| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 4899718 | 125 (1.340) | 7 (0.080) | 4/240 | NT | 5.6% | coding (72/438 nt) | PP_4308 | AsnC family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 4899750 | 117 (1.310) | coding (104/438 nt) | PP_4308 | AsnC family transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
ATAACCAAGGCATTTTCGCCAACCTACCTTTACTATCAAGGTAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTAC > NC_002947/4899575‑4899866 | agaaCCAAGGCATTTTCGCCAACCTACCTTTACTATCAAGGTAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCTACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAg < 1:2143268/148‑1 (MQ=255)aTAACCAAGGCATTTTCGCCAACCTACCTTTACTATCAAGGTAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTTAGGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAg > 1:2345113/1‑150 (MQ=255) cAAGGCATTTTCGCCAACCTACCTTTACTATCAAGGTAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAg > 2:440912/1‑150 (MQ=255) aaGGCATTTTCGCCAACCTACCTTTACTATCAAGGTAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAg < 2:284681/144‑1 (MQ=255) aGGCATTTTCGCCAACCTACCTTTACTATCAAGGTAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCg > 2:2109117/1‑150 (MQ=255) gCATTTTCGCCAACCTACCTTTACTATCAAGGTAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGGTCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCggg > 1:783997/1‑150 (MQ=255) cATTTTCGCCAACCTACCTTTACTATCAAGGTAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGc < 1:1687128/150‑1 (MQ=255) ttttCGCCAACCTACCTTTACTATCAAGGTAAATAACACGAATTACCTGCTGAGGCGGCCATGACCGATGACAATATCCAGTTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTg > 1:886283/1‑150 (MQ=255) ttttCGCCAACCTACCTTTACTATCAAGGTAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTg > 2:1653953/1‑150 (MQ=255) cAACCTACCTTTACTATCAAGGTAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCt > 2:1753388/1‑142 (MQ=255) cAACCTACCTTTACTATCAAGGTAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCt < 1:1753388/142‑1 (MQ=255) ctacctTTACTATCAAGGTAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAg > 2:3160/1‑150 (MQ=255) tacctTTACTATCAAGGTAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGc < 2:165148/150‑1 (MQ=255) aTCAAGGTAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCagcgagc < 2:44564/150‑1 (MQ=255) aTCAAGGTAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCAATCGAACAATTATTGATCAACGAAATTAAATAGTACTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCagcgagc > 1:885880/1‑150 (MQ=255) aGGTAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCAGGCGCTCGCTGacgctgggtgcggacagcccgctgacctgcgcca < 2:2200026‑M1/150‑35 (MQ=255) tAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTgcg > 2:706260/1‑150 (MQ=255) aaaTAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCAGGCGCTCGCTGacgctgggtgcggacagcccgctgacctgcgccagcgc < 2:347210‑M1/150‑39 (MQ=255) 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aCTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAgg < 1:745443/150‑1 (MQ=255) cTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGc < 2:1962636/150‑1 (MQ=255) cTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCATTTGGCTACCAGTTGCAGGc < 1:1160569/150‑1 (MQ=255) tCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCg > 2:1038107/1‑150 (MQ=255) tCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCg > 2:1384336/1‑150 (MQ=255) cgcgCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGCCCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGa < 1:1652763/150‑1 (MQ=255) gctcgctcAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTgg > 2:1943593/1‑127 (MQ=255) gctcgctcAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTgg < 1:1943593/127‑1 (MQ=255) ctcgctcAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCTAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTgcg > 2:1594226/1‑150 (MQ=255) tcgctcAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAgg < 2:1377215/139‑1 (MQ=255) tcgctcAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAgg > 1:1377215/1‑139 (MQ=255) tcgctcAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTgcgc > 2:1528352/1‑150 (MQ=255) tcAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTcagcgagcgcctgcgccttgagcgagcggcgcgagtcctccatcagtgcgttgatcaataattggtcgatggcatcggtcatacccacctcatcaggtaattcgtgt < 1:1533764‑M2/150‑108 (MQ=255) aaGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCAtccgt > 1:596462/1‑150 (MQ=255) aaGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCAtccgt > 2:804153/1‑150 (MQ=255) gg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCAtccgtcc > 2:922240/1‑150 (MQ=255) gg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCAtccgtcc < 1:1319168/150‑1 (MQ=255) g‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgcTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTcagcgagcgcctgcgccttgagcgagcggcgcgagtcctccatcagtgcgttgatcaataattggtcgatggcatcggtcatacccacctcatcaggtaattcgtgttattt < 2:347210‑M2/150‑113 (MQ=255) cgcTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCgg < 1:2396274/82‑1 (MQ=255) cgcTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCgg > 2:2396274/1‑82 (MQ=255) cTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTcagcgccttgagcgagcggcgcgagtcctccatcagtgcgttgat < 1:2203172‑M2/80‑46 (MQ=255) cTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTcagcgccttgagcgagcggcgcgagtcctccatcagtgcgttgat > 2:2203172‑M2/1‑35 (MQ=255) tGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGGCGGGAAGAGCGTGGCTATCTGCGCGGATAAAATTGTCAGTGCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTAc > 1:1355867/1‑150 (MQ=255) tGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTAc > 1:1556214/1‑150 (MQ=255) | ATAACCAAGGCATTTTCGCCAACCTACCTTTACTATCAAGGTAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTAC > NC_002947/4899575‑4899866 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |