| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1126618 | 47 (0.500) | 7 (0.090) | 6/208 | NT | 14.7% | intergenic (‑67/+83) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | = 1126634 | 42 (0.540) | intergenic (‑83/+67) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase | |||||
GCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCG > NC_002947/1126486‑1126783 | gCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATc > 1:1651962‑M2/1‑149 (MQ=255) tcggcgaccgcaacctggtgtgcgcctgcccgtcgatcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTcgc > 2:1455974‑M1/105‑150 (MQ=255) gtgGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcg > 1:2020877‑M2/1‑140 (MQ=255) tgGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg > 1:2152949‑M2/1‑139 (MQ=255) tgGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg > 1:2074409‑M2/1‑139 (MQ=255) tgGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg > 1:717248‑M2/1‑139 (MQ=255) tgGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg > 1:846726‑M2/1‑139 (MQ=255) tGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg > 2:758271‑M2/1‑132 (MQ=255) tGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg < 1:758271‑M2/143‑12 (MQ=255) gcaacctggtgtgcgcctgcccgtcgatcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtatgaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCgg > 1:1238299‑M1/96‑143 (MQ=255) gcaacctggtgtgcgcctgcccgtcgatcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCgg < 2:1238299‑M1/48‑1 (MQ=255) agcgggcgatgccgatCTTGAACAGGTCGTAGACGCTCAGTGACTTGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGGGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTGTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGc < 2:2350806/144‑1 (MQ=38) aGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggtaaacccgc > 1:640616‑M2/1‑129 (MQ=255) gggCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTc > 1:2336889/1‑150 (MQ=255) cgatgccgatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTac > 1:935066/1‑150 (MQ=255) gatgccgatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTaca > 1:776335/1‑150 (MQ=255) tgccgatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAcaca < 1:276321/150‑1 (MQ=255) ggccgagCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAcaca < 2:527980/149‑1 (MQ=255) gccgatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGGGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGATTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATTGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACag > 1:14802/1‑150 (MQ=255) gatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGc < 2:1133169/150‑1 (MQ=255) tCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGccc > 1:456653/1‑150 (MQ=255) tCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGGGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGccc < 2:1662855/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATc < 1:990579‑M2/108‑2 (MQ=255) cAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATc > 2:990579‑M2/1‑107 (MQ=255) 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gAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTaca < 1:2053142/129‑1 (MQ=255) aaGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAg < 2:541661/150‑1 (MQ=255) aGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAgg > 1:271098/1‑150 (MQ=255) gACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGt < 2:935066/150‑1 (MQ=255) gCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGc > 2:143896/1‑150 (MQ=255) gCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGc > 2:180479/1‑150 (MQ=255) cTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCg < 2:661237/150‑1 (MQ=255) gTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGGGCCCTCTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTTTTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGa < 1:1984139/150‑1 (MQ=38) gTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGa < 1:180479/150‑1 (MQ=255) gcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCgg > 1:584079‑M1/52‑99 (MQ=255) gcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCgg < 2:584079‑M1/48‑1 (MQ=255) 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ctcctGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggtaaa < 1:1131011‑M2/93‑17 (MQ=255) tGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGTCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGACACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAggacgcct < 2:1667462/150‑7 (MQ=255) ccAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGa > 1:350588/1‑150 (MQ=255) cAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTAGAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTgct > 2:28687/1‑148 (MQ=255) aGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATa < 1:1929478/150‑1 (MQ=255) ggTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgg > 1:1874529‑M2/1‑68 (MQ=255) 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CCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGcc < 1:1282343‑M1/150‑1 (MQ=255) cgcgAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggtaaacccgcacctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtcttcgacctgttcaagatcggcatcggc < 2:752686‑M2/135‑110 (MQ=255) cgcgAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggtaaacccgcacctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtcttcgacctgttcaagatcggcatcggc > 1:752686‑M2/1‑26 (MQ=255) CGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCg < 1:1858202‑M1/150‑1 (MQ=255) gcgAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtcttcgac > 1:2125007‑M2/1‑25 (MQ=255) gcgAATGCGGAGGTATAGCCACCATcgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtcttcgac < 2:2125007‑M2/113‑89 (MQ=255) GGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGACCTATCAGGCGTCATGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTg < 1:1223009‑M1/150‑1 (MQ=255) taGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGAccc > 1:338290/1‑150 (MQ=255) gCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCgg > 1:796794/1‑150 (MQ=255) accaTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCg > 2:1234301/1‑150 (MQ=255) tCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAAGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACcg > 2:687094/1‑150 (MQ=255) | GCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCG > NC_002947/1126486‑1126783 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |