New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 4899718 | 125 (1.340) | 7 (0.080) | 4/240 | NT | 5.6% | coding (72/438 nt) | PP_4308 | AsnC family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 4899750 | 117 (1.310) | coding (104/438 nt) | PP_4308 | AsnC family transcriptional regulator |
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
CTATCAAGGTAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTACCGGGGAAGCTGCAGGAGGTGGAGCGCCA > NC_002947/4899607‑4899894 | aTCAAGGTAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCAATCGAACAATTATTGATCAACGAAATTAAATAGTACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCagcgagc > 1:885880/1‑150 (MQ=255) tAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTgcg > 2:706260/1‑150 (MQ=255) acacGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTg > 2:1166349/1‑142 (MQ=255) acacGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTg < 1:1166349/142‑1 (MQ=255) cacGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTg > 1:1316011/1‑150 (MQ=255) acGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCGCCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTgg > 2:1249386/1‑150 (MQ=255) acGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTgg > 1:31177/1‑150 (MQ=255) gAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGaa < 2:886283/150‑1 (MQ=255) tACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAgc < 1:342021/150‑1 (MQ=255) ccTGATGAGGTGGGTGTGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAgcgt > 2:236050/1‑150 (MQ=255) ccTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAgcgt < 1:440912/150‑1 (MQ=255) gatgaGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAgcgtggc > 1:1133998/1‑150 (MQ=255) aGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGtgc < 2:31177/150‑1 (MQ=255) tGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGAc < 2:847494/129‑1 (MQ=255) 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< 1:1539087/150‑1 (MQ=255) ttGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCcgcgc < 1:3160/150‑1 (MQ=255) aTCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGcc > 2:2072547/1‑150 (MQ=255) aaCGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCagcga > 2:466605/1‑80 (MQ=255) aaCGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCagcga < 1:466605/80‑1 (MQ=255) aaCGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGtgctg < 2:165507/114‑1 (MQ=255) aaCGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGtgctg > 1:165507/1‑114 (MQ=255) 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ggCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCAtccgtcc < 1:1319168/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTcagcgagcgcctgcgccttgagcgagcggcgcgagtcctccatcagtgcgttgatcaataattggtcgatggcatcggtcatacccacctcatcaggtaattcgtgttattt < 2:347210‑M2/150‑113 (MQ=255) cgcTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCgg < 1:2396274/82‑1 (MQ=255) cgcTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTgg > 1:187183/1‑115 (MQ=255) gcTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCt > 1:218212/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTcagcgccttgagcgagcggcgcgagtcctccatcagtgcgttgat < 1:2203172‑M2/80‑46 (MQ=255) tGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTcagcgagcgcctgcgccttgagcgagcggcgcgagtcctccatcagtgcgttgatcaataattggtcgatggcatcggtcatacccacctcatcaggtaattcgtgttatttacct < 2:2200026‑M2/150‑117 (MQ=255) tGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGGCGGGAAGAGCGTGGCTATCTGCGCGGATAAAATTGTCAGTGCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTAc > 1:1355867/1‑150 (MQ=255) tGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTAc > 1:1556214/1‑150 (MQ=255) tGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTAc > 1:1162394/1‑150 (MQ=255) tGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTAc > 1:770242/1‑150 (MQ=255) cgcAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTcagcgccttgagcgagcggcgcgagtcctccatcagtgcgttgatcaataattggtcgatggcatcggtcatacccacctcatcaggtaattcgt < 2:2026523‑M2/126‑96 (MQ=255) cgcAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTcagcgccttgagcgagcggcgcgagtcctccatcagtgcgttgatcaataattggtcgatggcatcggtcatacccacctcatcaggtaattcgt > 1:2026523‑M2/1‑31 (MQ=255) gcAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGCCTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTACCggg > 1:738963/1‑150 (MQ=255) aGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCttt < 1:1562550/99‑1 (MQ=255) aGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCttt > 2:1562550/1‑99 (MQ=255) ggCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTACCgggg < 1:1664919/140‑1 (MQ=255) ggCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTACCgggg > 2:1664919/1‑140 (MQ=255) tGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTACCgg > 2:2256410/1‑135 (MQ=255) tGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTACCgg < 1:2256410/135‑1 (MQ=255) gTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCAGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTACCGGGGAAGCTGCAGGAGGt < 1:2129930/150‑1 (MQ=255) tCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTACCGGGGAAGCTGCAGGANGTg < 2:1511837/150‑1 (MQ=255) tCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTACCGGGGAAGCTGCAGGAGGTg < 2:596462/150‑1 (MQ=255) tCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTACCGGGGAAGCTGCAGGAGGTg < 1:236050/150‑1 (MQ=255) ccAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATCCAGTGGAGGTCGACATCCACTCCTTTGGGGAGCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTACCGGGGAAGCTGCAGGAGGTGGAGCGcc > 1:1484571/1‑150 (MQ=255) cAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTACCGGGGAAGCTGCAGGAGGTGGAGCGCCa < 2:218212/150‑1 (MQ=255) | CTATCAAGGTAAATAACACGAATTACCTGATGAGGTGGGTATGACCGATGCCATCGACCAATTATTGATCAACGCACTGATGGAGGACTCGCGCCGCTCGCTCAAGGCGCTGGCGCAGGTCAGCGGGCTGTCCGCACCCAGCGTCAGCGAGCGCCTGCGCCGACTGGAAGAGCGTGGCGTGCTGCGCGGCTATACCGTGGAGGTCGACCCGCGCGCCTTTGGCTACCAGTTGCAGGCGATCGTGCGCATCCGTCCGCTACCGGGGAAGCTGCAGGAGGTGGAGCGCCA > NC_002947/4899607‑4899894 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |