New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1126618 | 47 (0.500) | 7 (0.090) | 6/208 | NT | 14.7% | intergenic (‑67/+83) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 1126634 | 42 (0.540) | intergenic (‑83/+67) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
GCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTG > NC_002947/1126469‑1126767 | gcAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCG < 1:1677610‑M1/150‑1 (MQ=255) gcAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCG < 1:1527509‑M1/150‑1 (MQ=255) aGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGa > 2:656489/1‑150 (MQ=255) gcgcgcATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGta < 2:30439/150‑1 (MQ=255) cgcgcATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGTGAATGCGGAGGtat < 2:1402999/150‑1 (MQ=255) gggtcgacaacgtgttcggcgaccgcaacctggtgtgcgcctgcccgtcgatcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGc < 1:1455974‑M1/31‑1 (MQ=255) tcggcgaccgcaacctggtgtgcgcctgcccgtcgatcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTcgc > 2:1455974‑M1/105‑150 (MQ=255) tgGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg > 1:2074409‑M2/1‑139 (MQ=255) tgGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg > 1:2152949‑M2/1‑139 (MQ=255) tgGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg > 1:717248‑M2/1‑139 (MQ=255) tgGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg > 1:846726‑M2/1‑139 (MQ=255) tgGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGAGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGatggtggctatacctccgcattcgcgg < 2:2445274‑M1/150‑28 (MQ=255) ggAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGc < 1:1265217/131‑1 (MQ=255) ggAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGc > 2:1265217/1‑131 (MQ=255) tGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg > 2:758271‑M2/1‑132 (MQ=255) tGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg < 1:758271‑M2/143‑12 (MQ=255) gcaacctggtgtgcgcctgcccgtcgatcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCgg < 2:1238299‑M1/48‑1 (MQ=255) agcgggcgatgccgatCTTGAACAGGTCGTAGACGCTCAGTGACTTGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGGGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTGTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGc < 2:2350806/144‑1 (MQ=38) aGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggtaaacccgc > 1:640616‑M2/1‑129 (MQ=255) gggCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTc > 1:2336889/1‑150 (MQ=255) gccgatgccgatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGTGCGGGTTTACCCGCGAATGCGatggtggctatacctccgcattcgcg < 2:752686‑M1/135‑27 (MQ=255) cgatgccgatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTac > 1:935066/1‑150 (MQ=255) tgccgatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAcaca < 1:276321/150‑1 (MQ=255) ggccgagCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAcaca < 2:527980/149‑1 (MQ=255) gccgatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGGGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGATTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATTGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACag > 1:14802/1‑150 (MQ=255) gatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGc < 2:1133169/150‑1 (MQ=255) tCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGccc > 1:456653/1‑150 (MQ=255) tCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGGGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGccc < 2:1662855/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATc < 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gAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTaca > 2:2053142/1‑129 (MQ=255) gAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTaca < 1:2053142/129‑1 (MQ=255) aaGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAg < 2:541661/150‑1 (MQ=255) aGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAgg > 1:271098/1‑150 (MQ=255) gACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGt < 2:935066/150‑1 (MQ=255) gCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGc > 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tAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCacac > 1:203299/1‑150 (MQ=255) gcgcGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAATCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGAt < 1:738238/119‑1 (MQ=255) gcgGGTTTACCCGCGAATGCGatggtggctatacctccgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtcttcgacctgttcaagatcggcatcggcccct > 1:640616‑M1/1‑21 (MQ=255) GCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAcaca < 2:2261818‑M1/67‑1 (MQ=255) tttACCCGCGAATGCGatggtggctatacctccgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggag < 1:1131011‑M1/93‑78 (MQ=255) tttACCCGCGAATGCGatggtggctatacctccgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggag > 2:1131011‑M1/1‑16 (MQ=255) TTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGc > 2:1780385‑M1/1‑104 (MQ=255) 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ccGCGAATGCGatggtggctatacctccgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtcttcgacctgttcaagatcggcatcggcccctccagctccca > 1:717248‑M1/1‑11 (MQ=255) ccGCGAATGCGatggtggctatacctccgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtcttcgacctgttcaagatcggcatcggcccctccagctccca > 1:846726‑M1/1‑11 (MQ=255) ccGCGAATGCGatggtggctatacctccgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtcttcgacctgttcaagatcggcatcggcccctcca < 1:758271‑M1/143‑133 (MQ=255) ccGCGAATGCGatggtggctatacctccgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtcttcgacctgttcaagatcggcatcggcccctcca > 2:758271‑M1/1‑11 (MQ=255) ccGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtctctgagcgtcttcgacctgttcaagatcggcatcggcccctccagctccca < 2:2445274‑M2/150‑124 (MQ=255) ccGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggag > 2:340486‑M2/1‑27 (MQ=255) ccGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggag < 1:340486‑M2/88‑62 (MQ=255) CCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAg > 2:1410394‑M1/1‑77 (MQ=255) CCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAg < 1:1410394‑M1/77‑1 (MQ=255) CCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGcc < 1:1282343‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGcc < 2:1447630‑M1/150‑1 (MQ=255) cgcgAATGCGatggtggctatacctccgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtcttcgacctgttcaagatcggcatcggcccctccagctcccac > 1:2020877‑M1/1‑10 (MQ=255) cgcgAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggtaaacccgcacctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtcttcgacctgttcaagatcggcatcggc > 1:752686‑M2/1‑26 (MQ=255) cgcgAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggtaaacccgcacctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtcttcgacctgttcaagatcggcatcggc < 2:752686‑M2/135‑110 (MQ=255) CGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCg < 1:1858202‑M1/150‑1 (MQ=255) gcgAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtcttcgac > 1:2125007‑M2/1‑25 (MQ=255) gatggtggctatacctccgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtcttcgacctgttcaagatcggcatcggcccctccagctcccacacggtcggc > 1:1651962‑M1/1‑1 (MQ=255) gatggtggctatacctccgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtcttcgacctg > 2:990579‑M1/1‑1 (MQ=255) GGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGACCTATCAGGCGTCATGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTg < 1:1223009‑M1/150‑1 (MQ=255) | GCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTG > NC_002947/1126469‑1126767 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |