New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_002947 | = 2052913 | 82 (0.950) | coding (731/783 nt) | PP_1828 | hypothetical protein |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
GGTGTTCATGCTCACCGCCGAGCAGTGCCGCCAGCATCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGCCCTTCCTTTTCCTGCAGTTGCTGGTCGGCCTGCTGCAGCAGGCTGGCGGCA > NC_002947/2052748‑2053044 | ggTGTTCATGCTCACCGCCGAGCAGTGCCGCCAGCATCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGG < 2:1493176‑M1/150‑1 (MQ=255) cATGCTCACCGCCGAGCAGTGCCGCCAGCATCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACg < 1:1761744/150‑1 (MQ=255) aTGCTCACCGCCGAGCAGTGCCGCCAGCATCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACgg > 2:2290969/1‑150 (MQ=255) 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cACCGCCGAGCAGTGCCGCCAGCATCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAAc > 1:947062/1‑150 (MQ=255) ccgccgAGCAGTGCCGCCAGCATCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGc < 2:1551874/150‑1 (MQ=255) cAGTGAGGCCAGCATCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCAccaggc < 2:1271438‑M2/150‑7 (MQ=255) actgcCGCCAGCATCAGGAATTGTTCAAGGCCATCATTTACGAAATGTTGGGCCGCGAAGCGGCCCTACTTTCTATCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGtggcgtttgccgtgttccaggca < 1:533040‑M1/148‑24 (MQ=255) ccgccAGCATCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGACGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCAAccaggcaggga < 2:359915‑M2/150‑12 (MQ=255) cgccAGCATCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTaa > 1:1822182/1‑150 (MQ=255) gccAGCATCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGTGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAAt < 1:511182/150‑1 (MQ=255) ccAGCATCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATg < 2:843552/150‑1 (MQ=255) tCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTACTTTCCCCCGGCTGATCCGGTCTTGGCGGGTAGCAATCCCGGTCACCAGCCCTACCTTGAGCACGGCAAACCTCTCCAGCCTGATAATGGTGaaa > 1:711351/1‑150 (MQ=255) tCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGaaa < 2:1062292/150‑1 (MQ=255) 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cctgcctgGtggcgtttgccgtgttccaggcagggctgttgatctggattgctacccgctaagaccgcatcagccaggggaaatt > 1:1661961‑M1/1‑9 (MQ=255) cctgcctgGtggcgtttgccgtgttccaggcagggctgttgatctggattgctacccgctaagaccgcatcagccaggggaaatt < 2:1661961‑M1/85‑77 (MQ=255) cctgcctgGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGCCCTTCCTTTTCCTGCAGTTGCTGGTCGGCCTGCTGCAGCAGGCTg < 1:2330512/150‑1 (MQ=255) ctgcctgGAACACGGCAAACGCCAccaggcagggctgttgatctggattgctacccgctaagaccgcatcagccgggggaaattagggccgcttcgcggccccaaatagcctaaacgagg < 2:1025147‑M2/120‑97 (MQ=255) ctgcctgGAACACGGCAAACGCCAccaggcagggctgttgatctggattgctacccgctaagaccgcatcagccgggggaaattagggccgcttcgcggccccaaatagcctaaacgagg > 1:1025147‑M2/1‑24 (MQ=255) tgcctgGAACACGGCAAACGCCAccaggcagggctgttgatctggattgctacccgctaagaccgcatcagccgatagaaagtagggccgcttcgcggcccaacatttcgtaaatgatggccttgaacaattcctgatgctggcggcagt < 1:533040‑M2/150‑128 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |