365078‑M1/133‑150 (MQ=255) ttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGaa > 2:1978569‑M1/133‑150 (MQ=255) ttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGaa > 2:3259850‑M1/133‑150 (MQ=255) gctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAg < 2:1106552‑M1/20‑1 (MQ=255) gctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAg < 2:1741125‑M1/20‑1 (MQ=255) aTGCCGAGGCAGTGTTTGCCTTGCGCTACCGGCCCTGGGCCCGGGGTATCTTGCCACAGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggca < 2:3986759‑M2/150‑19 (MQ=255) tcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTAccc < 1:3134725‑M1/13‑1 (MQ=255) tcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGt < 2:4218931‑M1/22‑1 (MQ=255) gaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggtgtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCaa > 1:1439974‑M1/125‑150 (MQ=255) gCAGTGTTTGCCTTGCGCTACCGGCCCTGGGCCCGGGGTATCTTGCCACAGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttca > 1:1004614‑M2/1‑124 (MQ=255) gCAGTGTTTGCCTTGCGCTACCGGCCCTGGGCCCGGGGTATCTTGCCACAGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttca > 1:2696622‑M2/1‑124 (MQ=255) gCAGTGTTTGCCTTGCGCTACCGGCCCTGGGCCCGGGGTATCTTGCCACAGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttca > 2:880358‑M2/1‑124 (MQ=255) gcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGcc > 2:1843410‑M1/122‑150 (MQ=255) cattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCt > 1:3844981‑M1/121‑150 (MQ=255) ttccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCgg < 1:3529276‑M1/5‑1 (MQ=255) tccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCGGaa < 1:347407‑M1/33‑1 (MQ=255) gtTTGCCTTGCGCTACCGGCCCTGGGCCCGGGGTATCTTGCCACAGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaa < 2:4298414‑M2/150‑32 (MQ=255) tttGCCTTGCGCTACCGGCCCTGGGCCCGGGGTATCTTGCCACAGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaa < 2:776882‑M2/150‑33 (MQ=255) ttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTc > 1:2769205‑M1/115‑137 (MQ=255) tatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAag < 2:2989391‑M1/37‑1 (MQ=255) tatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAag < 2:5278833‑M1/37‑1 (MQ=255) ccTTGCGCTACCGGCCCTGGGCCCGGGGTATCTTGCCACAGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgc < 1:2458965‑M2/150‑37 (MQ=255) tcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAagta > 1:1566372‑M1/112‑150 (MQ=255) tcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAagta > 2:25131‑M1/112‑150 (MQ=255) cTTGCGCTACCGGCCCTGGGCCCGGGGTATCTTGCCACAGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgcc < 1:132730‑M2/150‑38 (MQ=255) cgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAGtagtag > 1:3287518‑M1/108‑150 (MQ=255) ttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAgtagta > 1:3228990‑M1/105‑146 (MQ=255) gggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAGTAGTAGCCTCa < 2:389148‑M1/48‑1 (MQ=255) ggCCCTGGGCCCGGGGTATCTTGCCACAGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctc < 1:2348874‑M2/150‑49 (MQ=255) tGGGCCCGGGGTATCTTGCCACAGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagc > 2:2197917‑M2/1‑97 (MQ=255) gaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAagta < 1:2030178‑M1/39‑1 (MQ=255) ggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGc > 1:2277072‑M1/86‑113 (MQ=255) ggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAGTAGTAGCCTCAGGAGCCCACCGATGTTCaa > 2:2679141‑M1/84‑150 (MQ=255) tCTTGCCACAGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtac > 2:5198895‑M2/1‑84 (MQ=255) tCTTGCCACAGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtac > 1:4014345‑M2/1‑84 (MQ=255) gtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAGTAGTAGCCTCAGGAGCCCACCGAt < 1:4293735‑M1/61‑1 (MQ=255) gtgatttctactacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTAc < 2:4558655‑M1/11‑1 (MQ=255) tgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAGTAGTAGCCTCAGGAGCCCACCGATGTTCAAGa < 2:2945490‑M1/69‑1 (MQ=255) tgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAGTAGTAGCCTCAGGAGCCCACCGATGTTCAAGa > 1:4188744‑M1/82‑150 (MQ=255) ttGCCACAGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacga > 2:3771000‑M2/1‑82 (MQ=255) tGCCACAGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgag > 1:4678514‑M2/1‑81 (MQ=255) gCCACAGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagt < 2:2052897‑M2/150‑71 (MQ=255) ttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAGTAGTAGCCTCAGGAGCCCACCGATGTTCAAGACCAt < 1:5170481‑M1/73‑1 (MQ=255) cacaGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtca < 1:4092072‑M2/150‑73 (MQ=255) cacaGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtca > 2:3065627‑M2/1‑78 (MQ=255) tacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTa < 1:3918420‑M1/10‑1 (MQ=255) aaTGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtcagcgtgc > 2:3162055‑M2/1‑72 (MQ=255) aaTGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtcagcgtgc < 1:1717800‑M2/150‑79 (MQ=255) aaTGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtcagcgtgc < 1:4512142‑M2/150‑79 (MQ=255) tactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAGTAGTAGCCTCAGGAGCCCACCGATGTTCAAGACCATCGAAGCCCACATACg < 2:3211425‑M1/88‑1 (MQ=255) actgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAGTAGTAGCCTCAGGAGCCCACCGATGTTCAAGACCATCGAAGCCCACATACGc > 2:5120450‑M1/62‑150 (MQ=255) cgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccaaacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAgtagta > 2:2416974‑M1/58‑99 (MQ=255) gccTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtcagcgtgccagagaatttctccccag < 2:4095809‑M2/150‑97 (MQ=255) acagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAGTAGTAGCCTCAGGAGCCCACCGATGTTCAAGACCATCGAAGCCCACATACGCCAGCAGGTc > 1:4795611‑M1/53‑150 (MQ=255) tctTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtcagcgtgccagagaatttctccccagcat < 2:3409833‑M2/150‑100 (MQ=255) gcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGa > 2:643726‑M1/43‑59 (MQ=255) tatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAGTAGTAGCCTCAGGAGCCCACCGATGTTCAAGACCATCGAAGCCCACATACGCCAGCAGGTCGCGCCCGCCGCCCTgc > 1:524402‑M1/37‑150 (MQ=255) aCCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtcagcgtgccagagaatttctccccagcattggatactgcccg < 1:3037083‑M2/150‑113 (MQ=255) tggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAGTAGTAGCCTCAGGAGCCCACCGATGTTCAAGACCATCGAAGCCCACATACGCCAGCAGGTCGCGCCCGCCGCCCTgcgc > 1:861840‑M1/35‑150 (MQ=255) cctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAGTAGTAGCCTCAGGAGCCCACCGATGTTCAAGACCATCGAAGCCCACATACGCCAGCAGGTCGCGCCCGCCGCCCTGCGCGCCg < 1:1110354‑M1/120‑1 (MQ=255) ggTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtcagcgtgccagagaatttctccccagcattggatactgcccgtcagttt > 2:3650204‑M2/1‑31 (MQ=255) tCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtcagcgtgccagagaatttctccccagcattggatactgcccgtcagtttgg > 2:4345126‑M2/1‑29 (MQ=255) tCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtcagcgtgccagagaatttctccccagcattggatactgcccgtcagtttgg > 1:562602‑M2/1‑29 (MQ=255) ccccACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtcagcgtgccagagaatttctccccagcattggatactgcccgtcagtttgggc < 1:4598851‑M2/150‑124 (MQ=255) cctcccttcaagtcctaccctacaCGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAGTAGTAGCCTCAGGAGCCCACCGATGTTCAAGACCATCGAAGCCCACCTACGCCAGCAGGTCGCGCCCGCCGCCCTGCGCGCCGAGTTcc > 2:1035344‑M1/25‑150 (MQ=255) ccACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtcagcgtgccagagaatttctccccagcattggatactgcccgtcagtttgggcgg < 2:4952066‑M2/150‑126 (MQ=255) tcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAGTAGTAGCCTCAGGAGCCCACCGATGTTCAAGAcc > 2:1520589‑M1/23‑93 (MQ=255) tcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAGTAGTAGCCTCAGGAGCCCACCGATGTTCAAGACCATCGAAGCCCACATACGCCAGCAGGTCGCGCCCGCCGCCCTGCGCGCCGAGTTCCGc < 1:3639198‑M1/128‑1 (MQ=255) cGTACGGTCCCTGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtcagcgtgccagagaatttctccccagcattggatactgcccgtcagtttgggcgggctgcg < 1:1913605‑M2/150‑132 (MQ=255) accatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAGTAGTAGCCTCAGGAGCCCACCGATGTTCAAGACCATCGAAGCCCACATACGCCAGCAGGTCGCGCCCGCCGCCCTGCGCGCCGAGTTCCGCCAGCACGAATTCGa > 1:2090938‑M1/9‑150 (MQ=255) tGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtcagcgtgccagagaatttctccccagcattggatactgcccgtcagtttgggcgggctgcgttgcagcccca > 2:3546141‑M2/1‑8 (MQ=255) tGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtcagcgtgccagagaatttctccccagcattggatactgcccgtcagtttgggcgggctgcaacgcagcccgc > 2:2861326‑M2/1‑8 (MQ=255) atacaAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAGTAGTAGCCTCAGGAGCCCACCGATGTTCAAGACCATCGAAGCCCACATACGCCAGCAGGTCGCGCCCGCCGCCCTGCGCGCCGAGTTCCGCCAGCACGAATTCGAGTc < 2:1248367‑M1/145‑1 (MQ=255) tAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtcagcgtgccagagaatttctccccagcattggatactgcccgtcagtttgggcgggctgcgttgcagccccagc < 2:4882706‑M2/150‑145 (MQ=255) tAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtac < 2:4148649‑M2/72‑67 (MQ=255) ggAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtcagcgtgccagagaatttctccccagcattggatactgcccgtcagtttgggcgggctgcgttgcagccccagcct < 1:2646305‑M2/150‑147 (MQ=255) ggAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggtacgagtcagcgtgccagagaatttctccccagcattggatactgcccgtcagtttgggcgggctgcgttgcagccccagcct < 1:3393377‑M2/150‑147 (MQ=255) | AGGGTGGGTAGCGGGTGCCATGCCGAGGCAGTGTTTGCCTTGCGCTACCGGCCCTGGGCCCGGGGTATCTTGCCACAGCAATGAATTACCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGATAAACCCACAGGTCCCCCACACCGTACGGTCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGTCCAAGCCTGAAAAAGTAGTAGCCTCAGGAGCCCACCGATGTTCAAGACCATCGAAGCCCACATACGCCAGCAGGTCGCGCCCGCCGCCCTGCGCGCCGAGTTCCGCCAGCACGAATTCGAGTCCATGC > NC_002947/3911491‑3911789 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |