| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1637246 | 103 (1.100) | 7 (0.080) | 6/244 | NT | 6.4% | coding (654/741 nt) | pdxJ | pyridoxine 5'‑phosphate synthase |
| ? | NC_002947 | = 1637264 | 103 (1.130) | coding (672/741 nt) | pdxJ | pyridoxine 5'‑phosphate synthase | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
ACCGAAGTGGCTGAAGAGCTCAAGCGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCGGC > NC_002947/1637097‑1637395 | aCCGAAGTGGCTGAAGAGCTCAAGCGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGC < 2:525599‑M1/150‑1 (MQ=255) aGTGGCTGAAGAGCTCAAGCGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATgc < 2:953594/150‑1 (MQ=255) ggCTGAAGAGCTCAAGCGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGCGGCGGGGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCagatcgga > 2:1638924‑M1/1‑142 (MQ=255) ggCTGAAGAGCTCAAGCGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTCCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCt < 2:1372995/150‑1 (MQ=255) gCTGAAGAGCTCAAGCGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCAGTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGGCATgcgcgg > 2:2250699/1‑148 (MQ=255) tGAAGAGCTCAAGCGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCtggt > 2:730132/1‑150 (MQ=255) tGAAGAGCTCAAGCGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCtggt < 1:332412/150‑1 (MQ=255) gAAGAGCTCAAGCGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCtggtg > 1:141949/1‑150 (MQ=255) gAAGAGCTCAAGCGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGACTTGTCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCtggtg < 1:1487952/150‑1 (MQ=255) aaGAGCTCAAGCGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCtggtgg > 1:807975/1‑150 (MQ=255) aaGAGCTCAAGCGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCtggtgg > 1:807968/1‑150 (MQ=255) tCAAGCGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATg < 1:934044‑M2/150‑2 (MQ=255) tCAAGCGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATg < 1:238322‑M2/150‑2 (MQ=255) aaGCGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATgcc < 1:1503247‑M2/150‑4 (MQ=255) ggATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCttgt < 1:2436770/150‑1 (MQ=255) gtcgAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTc < 2:238322/150‑1 (MQ=255) gtcgAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTc < 1:1075077/150‑1 (MQ=255) aGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCt > 1:1849223/1‑150 (MQ=255) gggTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCNCGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCtt > 1:319208/1‑150 (MQ=255) gtgtGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTGGGTCGGCTTCa > 1:1566056/1‑150 (MQ=255) tgGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGGGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCaacg > 2:316000/1‑148 (MQ=255) tttGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGgctgct < 1:2145195/150‑1 (MQ=255) ggggCATAGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACTTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCATTGAGTTGAACATTGGCCATGCCCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCga < 2:1228966/150‑1 (MQ=255) ggCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCgaga < 1:330368/150‑1 (MQ=255) ggCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCgaga < 2:2310585/150‑1 (MQ=255) gCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGCGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGAt > 2:1052165/1‑150 (MQ=255) aTGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGGTGa > 1:97153/1‑150 (MQ=255) tGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTc < 1:2178345/121‑1 (MQ=255) tGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTc > 2:2178345/1‑121 (MQ=255) tGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑gcgc < 2:2237424/150‑1 (MQ=255) tGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑gcgc < 1:598786/150‑1 (MQ=255) tGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑gcgc > 2:483740/1‑150 (MQ=255) gTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCtggtg > 1:2338348/1‑93 (MQ=255) gTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATc > 1:1791401/1‑150 (MQ=255) aaTGCCGGTCACGGGCTGCATTACCAGACATTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTg > 1:1244676/1‑150 (MQ=255) aaTGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTg > 2:1367467/1‑150 (MQ=255) cGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTggcggc > 2:1160394/1‑150 (MQ=255) ggTAACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTGGCGGCt > 2:362559/1‑150 (MQ=255) gTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTGGCGGCtt > 2:2137658/1‑150 (MQ=255) gTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATAATTGAATCGCCAATGCGCCATGCCCTGGTGGCGCAGTCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTGGCGGCtt < 1:542236/150‑1 (MQ=255) 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aTGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCCGCGAaga < 1:1038958/150‑1 (MQ=255) aTGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGaaaa < 2:753733/150‑3 (MQ=255) tGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCCGCGAagag > 1:960530/1‑150 (MQ=255) gAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCCTGCCTTGTTTGTCGGTTCCAGCACGGCTGGGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAgg < 2:1244676/150‑1 (MQ=255) gAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGCCGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAAAgg < 2:2440935/150‑1 (MQ=38) aGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGc < 1:2137658/150‑1 (MQ=255) ttGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATgccaatgttcaactcattgatacccttgatcgc > 2:688675‑M2/1‑30 (MQ=255) ttGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATgccaatgttcaactcattgatacccttgatcgc < 1:688675‑M2/63‑34 (MQ=255) ttGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTgg < 1:94458/106‑1 (MQ=255) ttGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTgg > 2:94458/1‑106 (MQ=255) ttGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCa < 1:483740/150‑1 (MQ=255) gAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCtt < 1:2205073/45‑1 (MQ=255) gAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCtt > 2:2205073/1‑45 (MQ=255) aTTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATgccaatgttcaactcattgatacccttgatcgccgccaccgcctcgacgttgtg > 2:2331193‑M2/1‑24 (MQ=255) aTTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATgccaatgttcaactcattgatacccttgatcgccgccaccgcctcgacgttgtg < 1:2331193‑M2/78‑55 (MQ=255) aTTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGGTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGCCGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAAAGGCCGGTACAg > 2:1046645/1‑150 (MQ=25) aTTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAAAAgg > 2:1401021/1‑141 (MQ=255) ggCatgcgccaccagcgcatggccaatgttcaactcattgatacccttgatcgccgccaccgcctcgacgttgtggtaatgcagcccgtgaccggcattgacgatcagcccatgccccacgccaaacgccacaccctcgacgatccgctt < 1:1503247‑M1/150‑148 (MQ=255) ccATGCGCTGGTGGCGCATggccaatgttcaactcattgctccccgtgctcgccgccaccgcctcgacgttgtggtaatgcagcccgtgaccggcattgacgatcagcccatgccccacgccaaaccccacaccctcgacgatccgcttg < 1:1136875‑M2/150‑132 (MQ=255) ccATGCGCTGGTGGCGCATggccaatgttcaactcattgatacccttgatcgccgccaccgcctcgacgttgtggtaatgcagcccgtgaccggcattgacgatcagcccatgccccacgccaaac < 1:129174‑M2/126‑108 (MQ=255) ccATGCGCTGGTGGCGCATggccaatgttcaactcattgatacccttgatcgccgccaccgcctcgacgttgtggtaatgcagcccgtgaccggcattgacgatcagcccatgccccacgccaaac > 2:129174‑M2/1‑19 (MQ=255) ccATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAggcggc < 2:1791401/150‑1 (MQ=255) ccATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAggaggc > 1:403064/1‑150 (MQ=255) ccATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGCCGCCTGTGCTGGTCTCTTCGCTTTCTTGCCCGCGAAAAGGCCGGTACAggcgac < 1:1046645/150‑3 (MQ=25) catgcgccaccagcgcatggccaatgttcaactcattgatacccttgatcgccgccaccgcctcgacgttgtggtaatgcagcccgtgaccggcattgacgatcagcccatgccccacgccaaacgccacaccctcgacgatccgcttga < 1:238322‑M1/150‑150 (MQ=255) | ACCGAAGTGGCTGAAGAGCTCAAGCGGATCGTCGAGGGTGTGGCGTTTGGCGTGGGGCATGGGCTGATCGTCAATGCCGGTCACGGGCTGCATTACCACAACGTCGAGGCGGTGGCGGCGATCAAGGGTATCAATGAGTTGAACATTGGCCATGCGCTGGTGGCGCATGCCTTGTTTGTCGGCTTCAAGGCTGCTGTGGCCGAGATGAAG‑‑GCGCTGATCGTGGCGGCTTCGCGCTGATTGTTGGTCGCCTGTACCGGCCTTTTCGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCGGC > NC_002947/1637097‑1637395 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |