| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4577848 | 91 (0.980) | 9 (0.100) | 9/240 | NT | 9.2% | intergenic (+13/+96) | PP_4057/glgB | membrane protein/1,4‑alpha‑glucan branching enzyme |
| ? | NC_002947 | = 4577923 | 90 (1.000) | intergenic (+88/+21) | PP_4057/glgB | membrane protein/1,4‑alpha‑glucan branching enzyme | |||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
TTGGGATTGGGGCTGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGA > NC_002947/4577704‑4577997 | gATTGGGGCTGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCggg < 2:1375865/150‑1 (MQ=255) gATTGGGGCTGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCggg < 2:2395130/150‑1 (MQ=255) ttGGGGCTGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTa > 2:2081391/1‑150 (MQ=255) ggCTGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGGTGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAcc > 1:1197359/1‑150 (MQ=255) ggtggCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCt < 1:2172002/150‑1 (MQ=255) gtggCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:528670/150‑1 (MQ=255) gtggCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTAGCGGGTAAACCCGCTc > 2:1099650/1‑150 (MQ=255) gcgGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTaca < 1:1403198/150‑1 (MQ=255) gTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACggg > 2:1297938/1‑150 (MQ=255) aCGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTATGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCa > 1:182535/1‑150 (MQ=255) cGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCAc > 1:235601/1‑150 (MQ=255) cTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 1:1975071/1‑134 (MQ=255) cTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 2:1975071/134‑1 (MQ=255) ggTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATCACAGCAGTGATGAGCACGACAATAGCTTGAACGGATTGATTGGCATAGTTACGCGTACGGACTTTGTGGT‑CGCAGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCCGGAGCACCGCCggg > 1:1125273/1‑150 (MQ=255) gTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGggt < 1:2122788/150‑1 (MQ=255) gCGTTGGTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGggtgcg < 2:119778/150‑1 (MQ=255) gttCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGcc > 1:868484/1‑150 (MQ=255) gTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCg > 2:1368227/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTa < 2:2253041/150‑1 (MQ=255) gcgcCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCtttcgcgggagacccgttc > 2:2336547‑M1/1‑93 (MQ=255) gcgcCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCtttcgcgggagacccgttc < 1:2336547‑M1/112‑20 (MQ=255) ccGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAAc < 1:1687657/150‑1 (MQ=255) cGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCAcc < 2:361824/123‑1 (MQ=255) cGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCAcc > 1:361824/1‑123 (MQ=255) 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tgtgGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCATGGCCGGCCCcttcgcgggagacccgttcctacgcaggcaccgcacccggcggtgacccgtgtaggagcgggtttacccgcgaagg < 1:1446157‑M1/150‑77 (MQ=255) tgtgGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAg > 2:403052‑M2/1‑149 (MQ=255) gtgGATGACAATGCCCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAgg > 1:171219‑M2/1‑148 (MQ=255) tgGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCTGGCCCtttcgcgggagacccgttcctacgcaggcaccgcacccggcggtgacccgtgtaggagcgggtttacccgcggagggg < 2:221586‑M1/150‑79 (MQ=255) tgGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAggg > 2:2195990‑M2/1‑147 (MQ=255) gATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAgggcc < 2:403175‑M2/150‑6 (MQ=255) aTGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCtttcgcgggagacccgttcctacgcaggcaccgcacccggcggtgacccgtgtaggagcgggtttacccgcgaaggggccg < 2:2395323‑M1/150‑82 (MQ=255) gACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACgg > 2:873606/1‑95 (MQ=255) gACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGt < 1:1034324/150‑1 (MQ=255) gACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGt > 1:1358933/1‑150 (MQ=255) gACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGGGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACgg < 1:873606/95‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |