New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 2052897 | 93 (1.000) | 6 (0.070) | 6/232 | NT | 6.7% | coding (747/783 nt) | PP_1828 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2052913 | 82 (0.950) | coding (731/783 nt) | PP_1828 | hypothetical protein |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GCAGTGCCGCCAGCATCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGCCCTTCCTTTTCCTGCAGTTGCTGGTCGGCCTGCTGCAGCAGGCTGGCGGCATCCAGAATCTCCACCCG > NC_002947/2052769‑2053061 | gCAGTGCCGCCAGCATCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCAccagg > 1:2168882‑M2/1‑145 (MQ=255) cAGTGAGGCCAGCATCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCAccaggc < 2:1271438‑M2/150‑7 (MQ=255) ccgccAGCATCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGACGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCAAccaggcaggga < 2:359915‑M2/150‑12 (MQ=255) cgccAGCATCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTaa > 1:1822182/1‑150 (MQ=255) gccAGCATCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGTGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAAt < 1:511182/150‑1 (MQ=255) ccAGCATCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATg < 2:843552/150‑1 (MQ=255) tCAGGACTTGTTTAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTAAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACAAGGCAAAAGCCAACATGCAGGTAATTTTGaaa < 2:1332162/150‑1 (MQ=255) tCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTACTTTCCCCCGGCTGATCCGGTCTTGGCGGGTAGCAATCCCGGTCACCAGCCCTACCTTGAGCACGGCAAACCTCTCCAGCCTGATAATGGTGaaa > 1:711351/1‑150 (MQ=255) tCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGaaa < 2:1062292/150‑1 (MQ=255) tCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGaaa > 1:2169511/1‑150 (MQ=255) cAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAAc < 1:2290969/150‑1 (MQ=255) aGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACg > 1:2374286/1‑150 (MQ=255) aGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACg > 1:1098128/1‑150 (MQ=255) gAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCa > 2:2195992/1‑150 (MQ=255) aaGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGt < 2:1481/150‑1 (MQ=255) aGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGACGCAACGAGACCCTAATTTCCCCCGTCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTc > 2:627431/1‑150 (MQ=255) gCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCtt > 1:1302735/1‑150 (MQ=255) cccTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTCGCGAATCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTc < 1:1484174/150‑1 (MQ=255) 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tttAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTg > 1:2155880/1‑150 (MQ=255) gCTATTTGGGGTCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATg < 1:2244672/116‑1 (MQ=255) gCTATTTGGGGTCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATg > 2:2244672/1‑116 (MQ=255) gCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCCGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTAtt > 1:1579428/1‑150 (MQ=255) cTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTAttt < 2:729058/150‑1 (MQ=255) tATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTAttt > 1:34091/1‑149 (MQ=255) tATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTAttt < 2:34091/149‑1 (MQ=255) aTTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTgg < 2:2181938/150‑1 (MQ=255) gCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTAcgcg > 2:85346/1‑150 (MQ=255) gcgAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTTGTATTTGGCTACGCGCTc < 1:75591/150‑1 (MQ=255) ggCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGc < 1:2195992/150‑1 (MQ=255) 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cccccGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTg < 2:317288/150‑1 (MQ=255) ccccGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTg < 2:356125/113‑1 (MQ=255) ccccGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTg > 1:356125/1‑113 (MQ=255) ccGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGccc > 2:1405514/1‑150 (MQ=255) ccGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGccc < 2:1098128/150‑1 (MQ=255) cTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGCccttcc < 2:293820/150‑1 (MQ=255) 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1:2330512/150‑1 (MQ=255) ctgcctgGAACACGGCAAACGCCAccaggcagggctgttgatctggattgctacccgctaagaccgcatcagccgggggaaattagggccgcttcgcggccccaaatagcctaaacgagg < 2:1025147‑M2/120‑97 (MQ=255) ctgcctgGAACACGGCAAACGCCAccaggcagggctgttgatctggattgctacccgctaagaccgcatcagccgggggaaattagggccgcttcgcggccccaaatagcctaaacgagg > 1:1025147‑M2/1‑24 (MQ=255) tgcctgGAACACGGCAAACGCCAccaggcagggctgttgatctggattgctacccgctaagaccgcatcagccgatagaaagtagggccgcttcgcggcccaacatttcgtaaatgatggccttgaacaattcctgatgctggcggcagt < 1:533040‑M2/150‑128 (MQ=255) tgcctgGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGCCCTTCCTTTTCCTGCAGTTGCTGGTCGGCctgc > 1:1235376/1‑136 (MQ=255) tgcctgGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGCCCTTCCTTTTCCTGCAGTTGCTGGTCGGCctgc < 2:1235376/136‑1 (MQ=255) tgcctgGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGCCCTTCCTTTTCCTGCAGTTGCTGGTCGGCCTGCTGCAGCAGGCTggc < 1:404640/150‑1 (MQ=255) gcctgGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGCCCTTCCTTTTCCTGCAGTTGCTGGTCGGCCTGCTGCAGCAGGCTggcg < 2:1537426/150‑1 (MQ=255) ccctgGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGCCCTTCCTTTTCCTGCAGTTGCTGGTCGGCCTGCTGCAGCAGGCTggcg < 1:359915/149‑1 (MQ=255) cctgGAACACGGCAAACGCCAccaggcagggctgttgatctggattgctacccgctaagacc < 1:2109162‑M2/62‑42 (MQ=255) cctgGAACACGGCAAACGCCAccaggcagggctgttgatctggattgctacccgctaagacc > 2:2109162‑M2/1‑21 (MQ=255) tgGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATGTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGCCCTTCCTTTTCCTGCAGTTGCTGGTCGGCCTGCTGCAGCAGGCTGGCGGCa > 2:79200/1‑150 (MQ=255) ggAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTAcgc > 1:2113383/1‑75 (MQ=255) ggAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTAcgc < 2:2113383/75‑1 (MQ=255) aaCACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGCCCTTCCTTTTCCTGCAGCGGCTGGTCGGCCTGCTGCAGCAGGCTGGCGGCATcc < 1:2410157/150‑1 (MQ=255) cacGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGCCCTTCCTTTTCCTGCAGTTGCTGGTCGGCCTGCTGCAGCAGGCTGGCGGCATCCAg > 1:1365568/1‑150 (MQ=255) ggCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGCCCTTCCTTTTCCTGCAGTTGCTGGTCGGCCTGCTGCAGCAGGCTGGCGGCATCCAGAAt < 2:1365568/150‑1 (MQ=255) aaaCGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGCCCTTCCTTTTCCTGCAGTTGCTGGTCGGCCTGCTGCAGCAGGCTGGCGGCATCCAGAAtctc > 1:1385536/1‑150 (MQ=255) aaaCGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGCCCTTCCTTTTCCTGCAGTTGCTGGTCGGCCTGCTGCAGCAGGCTGGCGGCATCCAGAAtctc < 2:521664/150‑1 (MQ=255) aCGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGCCCTTCCTTTTCCTGCAGTTGCTGGTCGGCCTGCTGCAGCAGGCTGGCGGCATCCAGAATCTCCa < 1:627431/150‑1 (MQ=255) cGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGCCCTTCCTTTTCCTGCAGTTGCTGGTCGGCCTGCTGCAGCAGGCTGGCGGCATCCAGAATCTCCAc < 1:1734970/150‑1 (MQ=255) caccaGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGCCCTTCCTTTTCCTGCAGTTGCTGGTCGGCCTGCTGCAGCAGGCTGGCGGCATCCAGAATCTCCACCCg > 1:899157/1‑150 (MQ=255) | GCAGTGCCGCCAGCATCAGGAATTGTTCAAGGCCCTCGTTTAGGCTATTTGGGGCCGCGAAGCGGCCCTAATTTCCCCCGGCTGATGCGGTCTTAGCGGGTAGCAATCCAGATCAACAGCCCTGCCTGGAACACGGCAAACGCCACCAGGCAGGTAATGGTGAAACGCAATCCGCCGTCTTCGCGCTGGTATTTGGCTACGCGCTCATCCCGCTCGCGCAGTTGCCCTTCCTTTTCCTGCAGTTGCTGGTCGGCCTGCTGCAGCAGGCTGGCGGCATCCAGAATCTCCACCCG > NC_002947/2052769‑2053061 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |