New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4577861 = | 98 (1.050) | 19 (0.210) | 14/240 | NT | 17.7% | intergenic (+26/+83) | PP_4057/glgB | membrane protein/1,4‑alpha‑glucan branching enzyme |
? | NC_002947 | 4577913 = | 83 (0.930) | intergenic (+78/+31) | PP_4057/glgB | membrane protein/1,4‑alpha‑glucan branching enzyme |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
GGCTGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCG > NC_002947/4577714‑4578010 | tcgaatgtcggcaatctcggggcggtggccagtgacgaagtggccagccacgggcagccattatcgctggccctgaaccttccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccctttcgcgggagAc < 2:1078394‑M1/2‑1 (MQ=255) tcgaatgtcggcaatctcggggcggtggccagtgacgaagtggccagccacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccctttcgcgggagAc < 1:1064188‑M1/2‑1 (MQ=255) ggCTGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAcc > 2:1711396/1‑150 (MQ=255) ggtggCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCt < 1:2172002/150‑1 (MQ=255) gtggCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTAGCGGGTAAACCCGCTc > 2:1099650/1‑150 (MQ=255) gcgGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTaca < 1:1403198/150‑1 (MQ=255) gTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACggg > 2:2403812/1‑150 (MQ=255) aCGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTATGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCa > 1:182535/1‑150 (MQ=255) cGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCAc > 1:235601/1‑150 (MQ=255) cTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 1:1975071/1‑134 (MQ=255) ggTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATCACAGCAGTGATGAGCACGACAATAGCTTGAACGGATTGATTGGCATAGTTACGCGTACGGACTTTGTGGT‑CGCAGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCCGGAGCACCGCCggg > 1:1125273/1‑150 (MQ=255) gTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGggt < 1:2122788/150‑1 (MQ=255) cagtgacgaagtggccagccacgggcagccattatcgctggcgatgaaattgtcgccgtggggagggttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccctttcgcgggtaaACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGggtg < 1:1864300‑M1/30‑1 (MQ=255) gCGTTGGTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGggtgcg < 2:119778/150‑1 (MQ=255) acgaagtggccagccacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggagtgttgatcatgaagcccgcctgatcggtaggcagggccggccccttcgcgggtaaACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGggtgcggtg < 1:611615‑M1/35‑1 (MQ=255) gttCGTCAGCGCCGAGTACAGCAGGGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTTGCAGCCTT‑GGGGTGCGGCTGCGGTTGTAGGCAGGGCCGTCCCCTTCGCGGGTAAACCCTCTCCTGCACGTGTCACCGCCGGGTGCGGTGcc > 2:196141/1‑150 (MQ=255) gTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCg > 2:1368227/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTa < 2:2253041/150‑1 (MQ=255) 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cacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccctttcgcgggagACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACgg > 1:1272607‑M1/101‑150 (MQ=255) cacgggcagccattatcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccctttcgcgggagACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACgg > 1:1100230‑M1/101‑150 (MQ=255) acgggcagccattatcgctggccctgaaccttccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccctttcgcgggagACCCGTTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACggg > 1:1078394‑M1/100‑150 (MQ=255) cagTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCcg > 1:26760/1‑150 (MQ=255) aTGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGaaa < 2:235601/150‑1 (MQ=255) tgtgGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAg > 2:403052‑M2/1‑149 (MQ=255) atcgctggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccccttcgcgggtaaACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGaaa > 2:2350860‑M1/88‑150 (MQ=255) gtgGATGACAATGCCCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAgg > 1:171219‑M2/1‑148 (MQ=255) tgGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAggg > 2:2195990‑M2/1‑147 (MQ=255) ggATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAgggc > 2:1289349‑M2/1‑146 (MQ=255) gATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAgggcc < 2:403175‑M2/150‑6 (MQ=255) ggccctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccccttcgcgggtaaACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCa > 1:896945‑M1/82‑150 (MQ=255) gACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGt < 1:1034324/150‑1 (MQ=255) gACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGt > 1:1358933/1‑150 (MQ=255) gACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGt > 1:1455258/1‑150 (MQ=255) gACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGGGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACgg < 1:873606/95‑1 (MQ=255) cctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccccttcgcgggtaaACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGggtgcg < 2:2284462‑M1/32‑1 (MQ=255) cctgaacctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtactggccccttcgcgggtaaACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGggtgcg > 1:2284462‑M1/79‑110 (MQ=255) cAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAgg > 2:6874‑M2/1‑140 (MQ=255) ccTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCaa < 2:1125273/150‑1 (MQ=255) ctgccgccgttgggggtgttgatcatgaagcccgcctgatcggttggctgtaccggccccttcgcgggtaaACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCaa > 2:300221‑M1/72‑150 (MQ=255) cTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACgg < 1:1092366/86‑1 (MQ=255) cTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAAc < 1:1711396/150‑1 (MQ=255) tGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAAcc < 2:539782/150‑1 (MQ=255) cGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATc < 2:901527/150‑1 (MQ=255) gggTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGAACACCAAACCgctac > 2:2352496/1‑146 (MQ=255) gggTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTAGAGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCa > 1:1013572/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) gtAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCa < 1:1986518/115‑1 (MQ=255) tAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTCAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAg < 2:2317993/150‑1 (MQ=255) tAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGTCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAg > 2:1330143/1‑150 (MQ=255) cAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTc > 1:1532798/1‑150 (MQ=255) gggCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAg < 1:89088/150‑1 (MQ=255) ggccggccCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAAcggc 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gccCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGCTGAACACACCCAACGTCGGCAGGGTCAGGGCCAg > 1:748970/1‑150 (MQ=255) gccCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAg > 1:489317/1‑150 (MQ=255) ccccTCCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAgggccagccctgcctaccaccgcatccgcaccccaaggctgccaatcaacccgttcaggtcattgtcatcca < 2:221586‑M2/150‑73 (MQ=255) caccTTCGCGGGGAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGc > 2:958510/3‑150 (MQ=255) ccTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCa > 2:278373/1‑82 (MQ=255) ccTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCa < 1:278373/82‑1 (MQ=255) 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ACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCg < 1:1443417‑M1/150‑1 (MQ=255) | GGCTGGTGGCGCGGGTGACGCCTTCGGTGGCGTTGTTCGTCAGCGCCGATTACAGCAGTGATGTGGATGACAATGACCTGAACGGGTTGATTGGCAGCCTT‑GGGGTGCGGATGCGGTGGTAGGCAGGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGGTCACCGCCGGGTGCGGTGCCTGCGTAGGAACGGGTCTCCCGCGAAAGGGCCAGTACAGCCAACCGATCAGGCGGGCTTCATGATCAACACCCCCAACGGCGGCAGGTTCAGGGCCAGCGATAATGGCTGCCCG > NC_002947/4577714‑4578010 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |