New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4773349 = | 116 (1.240) | 7 (0.080) | 7/240 | NT | 6.1% | coding (5963/10413 nt) | pvdD | non‑ribosomal peptide synthetase |
? | NC_002947 | 4773394 = | 105 (1.170) | coding (5918/10413 nt) | pvdD | non‑ribosomal peptide synthetase |
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
CACCATGTAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCA > NC_002947/4773201‑4773498 | tgcccgatccgttcgatgagcagggcgggcgtctgtaccgcactggcgacctggcgcgctatcgcccggacggtgtgatcgattacgccgggcgtatcgaccaccaggtaaaaattcggggcctgcgtatcgagctgggtgagatcgaAg < 2:1248736‑M1/2‑1 (MQ=255) aCCATGTAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGc > 1:889974/1‑150 (MQ=255) cccgatccgttcgatgagcagggcggtcgtctgtaccgcactggcgacctggcgcgctatcgcccggacggtgtgatcgattacgccgggcgtctcgactaccaggtaaaaattcgcggcctgcgtatcgagctgggtgagatcgaAGca < 2:666663‑M1/4‑1 (MQ=255) cccgatccgttcgatgagcagggcggtcgtctgtaccgcactggcgacctggcgcgctatcgcccggacggtgtgatcgattacgccgggcgtatgtcactcgatgtaaaaattcgcggcctgcgtatcgagctgggtgagatcgaAGca < 2:1882307‑M1/4‑1 (MQ=255) ccgatccgttcgatgagcagggcggtcgtctgtaccgcactggcgacctggcgcgctatcgcccggacggtgtgatcgattacgccgggcgtatcgaccaccaggtaaaaattcgcggcctgcgtatcgagctgggtgagatcgaAGcac < 2:2058377‑M1/5‑1 (MQ=255) tGTAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTGGCCGCTCAGGGCGCCCTGGATCAGcacca > 2:1240397/1‑150 (MQ=255) tAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACt < 2:2249698/150‑1 (MQ=255) tAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACt < 2:907943/150‑1 (MQ=255) aaTCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTg > 1:2013209/1‑150 (MQ=255) aaTCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTg > 1:776453/1‑150 (MQ=255) tCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGcc < 2:1632311/150‑1 (MQ=255) gttcgatgagcagggcggtcgtctgtaccgcactggcgacctggcgcgctatcgcccggacggtgtgatcgattacgccgggcgtatcgaccaccaggtaaaaattcgcggcctgcgtatcgagctgggtgagatcgaa > 2:226060‑M1/139‑139 (MQ=255) cAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTcgcg < 1:2000801/150‑1 (MQ=255) cAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTcgcg < 1:2045510/150‑1 (MQ=255) ccTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACtt > 2:1838343/1‑150 (MQ=255) ccTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACtt > 2:883042/1‑150 (MQ=255) ccTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACtt > 1:1891565/1‑150 (MQ=255) cTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTg > 2:1211302/1‑150 (MQ=255) 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2:710058/1‑128 (MQ=255) aGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTCTACCGTGGGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAAt < 1:1519247/150‑1 (MQ=255) gCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATc < 1:1815814/150‑1 (MQ=255) gCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATc > 1:229859/1‑150 (MQ=255) gCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGCCCGGGCGCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATc < 2:1891565/150‑1 (MQ=255) cccACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCg > 1:2058377/1‑150 (MQ=255) ccaccaGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCt > 2:366055/1‑123 (MQ=255) accaGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATc > 1:1213018/1‑150 (MQ=255) caGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTggtggt < 2:615210/125‑1 (MQ=255) gTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCacac > 1:481617/1‑150 (MQ=255) ttgcttgcCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACAcc < 1:104580/150‑1 (MQ=255) ttgcttgcCACTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACAcc > 2:1060359/1‑150 (MQ=255) gcttgcCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGt > 1:9522/1‑150 (MQ=255) ttgcCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGa < 1:2287713/139‑1 (MQ=255) ttgcCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGa > 2:2287713/1‑139 (MQ=255) ttgcCGCTCGGGCCGACATAGGCAAGCACCACTCCCGCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCATCGATCTCACCCAACTCGATACGCCGACCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCCAACCGTcc > 2:943695/1‑150 (MQ=255) gCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGc > 2:2134533/1‑126 (MQ=255) ggCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAgc > 2:306864/1‑150 (MQ=255) gCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAgcg > 1:2137234/1‑150 (MQ=255) gCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTCGTGGTCGG‑TTCGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAgcg > 1:982529/1‑150 (MQ=255) ccGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAgcgc > 1:1762311/1‑150 (MQ=255) tCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTc < 2:181965/49‑1 (MQ=255) ccAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGc > 2:795920/1‑150 (MQ=255) ccAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGc > 2:1939694/1‑150 (MQ=255) | CACCATGTAATCGGGCAAGCCCTGACCGAGGAAATGCGCCAGTTGCTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCA > NC_002947/4773201‑4773498 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |