New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3712440 = | 83 (0.890) | 8 (0.090) | 6/238 | NT | 9.6% | coding (599/990 nt) | paaA | ring 1,2‑phenylacetyl‑CoA epoxidase subunit alpha |
? | NC_002947 | 3712481 = | 72 (0.810) | coding (558/990 nt) | paaA | ring 1,2‑phenylacetyl‑CoA epoxidase subunit alpha |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CGGTCTGGTCGATGAAGCGCTGGCGCAGTTCGTCGTTGGTCTGGCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGGCGCTGGTGGAAGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAGGGGCCGTAAGAGGTGCGCTGCAGTACCACCTGGT > NC_002947/3712291‑3712587 | tgggcgctgtgggctggctggtggacggcgccgccatcgtcaaccaggtggtactgcagcgcacctcttacggcccctactcccgcgcgatgatccgtatctgcaaggaagagagcttccaccagcgccagggctacgaaatgctcctga > 2:667220‑M1/150‑150 (MQ=255) ggTCGATGCATCTCTGGCGCAGTTCGTCGTTGGTCTGGCGGTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGt < 1:1283850/150‑1 (MQ=255) cGATGAAGCGCTGGCGCAGTTCGTCGTTGGTCTGGCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTcgc > 2:346788/1‑150 (MQ=255) gATGAAGCGCTGGCGCAGTTCGTCGTTGGTCTGGCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTcgcg > 1:2142307/1‑150 (MQ=255) gATGAAGCGCTGGCGCAGTTCGTCGTTGGTCTGGCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTcgcg > 1:479785/1‑150 (MQ=255) aaGCGCTGGCGCAGTTCGTCGTTGGTCTGGCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTgg < 1:1876811/150‑1 (MQ=255) aGCGCTGGCGCAGTTCGTCGTTGGTCTGGCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTTGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTggg < 2:1980191/150‑1 (MQ=255) tGGCGCAGTTCGTCGTTGGTCTGGCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTgg < 2:407549/150‑1 (MQ=255) tGGCGCAGTTCGTCGTTGGTCTGGCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTgg < 2:2142307/150‑1 (MQ=255) gcAGTTCGTCGTTGGTCTGGCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGc > 1:1855497/1‑150 (MQ=255) gcAGTTCGTCGTTGGTCTGGCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGc > 1:686622/1‑150 (MQ=255) gTTCGTCGTTGGTCTGGCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGccca > 1:2093390/1‑149 (MQ=255) ttCGTCGTTGGTCTGGCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGt > 2:1997147/1‑128 (MQ=255) ttCGTCGTTGGTCTGGCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGt < 1:1997147/128‑1 (MQ=255) gtcgtTGGTCTGGCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGgcg > 2:1584888/1‑150 (MQ=255) ttgtTGGTCTGGCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGgcgc < 1:1852293/148‑1 (MQ=255) gtTGGTCTGGCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGcat < 1:2031300/150‑1 (MQ=255) cgtcaaccaggtggtactgcagcgcacctcttacggcccctactcccgcgcgatgatccgtatctgcaaggaagagagcttccaccagcgccagggctacgaaatgctcctgA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGcatcat > 2:2267578‑M1/113‑150 (MQ=255) tcaaccaggtggtactgcagcgcacctctttcggcccctcctcccgcgcgatgatccgtatctgcaaggaagagagcttccaccagcgccagggctacgaaatgctcctgAACCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATg > 2:779741‑M1/111‑150 (MQ=255) tCTGGCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATgg > 2:1574799/1‑150 (MQ=255) tCTGGCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCAGGCGCATCATgg < 2:2093390/150‑1 (MQ=255) gCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAg > 2:2362950/1‑150 (MQ=255) gCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTATTGGTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAg < 1:1774232/150‑1 (MQ=255) cGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAgg < 1:346788/150‑1 (MQ=255) gTTTGAGCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGa < 2:915113/150‑1 (MQ=255) tttGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAg > 1:986048/1‑150 (MQ=255) tttGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAg > 1:2297914/1‑150 (MQ=255) gATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCAt > 2:530974/1‑150 (MQ=255) 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cAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAg < 2:1100067/150‑1 (MQ=255) aGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGc > 1:920662/1‑150 (MQ=255) cATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTg < 2:236638/150‑1 (MQ=255) cATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTg > 2:550148/1‑150 (MQ=255) gACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGgcgc > 1:1955193/1‑150 (MQ=255) 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gcgcCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGGCGCTGGTGGAAGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAgg > 1:936694/1‑150 (MQ=255) gcgcCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGGCGCTGGTGGAAGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAgg < 1:550148/150‑1 (MQ=255) gcgcCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGGCGCTGGTGGAAGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAgg < 1:808890/150‑1 (MQ=255) gcCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGGCGCTGGTGGAAGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAgggg > 2:1885247/1‑150 (MQ=255) gCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGGCGCTGGTGGAAGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAGGGGCCGt < 2:1955193/150‑1 (MQ=255) caccacAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGGCGCTGGTGGAAGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAGGGGCCGTaa > 2:1765812/1‑150 (MQ=255) caccacAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGGCGCTGGTGGAAGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAGGGGCCGTaa < 1:1674610/150‑1 (MQ=255) ggCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGGCGCTGGTGGAAGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAGGGGCCGTAAGAGGTgc < 1:1765812/150‑1 (MQ=255) ggTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGGCGCTGGTGGAAGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAGGGGCCGTAagag > 2:2339818/1‑143 (MQ=255) ggTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGGCGCTGGTGGAAGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAGGGGCCGTAagag < 1:2339818/143‑1 (MQ=255) ttGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCGGGCGCTGGTGGAAGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAGGGGCCGTAAGAGGTGCGCTGc > 2:29155/1‑150 (MQ=255) tGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGGCGCTGGTGGAAGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGAACGTAGGGGCCGTAAGAGGTGCGCTGCa < 1:323468/150‑1 (MQ=255) aTGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGGCGCTGGTGGAAGCTCAATACCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAGGGGCCGTAAGAGGTGCGCTGCAga > 2:323468/1‑149 (MQ=255) tGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGGCGCTGGTGGAAGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAGGGGCCGTAAGAGGTGCGCTGCAGTa < 1:2362950/150‑1 (MQ=255) tGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCATGGCGCAGCATGGTCAGGACCATTTCGTTGCCCTGGCGCTGGTCGACGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAGGGGCCGTAAGATGTCCGCTGCACTa > 2:535332/1‑150 (MQ=255) cTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGGCGCTGGTGGAAGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAGGGGCCGTAAGAGGTGCGCTGCAGTACCACCTg < 2:2297914/150‑1 (MQ=255) tGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGGCGCTGGTGGAAGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAGGGGCCGTa > 2:339270/1‑125 (MQ=255) tGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGGCGCTGGTGGAAGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAGGGGCCGTa < 1:339270/125‑1 (MQ=255) tGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGGCGCTGGTGGAAGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAGGGGCCGTAAGAGGTGCGCTGCAGTACCACCTgg < 2:2270617/150‑1 (MQ=255) gAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGGCGCTGGTGGAAGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAGGGGCCGTAAGAGGTGCGCTGCAGTACCACCTGGt > 2:2292025/1‑150 (MQ=255) | CGGTCTGGTCGATGAAGCGCTGGCGCAGTTCGTCGTTGGTCTGGCGTTTGATCTTCCAGGCCATCGACTGGGCGCTGTTGGGCGAGTGTTCATCGCTCGGGCCGAACATCATCAGCGCCGGCCACCACAGGCGGTTGATGGCGTCCTGAA‑CCATGTCGCGCTGGGCTTGGGTGCCCTGGCGCATCATGGTCAGGAGCATTTCGTAGCCCTGGCGCTGGTGGAAGCTCTCTTCCTTGCAGATACGGATCATCGCGCGGGAGTAGGGGCCGTAAGAGGTGCGCTGCAGTACCACCTGGT > NC_002947/3712291‑3712587 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |