| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 4773349 = | 116 (1.240) | 7 (0.080) | 7/240 | NT | 6.1% | coding (5963/10413 nt) | pvdD | non‑ribosomal peptide synthetase |
| ? | NC_002947 | 4773394 = | 105 (1.170) | coding (5918/10413 nt) | pvdD | non‑ribosomal peptide synthetase | |||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
CTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCGGGCAC > NC_002947/4773246‑4773542 | cTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTc < 1:1707563/150‑1 (MQ=255) tCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTc < 1:289738/149‑1 (MQ=255) tCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTc > 2:289738/1‑149 (MQ=255) aCGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCGGTGGTGAGCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGAt > 1:666663/1‑150 (MQ=255) aCGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGAt > 1:223418/1‑150 (MQ=255) aCGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGAt < 2:2422971/150‑1 (MQ=255) aGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCa < 2:1307207/150‑1 (MQ=255) tCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCAcc < 1:1211302/150‑1 (MQ=255) 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ccTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTACGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACa > 2:1686572/1‑150 (MQ=255) tCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAga > 1:46963/1‑150 (MQ=255) tCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGATCGATTACGCCGGGCGTatcgac < 1:517933/104‑6 (MQ=38) tCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGATCGATTACGCCGGGCGTatcgac > 2:517933/1‑99 (MQ=38) cgcACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCCCCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCCCACCGTCCGGGAGAGAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAgacga < 1:1145925/150‑1 (MQ=255) cgcACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAgacga < 1:2108824/150‑1 (MQ=255) aCTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCg > 1:483601/1‑150 (MQ=255) ttGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGcc > 1:1833390/1‑150 (MQ=255) ttGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGcc > 2:205250/1‑150 (MQ=255) ttGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACACCCGGCGTAAt > 1:1478260/1‑92 (MQ=255) ttGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACACCCGGCGTAAt < 2:1478260/92‑1 (MQ=255) caagtgcgcgaggcagtggtgctTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCt < 2:1586758‑M2/127‑1 (MQ=255) cGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGcc < 2:1782917/124‑1 (MQ=255) tCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGc > 1:152027/1‑100 (MQ=255) ggCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGaa < 1:2223410/150‑1 (MQ=255) ggCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGaa > 1:1093442/1‑150 (MQ=255) gTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGAt < 1:2046983/150‑1 (MQ=255) gtgctTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCgg < 2:2058377‑M2/145‑1 (MQ=255) tgctTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTAGTCGA‑GACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCggg < 2:666663‑M2/146‑1 (MQ=255) tgctTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACATCGAGTGACA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCggg < 2:1882307‑M2/146‑1 (MQ=255) gctTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATca > 2:1205909‑M2/4‑76 (MQ=255) gctTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATca < 1:1205909‑M2/73‑1 (MQ=255) tTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAAc < 1:226060‑M2/138‑1 (MQ=255) tTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAAc > 2:226060‑M2/2‑139 (MQ=255) tTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCGGGCAc > 2:2265510‑M2/2‑150 (MQ=255) | CTCACGCAGTCGCTGGCCCGCCTCGCTGCCCGGCTCGGCCTGCTCGGCAGCCATCGGCACCACATAGCCCACCAGTTGCTTGCCGCTCGGGCCGTCCTGGGCCAGCACCACTGCCTCGCGCACTTGGGCGTGCTCGGCCAGTCGTGCTTCGATCTCACCCAGCTCGATACGCAGGCCGCGAATTTTTACCTGGTGGTCGA‑TACGCCCGGCGTAATCGATCACACCGTCCGGGCGATAGCGCGCCAGGTCGCCAGTGCGGTACAGACGACCGCCCTGCTCATCGAACGGATCGGGCAC > NC_002947/4773246‑4773542 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |