New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3487390 = | 98 (1.050) | 5 (0.060) | 5/238 | NT | 5.7% | coding (664/1344 nt) | PP_3093 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3487454 = | 73 (0.820) | coding (600/1344 nt) | PP_3093 | hypothetical protein |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CAGGAACAGGTACAGGCGCTCTGGGTGCAGGCGCGGGTGGGCCAGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTGCGT > NC_002947/3487241‑3487532 | cAGGAACAGGTACATGCGCCCGGGGTGCAGGCGCGGGTGGGCCAGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACTGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCgcggcg < 2:134838/150‑1 (MQ=255) gaacgtcgtactgctggtcgacggtgacagcctcgacggttacagccactgccctctggccaagctgacacgcaacagcatgggcggtttcaaccttgacccgcatttcgtccaccccaccttgcacctgggcagccacgagaccattgc > 1:1227397‑M1/149‑150 (MQ=255) aacgtcgtactgctggtcgacggtgacagcctcgacggttacagccactgccctctggccaagctgacacgcaacagcatgggcggtttcaaccttgacccgcatttcgtccaccccaccttgcacctgggcagccacgagaccattgcc > 2:799557‑M1/148‑150 (MQ=255) cAGGTACAGGCGCTCTGGGTGCAGGCGCGGGTGGGCCAGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCgccggc‑‑c < 1:1151866/150‑1 (MQ=255) tggTACAGGCGCTCTGGGTGCAGGCGCGGGTGGGCCAGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCgccggc‑‑cg < 1:2354348/149‑1 (MQ=255) gTACAGGCGCTCTGGGTGCAGGCGCGGGTGGGCCAGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGa > 2:35996/1‑150 (MQ=255) ggCGCTCTGGGTGCAGGCGCGGGTGGGCCAGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAgcg > 2:749043/1‑150 (MQ=255) ctGGGTGCAGGCGCGGGTGGGCCAGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGc < 2:104614/150‑1 (MQ=255) gggTGCAGGCGCGGGTGGGCCAGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGctc < 1:2317290/150‑1 (MQ=255) gggTGCAGGCGCGGGTGGGCCAGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGctc < 1:2316747/150‑1 (MQ=255) gTGCAGGCGCGGGTGGGCCAGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCtt < 1:430772/150‑1 (MQ=255) gTGCAGGCGCGGGTGGGCCAGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGACTTGCTCtt < 1:749043/150‑1 (MQ=255) tGCAGGCGCGGGTGGGCCAGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTg < 2:1296065/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCGGGTGGGCCAGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGc < 1:1889525/150‑1 (MQ=255) ggCGCGGGTGGGCCAGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGGCGACGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCt > 1:2090290/1‑150 (MQ=255) gcgcGGGTGGGCCAGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTg > 2:2028294/1‑150 (MQ=255) gcgGGTGGGCCAGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCa > 1:377090/1‑150 (MQ=255) gCCAGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑Cg > 1:1428918/1‑150 (MQ=255) ccAGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGa > 1:1462374/1‑150 (MQ=255) ccAGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGa > 2:845119/1‑150 (MQ=255) aGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGc > 1:1758393/1‑150 (MQ=255) tAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCCGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAg < 2:2013360/150‑1 (MQ=255) aGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAgg < 1:384758/150‑1 (MQ=255) actgccctctggccaagctgacacgcaacagcatgggcggtttcaaccttgacccgcatttcgtccaccccaccttgcacctgggcagccacgagaccattGCCGGCATCGGCAAACGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAgg > 1:2278704‑M1/102‑150 (MQ=255) gAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGtt > 1:1953139/1‑150 (MQ=255) ccAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGc > 2:1072364/1‑150 (MQ=255) gCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGa > 2:1338484/1‑150 (MQ=255) gggTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCg < 1:845119/150‑1 (MQ=255) ggTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCTAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGttt > 1:565977/1‑139 (MQ=255) ggTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGttt < 2:565977/139‑1 (MQ=255) ggTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCgg > 2:923865/1‑150 (MQ=255) ggTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGACACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCgg < 1:392022/150‑1 (MQ=255) ggCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAAt < 2:1758393/150‑1 (MQ=255) gCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATg > 2:946716/1‑150 (MQ=255) gCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATg > 2:818228/1‑150 (MQ=255) gCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATg > 2:818217/1‑150 (MQ=255) gCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCAGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATg > 2:1326945/1‑150 (MQ=255) gCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGAGGGCCATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCCTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATg > 1:1774121/1‑150 (MQ=255) cACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATgg > 2:1187434/1‑150 (MQ=255) acgcaacagcatgggcggtttcaaccttgacccgcatttcgtccaccccaccttgcacctgggcagccacgagaccattGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGc < 2:1568689‑M1/60‑1 (MQ=255) gTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAg < 1:1907965/123‑1 (MQ=255) aCCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTgg > 2:2075364/1‑150 (MQ=255) ccGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGc > 2:383370/1‑150 (MQ=255) gtgtTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTg < 1:35996/150‑1 (MQ=255) tgtTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGTGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGc > 1:1273170/1‑150 (MQ=255) ttCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGccc < 1:2028294/150‑1 (MQ=255) gcagcCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGt < 1:923865/150‑1 (MQ=255) gcagcCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCCTAG‑CTTCCGCATGCGCGATCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCGCGTGGCTGCCCAGGt < 2:1165605/150‑1 (MQ=255) agcCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGa > 1:2240091/1‑103 (MQ=255) agcCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGa < 2:2240091/103‑1 (MQ=255) agcCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGc > 2:820138/1‑150 (MQ=255) gAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGACGGGCGC‑CGAGCAGGCGTGTACTGAGACCTGCAAGGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAggt < 2:24941/150‑1 (MQ=255) aaCAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCg < 1:2399057/129‑1 (MQ=255) aaCAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCg > 2:2399057/1‑129 (MQ=255) cAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAggtggg < 1:2115926/150‑1 (MQ=255) gggTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAggtggggt < 1:1656250/150‑1 (MQ=255) gggTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAggtggggt < 1:963413/150‑1 (MQ=255) gggTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGAGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCGGCCGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAggtggggt < 2:828725/150‑1 (MQ=255) ggTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAggtggggtg < 1:2268715/150‑1 (MQ=255) gTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAggtggggtgg > 2:1695319/1‑150 (MQ=255) ccgcatttcgtccaccccaccttgcacctgggcagccacgagaccattGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAAt > 2:1374295‑M1/49‑115 (MQ=255) ccgcatttcgtccaccccaccttgcacctgggcagccacgagaccattGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAAt < 1:1374295‑M1/67‑1 (MQ=255) tCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTgg > 1:1035298/1‑120 (MQ=255) tCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTgg < 2:1035298/120‑1 (MQ=255) tCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGaaa < 1:1187434/150‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGgcg < 2:2380669/80‑1 (MQ=255) cGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGgcg > 1:2380669/1‑80 (MQ=255) cTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGACGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGCGCAACGTGGGGTGGAAGAAATGc > 2:179149/1‑150 (MQ=255) tGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCg > 1:522509/1‑150 (MQ=255) tGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCg < 1:1790596/150‑1 (MQ=255) gCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCa > 1:1051585/1‑80 (MQ=255) gCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCa < 2:1051585/80‑1 (MQ=255) ccGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCa > 1:1649100/1‑150 (MQ=255) ccGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGAAGGGGTTTGcc > 1:42392/1‑89 (MQ=255) cGAGCTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCaa < 1:233206/150‑1 (MQ=255) cGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCaa < 1:818228/150‑1 (MQ=255) cGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCaa < 1:818217/150‑1 (MQ=255) gAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCaa > 2:681641/1‑98 (MQ=255) gAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCaa < 1:681641/98‑1 (MQ=255) gAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAg > 2:718289/1‑150 (MQ=255) aaCTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGcc > 2:293013/1‑86 (MQ=255) aaCTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGcc < 1:293013/86‑1 (MQ=255) aaCTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCgg > 1:203182/1‑143 (MQ=255) aaCTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCgg < 2:203182/143‑1 (MQ=255) aaCTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAgg < 1:820138/150‑1 (MQ=255) cTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGtt < 2:1953139/150‑1 (MQ=255) cTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGtt < 2:1462374/150‑1 (MQ=255) tCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTg > 2:2264594/1‑54 (MQ=255) tCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTg < 1:2264594/54‑1 (MQ=255) tCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTg > 1:1000021/1‑150 (MQ=255) gATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAAcc > 1:2348007/1‑150 (MQ=255) tGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGccc > 1:1539712/1‑150 (MQ=255) gcgcTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGtt < 1:1679344/150‑1 (MQ=255) cgcTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTg < 1:354695/150‑1 (MQ=255) tCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCaa < 2:1502478/73‑1 (MQ=255) tCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCaa > 1:1502478/1‑73 (MQ=255) tCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAATGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTGCgt > 1:980573/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTGCgt > 1:1832254/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCGCCGGC‑‑CAGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAg < 1:1365043/99‑1 (MQ=255) tCGCGGCGCCGGC‑‑CAGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAg > 2:1365043/1‑99 (MQ=255) | CAGGAACAGGTACAGGCGCTCTGGGTGCAGGCGCGGGTGGGCCAGTAGATGAGCCAGCTGCGGGTGGGCACGGTTGACCGTGTTCAGCAGCCAGAACAGGGTTACATCGCTGGAGCCGAACTCGGCGATCTGGTCGGCGCGCTCGCGGCGCCGGC‑‑CGGAAAGCGCCTTGCTCTTGGCCTGCAGGGCGC‑CGAGCAGGCGTTTGCCGATGCCGGCAATGGTCTCGTGGCTGCCCAGGTGCAAGGTGGGGTGGACGAAATGCGGGTCAAGGTTGAAACCGCCCATGCTGTTGCGT > NC_002947/3487241‑3487532 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |