New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1593399 = | 111 (1.190) | 8 (0.120) +GTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTT |
10/174 | NT | 11.9% | intergenic (‑79/+41) | PP_1398/PP_1399 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1593500 = | 59 (0.630) | coding (345/405 nt) | PP_1399 | hypothetical protein |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
CGGGGACCGACGATGGCATTGAACGGGTCGTGCGGCAGGCCGTGGCCTTTGGCGGGTTCGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTTGGTG‑‑CGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCGGTGCGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCGGTGCGGT > NC_002947/1593250‑1593546 | caacgcttcgctgaagacggcttcgaccgcacaaatggccaacgcttcgctgaagacggcttcgaccgcaccggtggccaacgcttcgctgaagacggcttcgaccgcaccaacgcgcaccgcatcagctgatacctgattgcgagcacc < 1:2018203‑M1/1‑1 (MQ=255) ggggACCGACGATGGCATTGAACGGGTCGTGCGGCAGGCCGTGGCCTTTGGCGGGTTCGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAATCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCa < 2:833848/150‑1 (MQ=255) ggggACCGACGATGGCATTGAACGGGTCGTGCGGCAGGCCGTGGCCTTTGGCGGGTTCGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCa > 1:2256344/1‑150 (MQ=255) gggACCGACGATGGCATTGAACGGGTCGTGCGGCAGGCCGTGGCCTTTGGCGGGTTCGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCaa < 2:1493310/150‑1 (MQ=255) gggACCGACGATGGCATTGAACAGGTCGTGCGGCAGGCCGTGGCCTTTGGCGGGTTCGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCGGCAAATGATCaa < 2:1144194/150‑1 (MQ=255) cgacgaTGGCATTGAACGGGTCGTGCGGCAGGCCGTGGCCTTTGGCGGGTTCGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCg > 2:2083505/1‑150 (MQ=255) cgacgaTGGCATTGAACGGGTCGTGCGGCAGGCCGTGGCCTTTGGCGGGTTCGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCg > 1:1522406/1‑150 (MQ=255) ttGAACGGGTCGTGCGGCAGGCCGTGGCCTTTGGCGGGTTCGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCgg < 1:2083505/150‑1 (MQ=255) aaCGGGTCGTGCGGCAGGCCGTGGCCTTTGGCGGGTTCGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTAGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCt > 1:11045/1‑150 (MQ=255) tcgaccgcaccggtggccaacgcttcgctgaagacggcttcgaccgcaccggtggccaacgcttcgctgaagacggcttcgaccgcaccaacgcgcaccgcatcagctgatacctgattgcgagcacCCAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTg > 1:1522153‑M1/128‑150 (MQ=255) cgaccgcaccggtggccaacgcttcgctgaagacggcttcgaccgcaccggtggccaacgcttcgctgaagacggcttcgaccgcaccaacgcgcaccgcatcagctgatacctgattgcgagcacCCAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTgg > 1:507713‑M1/127‑150 (MQ=255) cgaccgcaccggtggccaacgcttcgctgaagacggcttcgaccgcaccggtggccaacgcttcgctgaagacggcttcgaccgcaccaacgcgcaccgcatcagctgatacctgattgcgagcacCCAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTgg > 1:504987‑M1/127‑150 (MQ=255) cGGGTCGTGCGGCAGGCCGTGGCCTTTGGCGGGTTCGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTgg < 2:638789/150‑1 (MQ=255) cGGGTCGTGCGGCAGGCCGTGGCCTTTGGCGGGTTCGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTgg < 2:345026/150‑1 (MQ=255) cGGGTCGTGCGGCAGGCCGTGGCCTTTGGCGGGTTCGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTgg < 1:751646/150‑1 (MQ=255) gggTCGTGCGGCAGGCCGTGGCCTTTGGCGGGTTCGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTggg > 1:1068359/1‑150 (MQ=255) gggTCGTGCGGCAGGCCGTGGCCTTTGGCGGGTTCGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTgg < 1:2225834/149‑1 (MQ=255) accgcaccggtggccaacgcttcgctgaagacggcttcgaccgcaccggtggccaacgcttcgctgaagacggcttcgaccgcaccaacgcgcaccgcatcagctgatacctgattgcgagcacCCAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGt > 1:1157451‑M1/125‑150 (MQ=255) 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ccGTGGCCTTTGGCGGGTTCGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGt > 1:726646/1‑150 (MQ=255) gTGGCCTTTGGCGGGTTCGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTAt < 2:1873652/150‑1 (MQ=255) ccTTTGGCGGGTTCGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGc < 1:1083040/150‑1 (MQ=255) gctgaagacggcttcgaccgcaccggtggccaacgcttcgctgaagacggcttcgaccgcaccaacgcgcaccgcatcagctgatacctgattgcgagcacCCAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTg > 2:1015159‑M1/102‑128 (MQ=255) gctgaagacggcttcgaccgcaccggtggccaacgcttcgctgaagacggcttcgaccgcaccaacgcgcaccgcatcagctgatacctgattgcgagcacCCAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTg < 1:1015159‑M1/27‑1 (MQ=255) ggTTCGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCCATCGCTTATCAGCTGATGCGGt < 1:2019371/150‑1 (MQ=255) ggTTCGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCggg > 1:2298386/1‑149 (MQ=255) cGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTgcgc < 1:1404100/150‑1 (MQ=255) gtagtaATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGcgcg > 1:1801991/1‑150 (MQ=255) tagtaATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTg > 1:657174/1‑112 (MQ=255) tagtaATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTg < 2:657174/112‑1 (MQ=255) tagtaATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGt > 2:2146506/1‑150 (MQ=255) taATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCgg < 1:305854/105‑1 (MQ=255) taATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCgg > 2:305854/1‑105 (MQ=255) aaTACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTTGGt < 1:1679942/150‑1 (MQ=255) aTCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTc > 2:635449/1‑110 (MQ=255) aTCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTc < 1:635449/110‑1 (MQ=255) 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ccAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTTGGTG‑‑CGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCAACCGGTGCGGTCGAAGCCGTCTTCa > 1:161463/1‑150 (MQ=255) aaGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGCTCAAGCCCTGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTTGGTG‑‑CAGTCGATTCCCTGTATAGTAGAGCGTTGTGCTCCGGTGCGGTCGAAGCCGTCTTCAGc < 1:894506/150‑1 (MQ=255) aaGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAg < 2:86931/63‑1 (MQ=255) aaGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAg > 1:86931/1‑63 (MQ=255) aGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTTGGTG‑‑CGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCGGTGCGGTCGAAGCCGTCTTCAGCg < 2:793222/150‑1 (MQ=255) gCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTTGGTG‑‑CGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCGGTGCGGTCGAAg > 2:1691477/1‑137 (MQ=255) ccTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTTGGTG‑‑CGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCGGTGCGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGaa < 2:726646/150‑1 (MQ=255) cTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTTGGTG‑‑CGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCGGTGCGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAg > 1:1936644/1‑150 (MQ=255) tGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTTGGTG‑‑CGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCGGTGCGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGc > 1:1887257/1‑150 (MQ=255) aGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTTGGTG‑‑CGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCGGTGCGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGt < 2:1887257/150‑1 (MQ=255) cTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTTGGTG‑‑CGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCGGTGCGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTg < 2:213675/150‑1 (MQ=255) tCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTTGGTG‑‑CGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCg > 1:1492787/1‑117 (MQ=255) tCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGGTGTTG‑‑CGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCGGTGCGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTgg > 1:161383/1‑150 (MQ=255) cTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTTGGTG‑‑Cgg < 1:1140332/80‑1 (MQ=255) tGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTTGGTGAACCG‑CGTGGGGGTC‑GCAGCGAATCGTTGGCCACCGGTGCGGCTGAAGCCCGCTTCAGCGAAGCGTTGGCCAcc > 1:1224433/1‑150 (MQ=21) gCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTTGGTG‑‑CGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTGGGCCACCGGTGCGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCg > 1:143599/1‑150 (MQ=255) gagcacCCAGCCCGGCTTCGGCCGGGCTTGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTTGGTG‑‑CGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCGGTGCGGTCGaa > 1:1957809‑M1/7‑119 (MQ=255) aTGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTTGGTG‑‑CGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCGGTGCGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCGGTGc < 2:1936644/150‑1 (MQ=255) gATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTTGGTG‑‑CGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCGGTGCGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCGGTGCgg > 2:1113197/1‑150 (MQ=255) acCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTTGGTG‑‑CGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCGGTGCGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCGGTGCGGt < 1:519273‑M1/148‑1 (MQ=255) | CGGGGACCGACGATGGCATTGAACGGGTCGTGCGGCAGGCCGTGGCCTTTGGCGGGTTCGTAGTAATACATCTGTGCTGGGCTTGTTGGCCCTACCTCCTGGTGGACAAGGTGCCTAGTGTGCCAAGCCTGAGCTCGCCTGCAAATGATCAAGCCCGGCCGAAGCCGGGCTGGGTGCTCGCAATCAGGTATCAGCTGATGCGGTGCGCGTTGGTG‑‑CGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCGGTGCGGTCGAAGCCGTCTTCAGCGAAGCGTTGGCCACCGGTGCGGT > NC_002947/1593250‑1593546 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |