New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 75100 = | 132 (1.470) | coding (1110/1374 nt) | trkA | TrK potassium transporter NAD‑binding protein |
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
ATTCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGT > NC_002947/74925‑75221 | gcaggcaaggtgatgaccatcatcaacaacccggcttatgtcgacctggtacagggtggcgatatcgacattgccatcagcccgcagctcgccaccatcggcacactgctggcgcacgtccgtcgtggcgacatcgtcagtgtgcacTCg < 2:29308‑M1/3‑1 (MQ=255) ttCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGc > 1:221076/1‑150 (MQ=255) aTCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCg < 2:1349318/150‑1 (MQ=255) tgaTGGCGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGACACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCgg > 2:1274746/3‑150 (MQ=255) tGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCAGTGTCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCGGGCTCGACTTCGACTCGCCATGTCCCACCGCCTCGATCGCTTCGCCCg > 2:1130776/1‑150 (MQ=255) tcATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCgcgg > 1:68658/1‑150 (MQ=255) tcATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCgcgg > 2:1158867/1‑150 (MQ=255) aTGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCgcggcg > 1:492693/1‑150 (MQ=255) catcaacaacccggcttatgtcgacctggtacagggtggcgctatcgccttcgccatcagccccccgcttgccaccatcggcactctgctggcgcacttccgtcgtggcgacatcgtcagtgtgcacTCGCTGCG‑CCGCACCGCGGCGCa > 2:2100468‑M1/128‑150 (MQ=255) gCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGc < 2:221076/150‑1 (MQ=255) aaTCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGa > 1:455347/1‑150 (MQ=255) caacccggcttatgtcgacctggtacagggtggcgatatcgacattgccatcagcccgcagctcgccaccatcggcacactgctggcgcacgtccgtcgtggcgacatcgtcagtgtgcacTCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAg > 1:1162927‑M1/122‑150 (MQ=255) atcatcACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAg < 1:916640/150‑1 (MQ=255) atcaCTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGc > 1:1784100/1‑150 (MQ=255) tcaCTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGca < 1:326655/150‑1 (MQ=255) aCTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGc < 2:1363949/141‑1 (MQ=255) ttcttcGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCa < 1:1071871/137‑1 (MQ=255) ttcttcGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCAAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACt > 1:1845331/1‑150 (MQ=255) 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tCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGc > 1:304701/1‑150 (MQ=255) tCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGc > 1:1432887/1‑150 (MQ=255) gACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCa > 2:2030736/1‑150 (MQ=255) cTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCAcc > 2:499273/1‑150 (MQ=255) ttCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGc > 1:1323076/1‑54 (MQ=255) ttCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGt > 1:113971/1‑136 (MQ=255) ttCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCCATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACGCTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCAccc < 2:896826/150‑1 (MQ=255) tCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACTGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCt < 2:1377476/150‑1 (MQ=255) gAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCAAAAGATAGGATTACGCACGTTGTGCGGGTGGTGGAGAGAAGTGGACTCATGCCAATGTCGATATCGCCACCCTGt > 1:1862300/1‑150 (MQ=255) gAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCCAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGt > 2:927347/1‑150 (MQ=255) aaTCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTa < 2:1845331/150‑1 (MQ=255) cGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCCATCAGGCGACTGGCGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCa < 2:2433377/150‑1 (MQ=255) ccATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCg < 1:1830708/105‑1 (MQ=255) ccATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAgg > 2:1029779/1‑150 (MQ=255) aTGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTc < 1:733273/150‑1 (MQ=255) aTGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTc > 1:1772040/1‑150 (MQ=255) ccACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACAt > 2:2348667/1‑150 (MQ=255) ccACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACAt > 1:1645557/1‑150 (MQ=255) aCCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCacgacg > 1:531832/1‑65 (MQ=255) cTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGTCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCgg > 2:73404/1‑150 (MQ=255) TCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTc > 1:1370607‑M1/1‑133 (MQ=255) TCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCgtgttct > 2:2368957‑M1/1‑148 (MQ=255) | ATTCGATCATGGTGTCGTCATGGGCAATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGT > NC_002947/74925‑75221 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |