New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4575566 = | 83 (0.890) | 5 (0.060) | 5/230 | NT | 5.7% | intergenic (+40/‑82) | glgX/ybhP‑II | glycogen debranching enzyme/phosphohydrolase |
? | NC_002947 | 4575613 = | 88 (1.030) | intergenic (+87/‑35) | glgX/ybhP‑II | glycogen debranching enzyme/phosphohydrolase |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
TACCGACCGGCCGGAGTTGCGCAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGC > NC_002947/4575418‑4575714 | tACCGACCGGCCGGAGTTGCGCAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTAGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACG > 2:2255346‑M1/1‑150 (MQ=255) ccggttgaaggcggtgaagcccttgtgggtattcaccgtcagtacccgcaggcgtttcacggccggggcctggctgacgctggcgaaaccattactgccggcttcgaggctcacgattcctcctgaagttaaccctgcctcactgtcgcc < 1:1338876‑M1/1‑1 (MQ=255) cggttgaaggcggtgaagcccttgtgggtattcaccgtcagtacccgcaggcgtttcacggccggggcctggctgacgctggcgaaaccattactgccggcttcgaggctcacgattcctcctgaagttaaccctgcctcactgtcgccg > 1:1810611‑M1/149‑150 (MQ=255) accgaccgGCCGGAGTTGCGCAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGC < 2:1138201‑M1/150‑1 (MQ=255) accgaccgGCCGGAGTTGCGCAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGC < 2:232945‑M1/150‑1 (MQ=255) ggttgaaggcggtgaagcccttgtgggtattcaccgtcagtacccgcaggcgtttcacggccggggcctggctgacgctggcgaaaccattactgccggcttcgaggctcacgattcctcctgaagttaaccctgcctcactgtcgccgc > 1:2402998‑M1/148‑150 (MQ=255) ttgaaggcggtgaagccctgatggtgattcaccgtcagtacccgcaggcgtttcacggccggggcatcgcacacgctggcgaaaccattactgccggcttcgaggctcacgattcctcctgaagttaaccctgcctcactgtcgcCGCCa > 1:1731659‑M1/146‑150 (MQ=255) accgGCCGGAGTTGCGCAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAA > 2:1702991‑M1/1‑150 (MQ=255) ccggccggAGTTGCGCAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAAC < 1:428862‑M1/150‑1 (MQ=255) aggcggtgaagcccttgtgggtattcaccgtcagtacccgcaggcgtttcacggccggggcctggctgacgctggcgaaaccattactgccggcttcgaggctcacgattcctcctgaagttaaccctgcctcactgtcgcCGCCAAAcc < 2:1711562‑M1/9‑1 (MQ=255) aggcggtgaagcacttgcgggtattcaccgtcagtacccgcaggcgtttcacggccggggcctggctgacgctggcgaaaccattactgccggcttcgaggctcacgattcctcctgaagttaaccctgcctcactgtcgcCGCCAAAcc < 2:2112247‑M1/9‑1 (MQ=255) cggAGTTGCGCAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGt < 1:1671590/150‑1 (MQ=255) gcgcAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACg < 2:1714861/150‑1 (MQ=255) 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gaggagTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGa > 2:2269769/1‑134 (MQ=255) gaggagTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGa < 1:2269769/134‑1 (MQ=255) gaggagTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGCGCCTAGCACCCGGGAg > 2:1357226/1‑150 (MQ=255) ggagTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTa > 1:1481133/1‑150 (MQ=255) aaCGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCg < 1:1447037/138‑1 (MQ=255) aaCGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCg > 2:1447037/1‑138 (MQ=255) aaCGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGtt > 1:897681/1‑150 (MQ=255) gTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGc > 1:2112247/1‑150 (MQ=255) caggcag‑gTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAg < 1:36020/150‑1 (MQ=255) gcag‑gTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAg < 1:2399259/147‑1 (MQ=255) gcag‑gTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAg > 2:2399259/1‑147 (MQ=255) ag‑gTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAgg > 1:33846/1‑85 (MQ=255) ag‑gTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAgg < 2:33846/85‑1 (MQ=255) g‑gTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGc > 2:671608/1‑150 (MQ=255) g‑gTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGc > 1:2044465/1‑150 (MQ=255) gTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCTCCCACAGGGTTTGGCGGCGATAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGAGTCAGCCAGGcc > 2:1325975/1‑150 (MQ=255) gTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACACCGTGGGAAAGTTTTACCGCCCCCCACAGTGTTTGGCGGCGACAGTGA‑GCGGGGCGGACAGAAAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGACAGCGTTATCCAGGcc > 1:1751314/1‑150 (MQ=255) cTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCa < 1:1249508/90‑1 (MQ=255) cTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCa > 2:1249508/1‑90 (MQ=255) cTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCg > 1:1302111/1‑150 (MQ=255) cTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAA‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCg > 1:728755/1‑150 (MQ=255) gTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAg > 1:2022911/1‑115 (MQ=255) gTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAg < 2:2022911/115‑1 (MQ=255) gccacgccaAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctcgtcgtactgcaacaccatcagcagcatcgaccgacccttcacctcgaacgt < 1:1048629‑M2/150‑110 (MQ=255) gccacgccaAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGcc > 1:2134635/1‑150 (MQ=255) ccacgccaAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCt > 1:2101205/1‑150 (MQ=255) cacgccaAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTg > 1:521305/1‑150 (MQ=255) cacgccaAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTg > 1:480594/1‑150 (MQ=255) cgccaAACCCtgtgggggccggtacaccgttcccaccgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctcgtcgtactgcaacaccatcagcagcatcgaccgacccttcacctcgaacgtacta < 2:951383‑M1/150‑141 (MQ=255) | TACCGACCGGCCGGAGTTGCGCAAGGGGCAGCACCTGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAG‑GTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAAC‑TTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGC > NC_002947/4575418‑4575714 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |