New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4071847 | 87 (0.930) | 5 (0.050) | 5/244 | NT | 5.5% | coding (356/3099 nt) | mdtB | multidrug transporter membrane protein |
? | NC_002947 | = 4071885 | 88 (0.970) | coding (318/3099 nt) | mdtB | multidrug transporter membrane protein |
TTTGCGCAAGCTTTTGCGCCACGCGGGTATCGACCAGGTCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGG > NC_002947/4071698‑4071996 | tttGCGCAAGCTTTTGCGCCACGCGGGTATCGACCAGGTCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCA > 1:2446503‑M1/1‑150 (MQ=255) gcAAGCTTTTGCGCCACGCGGGTATCGACCAGGTCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAgg < 2:200906/150‑1 (MQ=255) aaGCTTTTGCGCCACGCGGGTATCGACCAGGTCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACGTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGtt > 1:527806/1‑150 (MQ=255) aaGCTTTTGCGCCACGCGGGTATCGACCAGGTCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGtt > 1:1966716/1‑150 (MQ=255) aaGCTTTTGCGCCACGCGGGTATCGACCAGGTCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGtt > 1:2138555/1‑150 (MQ=255) aaGCTTTTGCGCCACGCGGGTATCGACCAGGTCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGtt < 1:2412858/150‑1 (MQ=255) gCTTTTGCGCCACGCGGGTATCGACCAGGTCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGc < 2:527806/150‑1 (MQ=255) gcCACGCGGGTATCGACCAGGTCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAacaggtgcaggccgcga > 2:945466‑M1/1‑133 (MQ=255) ccACGCGGGTATCGACCAGGTCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGAGGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGt < 1:626090/150‑1 (MQ=255) cACGCGGGTATCGACCAGGTCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGtt > 2:2093519/1‑150 (MQ=255) aCGCGGGTATCGACCAGGTCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACAACTGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTg > 1:1453672/1‑150 (MQ=255) ggTATCGACCAGGTCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑ACAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATcgc < 2:2053149/150‑1 (MQ=255) gACCATGTCTTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAgcaggttgcaggccgcgaccaacgccgccag < 1:1696255‑M1/150‑32 (MQ=255) gACCAGGTCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTg > 2:1980510/1‑150 (MQ=255) aCCAGGTCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCCTGGTCTTGCTGGAGCTGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGc > 2:2426443/1‑150 (MQ=255) aCCAGGTCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGc > 2:826529/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCa > 2:2432731/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGACCGGGTCTGCACCGGGGTGTCGGCCGTGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGcc > 1:1864353/1‑149 (MQ=255) 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cTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGa > 1:287284/1‑150 (MQ=255) gttgtACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGc > 2:1156126/1‑150 (MQ=255) ttgtACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGcc > 1:1788734/1‑150 (MQ=255) cacCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTg > 2:899331/1‑150 (MQ=255) acCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCCGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGt > 1:1244871/1‑150 (MQ=255) acCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGt < 2:1628088/150‑1 (MQ=255) acCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGt > 1:478732/1‑150 (MQ=255) cggcggTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTc > 2:2341741/1‑150 (MQ=255) cggcggTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTc > 2:2341702/1‑150 (MQ=255) cggcggTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTc < 1:2432731/150‑1 (MQ=255) gTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGc > 1:495428/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCa > 2:1269394/1‑150 (MQ=255) cACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGCCGCACCCCCCTAACTGGTCGCGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGc > 1:1841878/1‑150 (MQ=255) cACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGc > 2:2375057/1‑150 (MQ=255) cACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGc < 2:1788734/150‑1 (MQ=255) aCTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGcc > 1:781624/1‑150 (MQ=255) tGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGa > 1:1166637/1‑150 (MQ=255) ggCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTtgcccagtgacctgccggcaccgccggtgtacaacaaggtcaacccggccgacaccccggtgctgaccctggccatctccagcaagaccatgccgctgcccaagctca < 1:835969‑M2/150‑109 (MQ=255) gcagcaGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTtgcccagtgacctgccggcaccgccggtgtacaacaaggtcaacccggccgacaccccggtgctgaccctggccatctccagcaagaccatgccgctgcccaagctcaa < 2:2215483‑M2/150‑110 (MQ=255) cagcagGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTTGCTTGGCACCTTGCATGTTTATTTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTg < 1:535330/150‑1 (MQ=255) agcagGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTtgcccagtgacctgccggcaccgccggtgtacaacaaggtcaacccggccgacaccccggtgctgaccctggccatctccagcaagaccatgccgctgcccaagctcaacg < 1:945466‑M2/150‑112 (MQ=255) | TTTGCGCAAGCTTTTGCGCCACGCGGGTATCGACCAGGTCGTTGAGCTTGGGCAGCGGCATGGTCTTGCTGGAGATGGCCAGGGTCAGCACCGGGGTGTCGGCCGGGTTGACCTTGTTGTACACCGGCGGTGCCG‑GCAGGTCACTGGGCAGCAGGTTGCTGGCGGCGTTGATCGCGGCCTGCACCTGTTGCTCGGCAACGTCCATGTTCATGTCGAGGTTGAAACGCAAGGTCAGCACCGACGCACCGCCAGAACTGGTCGAGGCCATCTGTTCCAGGCCCGGCATCTGGCCGAACTGG > NC_002947/4071698‑4071996 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |