New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1002378 = | 38 (1.630) | 3 (0.130) | 3/244 | NT | 8.8% | coding (612/1164 nt) | speC | ornithine decarboxylase |
? | NC_002947 | 1002468 = | 26 (1.160) | coding (522/1164 nt) | speC | ornithine decarboxylase |
GTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCAGTGGTGGAGCCTTCAGTCAGAATACGCACATACACTTTCGAGCCCGGTGCGGCCTTGGCGATGTTGCGCAG > NC_002947/1002321‑1002611 | gTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTcgcg < 2:555482/150‑1 (MQ=255) cccgcaagttcggctgccagaccgacatggccatggacctgctgatcctcgcccgcGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCgg > 2:452788‑M1/57‑150 (MQ=255) tCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGa > 1:490288/1‑150 (MQ=255) tCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGa < 1:397107/150‑1 (MQ=255) cGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGt > 2:348078/1‑150 (MQ=255) ccgacatggccatggacctgctgatcctcgcccgcGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATg > 1:97068‑M1/36‑150 (MQ=255) ccGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATg > 1:189534/1‑150 (MQ=255) catggacctgctgatcctcgcccgcgacctgggcctggtgccatacggcatctccttccacgtgggctcgcagcaacgcgacatcagcgtgtgggacgccgccatcgccaaggtcGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCgg > 1:97068‑M2/116‑150 (MQ=255) tCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCAt > 1:419898/1‑134 (MQ=255) tCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGACGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCag < 2:419898/134‑2 (MQ=255) ttACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTca > 1:409172/1‑134 (MQ=255) ttACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTca < 2:409172/135‑2 (MQ=255) tACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCg > 2:271906/1‑150 (MQ=255) ccgcgacctgggcctggtgccatacggcatctccttccacgtgggctcgcagcaacgcgacatcagcgtgtgggacgccgccatcgccaaggtcGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCggg > 2:452788‑M2/95‑150 (MQ=255) tgggcctggtgccatacggcatctccttccacgtgggctcgcagcaacgcgacatcagcgtgtgggacgccgccatcgccaaggtcGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGc < 1:452788‑M2/64‑1 (MQ=255) gcggcgTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCa < 2:159/150‑1 (MQ=255) ccACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGAGAGAGTATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCAGtggtggg > 1:380770/1‑149 (MQ=255) gCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCAGTGGTGGAGCCTtc < 1:271906/150‑1 (MQ=255) cTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCAGTGGTGGAGCCTtca < 2:465517/150‑1 (MQ=255) gcgTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCAGTGGTGGAGCCTTCAGTCAGAAt > 2:269846/1‑150 (MQ=255) ccACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCATGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCAGTGGTGGAGCCTTCAGTCAGAATACGCACATa > 2:332551/1‑145 (MQ=255) ccACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCATGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCAGTGGTGGAGCCTTCAGTCAGAATACGCACATa < 1:332551/145‑1 (MQ=255) aCGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCAGTGGTGGAGCCTTCAGTCAGAATACGCACATACACTTTc < 1:527000/150‑1 (MQ=255) ggAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCAGTGGTGGAGCCTTCAGTCAGAATACGCACATACACTTTc < 1:418429/142‑1 (MQ=255) ggAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCAGTGGTGGAGCCTTCAGTCAGAATACGCACATACACTTTc > 2:418429/1‑142 (MQ=255) ggAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCAGTGGTGGAGCCTTCAGTCAGAATACGCACATACACTTTCGAGCCCgg > 1:23886/1‑150 (MQ=255) gCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGGTGGACAGTGGCCAGTCGGCAGTGGTGGAGCATTCAGTGAGAAGACGCACATACACTTTCGAGCCCGGTGCGGc > 1:347274/1‑150 (MQ=255) gCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCAGTGGTGGAGCCTTCAGTCAGAATACGCACATACACTTTCGAGCCCGGTGCGGc > 1:284054/1‑150 (MQ=255) ccGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCAGTGGTGGAGCCTTCAGTCAGAATACGCACATACACTTTCGAGCCCGGTGCGGcc < 2:284054/150‑1 (MQ=255) cGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCAGTGGTGGAGCCTTCAGTCAGAATACGCACATACACTTTCGAGCCCGGTGCGGCCt > 1:253014/1‑150 (MQ=255) aTGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCAGTGGTGGAGCCTTCAGTCAGAATACGCACATACACTTTCGAGCCCGGTGCGGCCTTgg < 1:348078/150‑1 (MQ=255) aCCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCAGTGGTGGAGCCTTCAGTCAGAATACGCACATACACTTTCGAGCCCGGTGCGGCCTTGGCGATg > 1:501365/1‑150 (MQ=255) cAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCAGTGGTGGAGCCTTCAGTCAGAATACGCACATACACTTTCGAGCCCGGTGCGGCCTTGGCGATGTTGCGCAg < 2:380770/150‑1 (MQ=255) aggtcGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCAGTGGTGGAGCCTTCAGTCAGAATACGCACATACACTTTCGAGCCCGGTGCGGCCTTg < 1:169591‑M2/130‑1 (MQ=255) aggtcGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCAGTGGTGGAGCCTTCAGTCAGAATACGCACATACACTTTCGAGCCCGGTGCGGCCTTg > 2:169591‑M2/6‑135 (MQ=255) | GTTGATCAGCTTCAGTTCGATGCCGTCTTCTTCTTTCAGACGTTCGAAGATTACCTTGACCTTGGCGATGGCGGCGTCCCACACGCTGATGTCGCGTTGCTGCGAGCCCACGTGGAAGGAGATGCCGTATGGCACCAGGCCCAGGTCGCGGGCGAGGATCAGCAGGTCCATGGCCATGTCGGTCTGGCAGCCGAACTTGCGGGACAGTGGCCAGTCGGCAGTGGTGGAGCCTTCAGTCAGAATACGCACATACACTTTCGAGCCCGGTGCGGCCTTGGCGATGTTGCGCAG > NC_002947/1002321‑1002611 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |