New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 75100 = | 132 (1.470) | coding (1110/1374 nt) | trkA | TrK potassium transporter NAD‑binding protein |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
ATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTGCGC > NC_002947/74951‑75248 | atcatcACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAg < 1:916640/150‑1 (MQ=255) catcaCTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTg < 2:2085163/150‑1 (MQ=255) atcaCTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGc > 1:1784100/1‑150 (MQ=255) tcaCTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGca < 1:326655/150‑1 (MQ=255) tcaCTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGca < 2:2325543/150‑1 (MQ=255) ttcttcGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCAAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACt > 1:1845331/1‑150 (MQ=255) cttcGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGa < 2:1649856/150‑1 (MQ=255) ttcGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGAc < 2:492693/150‑1 (MQ=255) tCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCGCCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATg > 1:612729/1‑150 (MQ=255) cACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGt < 1:2267049/150‑1 (MQ=255) aCGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGAc > 1:1078531/1‑144 (MQ=255) aCGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGAc < 2:1078531/144‑1 (MQ=255) aCGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTc < 2:706907/150‑1 (MQ=255) 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actcgctgcgccgcggtgcggccgaagcgaGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGc < 1:863855‑M2/75‑1 (MQ=255) actcgctgcgccgcggtgcggccgaagcgaGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTc < 1:1563091‑M2/81‑1 (MQ=255) ctcgctgcgccgcggtgcggccgaagcgaGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGgttg > 1:1162927‑M2/30‑150 (MQ=255) tcgctgcgccgcggtgcggccgaagcgaGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGgttgt > 1:283235‑M2/29‑150 (MQ=255) TCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTc < 2:1370607‑M1/133‑1 (MQ=255) TCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCgtgttct > 2:2368957‑M1/1‑148 (MQ=255) GCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGttgttg < 2:28613‑M1/150‑1 (MQ=255) TTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGAt > 1:2348667‑M1/1‑150 (MQ=255) gCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAgt < 2:723215/63‑1 (MQ=255) gCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGAGATAAGCCGGGTTGTTGatgatg > 2:1194045/1‑150 (MQ=255) gCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGatgatg < 2:1782452/150‑1 (MQ=255) gCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGatgatg > 1:2130748/1‑150 (MQ=255) gCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGatgatg < 2:1034954/150‑1 (MQ=255) ggCACCGCGGCGCCGTGAGCGCACACGGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGt < 2:1094612/149‑1 (MQ=255) gCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGtc < 2:2144196/150‑1 (MQ=255) aCCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGtcat < 2:1645557/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCtt > 1:1325754/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCtt < 1:686879/150‑1 (MQ=255) gcAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGc > 2:2284874/1‑150 (MQ=255) cgaGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTgc < 2:2418450‑M2/147‑1 (MQ=255) aGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTgcgc > 1:636573‑M2/2‑150 (MQ=255) | ATCATCACTTCTTCGTCACGGATGATCGCACCAATAGTGGTGCCCGGTGGCAGCGTGATGTCCTCGATTGCCTTGCCGACCACCTTGCTCGACTTCGAATCGCCATGTGCCACCGCCTCGATCGCTTCGGCCGCACCGCGGCGCAGCGAGTGCACACTGACGATGTCGCCACGACGGACGTGCGCCAGCAGTGTGCCGATGGTGGCGAGCTGCGGGCTGATGGCAATGTCGATATCGCCACCCTGTACCAGGTCGACATAAGCCGGGTTGTTGATGATGGTCATCACCTTGCCTGCGC > NC_002947/74951‑75248 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |