New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3522745 = | 19 (0.820) | 8 (0.390) | 4/224 | NT | 29.8% | intergenic (+489/‑208) | PP_5584/PP_3113 | hypothetical protein/transposase |
? | NC_002947 | 3522832 = | 21 (1.020) | intergenic (+576/‑121) | PP_5584/PP_3113 | hypothetical protein/transposase |
CGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCTTACCTGATCCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCTCGCCGACCATGATGCGACCCGACGCCAAAGTCGAAA > NC_002947/3522694‑3522980 | cGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCcagcag < 2:257049/150‑1 (MQ=255) gTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGgc > 2:398177/1‑150 (MQ=255) gTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGc < 1:398177/150‑1 (MQ=255) gCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCt < 1:514751/150‑1 (MQ=255) ccAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACGTGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTg > 2:410408/1‑150 (MQ=255) accaGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTaa > 1:429493/1‑150 (MQ=255) ccaGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAg < 1:420139/150‑1 (MQ=255) caGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAgc > 1:115147/1‑150 (MQ=255) acaTGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTTGCTCGTAAGCGCTc > 2:492176/1‑150 (MQ=255) cAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAAc < 1:96612/150‑1 (MQ=255) cAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAACCGCTTTTCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAAc < 2:570139/150‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAAc > 2:530307/1‑149 (MQ=255) aaaGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAAc < 1:530307/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCcaca < 2:159598/150‑1 (MQ=255) ccaggcccatggcatcggcatgtgcgtggtgaccaacgcaccgcggctgaacgccgagcacatgccgatgccatgggcctgggcATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCca < 2:451965‑M2/57‑1 (MQ=255) ccaggcccatggcatcggcatgtgcgtggtgaccaacgcaccgcggctgaacgccgagcacatgccgatgccatgggcctgggcATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCca > 1:451965‑M2/85‑141 (MQ=255) GCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAgcgc < 1:130441‑M1/150‑1 (MQ=255) ccatggcatcggcatgtgcgtggtgaccaacgcaccgcggctgaacgccgagcacatgctgaacgccatgggcctgggcATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGc > 1:611182‑M2/80‑113 (MQ=255) ccatggcatcggcatgtgcgtggtgaccaacgcaccgcggctgaacgccgagcacatgctgaacgccatgggcctgggcATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGc < 2:611182‑M2/34‑1 (MQ=255) CCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCtt > 1:492176‑M1/1‑150 (MQ=255) gcatcggcatgtgcgtggtgaccaacgcaccgcggctgaacgccgagcacatgctgaacgccatgggcctgggcATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCaaa > 1:94489‑M2/75‑139 (MQ=255) gcatcggcatgtgcgtggtgaccaacgcaccgcggctgaacgccgagcacatgctgaacgccatgggcctgggcATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCaaa < 2:94489‑M2/65‑1 (MQ=255) atgtgcgtggtgaccaacgcaccgcggctgaacgccgagcacatgccgatgccatgggcctgggcATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAAc > 2:299326‑M2/66‑118 (MQ=255) atgtgcgtggtgaccaacgcaccgcggctgaacgccgagcacatgccgatgccatgggcctgggcATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAAc < 1:299326‑M2/53‑1 (MQ=255) tCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCTTACCTGATCCCCGATGCtgtg > 1:531989/1‑150 (MQ=255) cGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCTTACCTGATCCCCGATGCTGTGCTcc < 2:495334/150‑1 (MQ=255) ggTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCTTACCTGATCCCCGATGCTGTGCTCCCGAtttctttc > 2:178930/1‑150 (MQ=255) cacGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTg < 2:95051/62‑1 (MQ=255) cacGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTg > 1:95051/1‑62 (MQ=255) acaTGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCTTACCTGATCCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCTCGCCGACCatga < 2:531989/150‑1 (MQ=255) aTGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCTTACCTGATCCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCTCGCCGACCatgatg < 1:410408/150‑1 (MQ=255) aTGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCTTACCTGATCCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCTCGCCGACCATGATGTGAccc < 1:178930/150‑1 (MQ=255) gcATGCTCCAGCAGGCGCATCAGGCCTAGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCTTACCTGATCCCCGATGCTGTGCGCCCGATTTCTTTCTGGAGCTCGCCGACCATGATGCACCCCgacgccaaaaaagaa > 2:460497‑M2/3‑144 (MQ=255) cATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCTTACCTGATCCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCTCGCCGACCATGATGCGACCCGACGCCAAAGTCGaaa > 1:218775‑M2/2‑150 (MQ=255) | CGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCTTACCTGATCCCCGATGCTGTGCTCCCGATTTCTTTCTGGAGCTCGCCGACCATGATGCGACCCGACGCCAAAGTCGAAA > NC_002947/3522694‑3522980 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |