New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5856874 | 28 (1.200) | 3 (0.130) | 3/244 | NT | 10.4% | coding (745/1392 nt) | PP_5133 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 5856913 | 25 (1.120) | coding (784/1392 nt) | PP_5133 | membrane protein |
GCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAACGCCTGACGCTGGACCTGGGCCTGCCCGGCTACGCGCAACTGCGCGAGGCACTGATG > NC_002947/5856765‑5857059 | gCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTAGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTg > 1:296817‑M2/1‑149 (MQ=255) cTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTgg > 1:275466‑M2/1‑148 (MQ=255) aCCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCg > 1:34458/1‑150 (MQ=255) ttcattcaCCTGACCCAAGTACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCGGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCgtggtg < 1:230045/150‑1 (MQ=255) ttcattcaCCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCgtggtg > 2:233493/1‑150 (MQ=255) attcaCCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTg > 2:501871/1‑150 (MQ=255) tcaCCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGt < 1:233493/150‑1 (MQ=255) tcaCCTGACCCAAGCACGGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTAGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGt > 2:315241/1‑150 (MQ=255) aCCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGtat < 1:427876/150‑1 (MQ=255) aaGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCctgc > 2:414983/1‑150 (MQ=255) tGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGcccc > 2:386809/1‑150 (MQ=255) tCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCctgctgc > 1:7888/1‑150 (MQ=255) ccGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCctgctgctg > 1:22567/1‑150 (MQ=255) ttGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCggg > 1:399179/1‑150 (MQ=255) gCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGcc > 2:95316/1‑150 (MQ=255) cTTCGTCGGGCACGGCGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCt > 2:287214/1‑150 (MQ=255) ccGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGtggc > 2:387017/1‑150 (MQ=255) gacgaAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGtggcgctggcgc < 1:464840/150‑1 (MQ=255) ccATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGcc < 2:359766/150‑1 (MQ=255) gcggcgACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAACGCCTGACGc > 1:35715/1‑150 (MQ=255) gACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTggctgtcgccgctggcgcggatcatggcttcgtcgggcacggcgaagcccagcaacgacgggagggcgcccagtgcttgggtcaggtgaatgaacgggtcggcg < 1:148495‑M2/150‑105 (MQ=255) aCAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTggctgtcgccgctggcgcggatcatggcttcgtcgggcacggcgaagcccagcaacgacgggagggcgcccagtgcttgggtcaggtgaatgaacgggtcggcgg < 1:517782‑M2/150‑106 (MQ=255) cAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAACGCCTGACGCTGGACCt < 1:158789/150‑1 (MQ=255) aGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAACGCCTGACGCTGGACCTg < 2:22567/150‑1 (MQ=255) aGCCTACCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTggctgtcgccgctggcgcggatcatggcttcgtcgggcacggcgaagcccagcaacgacgggagggcgcccagtgcttgggtcaggtgaatgaacgggtcggaggcg < 1:290097‑M2/150‑108 (MQ=255) cccTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGCGAACGCATGAAGCGGGACCTGGGCCTGCCCg > 1:31890/1‑150 (MQ=255) cAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAACGCCTGACGCTGGACCTGGGCCTGCCCGGCTACGCGCAACTgcgc < 1:402215/150‑1 (MQ=255) gggCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGACCGCCTGACGCTGGACCTGGGCCTGCCCGGCTACGCGCAGTTGcgcgtagccg < 2:7888/150‑7 (MQ=255) ggCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAACGCCTGACGCTGGACCTGGGCCTGCCCGGCTACGCGCAACTGCGCGAGGccgg < 1:95316/150‑4 (MQ=255) ccAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAACGCCTGACGCTGGACCTGGGCCTGCCCGGCTACGCGCAACTGCGCGAGGCACTGa < 2:237600/150‑1 (MQ=255) cAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAACGCCTGACGCTGGACCTGGGCCTGCCCGGCTACGCGCAACTGCGCGAGGCACTGAt < 1:386809/150‑1 (MQ=255) aGCTggctgtcgccgctggcgcggatcatggcttcgtcgggcacggcgaagcccagcaacgacgggagggcgcccagtgcttgggtcaggtgaatgaacgggtcggaggcgagcaaggtggtttcccagacaaagccatagcgccgggtc > 2:290097‑M2/1‑4 (MQ=255) aGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAACGCCTGACGCTGGACCTGGGCCTGCCCGGCTACGCGCAACTGCGCGAGGCACTGATg > 2:40087/1‑150 (MQ=255) | GCTCGCCGCCGACCCGTTCATTCACCTGACCCAAGCACTGGGCGCCCTCCCGTCGTTGCTGGGCTTCGCCGTGCCCGACGAAGCCATGATCCGCGCCAGCGGCGACAGCCTGCCAGCCCTGGACGTGGCCCGCCAGGCCTGGGCCAGCTGGCTGCTCGGCGTGGTGCTGGTATACGGCCTGCTGCCCCGCCTGCTGCTGGCCGGGTTATGCCTGTGGCGCTGGCGCCAGGGCCGTGAACGCCTGACGCTGGACCTGGGCCTGCCCGGCTACGCGCAACTGCGCGAGGCACTGATG > NC_002947/5856765‑5857059 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |