New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5277534 | 99 (1.060) | 8 (0.090) | 8/246 | NT | 7.5% | coding (447/1221 nt) | PP_4652 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 5277572 | 101 (1.100) | coding (485/1221 nt) | PP_4652 | membrane protein |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
CACCGACAACGTCACCCGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCA > NC_002947/5277387‑5277683 | cACCGACAACGTCACCCGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGtcggcctcggc > 2:1736846/1‑150 (MQ=255) cACCGACAACGTCACCCGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGtcggcctcggc > 1:1185467/1‑150 (MQ=255) gACAACGTCACCCGCGAACTGGTCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCAGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCAcc > 2:2197709/1‑150 (MQ=255) cACCCGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGc < 2:2061047/150‑1 (MQ=255) cACCCGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGc < 1:314402/150‑1 (MQ=255) ccGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGAc > 1:773163/1‑150 (MQ=255) aaCTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCg > 2:611606/1‑150 (MQ=255) tCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGgcgc < 2:2448787/150‑1 (MQ=255) tttGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCcg > 1:1040548/1‑150 (MQ=255) tttGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCcg > 1:1846987/1‑150 (MQ=255) tctGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGcccaccgccggcgccacgatggtcgccgactgggt > 1:1627601‑M1/1‑115 (MQ=255) tctGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGt > 1:1047088/1‑150 (MQ=255) tGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTgg < 2:421363/150‑1 (MQ=255) ggCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTggg > 1:1669431/1‑150 (MQ=255) gatttcctGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGcccaccgccggcgccacgatggtcgccgactgggtggcc < 2:698296‑M1/147‑40 (MQ=255) ccTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGcg > 2:1185467‑M2/1‑148 (MQ=255) cTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGcccaccgccggcgccacgatggtcgccgactgggtggccga < 2:1627601‑M1/150‑42 (MQ=255) cTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCgg > 1:1525106/1‑150 (MQ=255) 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gcCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGcc < 2:1047088/150‑1 (MQ=255) ccAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCt > 2:495004/1‑150 (MQ=255) ccAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGCCCCCTGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCt > 2:2400684/1‑150 (MQ=255) aGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGgccacccagtcggcgccacgatggtcgccgactg > 1:628555‑M1/1‑93 (MQ=255) aGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCttt < 1:1130949/150‑1 (MQ=255) 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cggGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTAGGCGGATTCCTGTATGCCGTTGACAGCGTGGGGGTGGTCGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCt > 1:2380058/1‑150 (MQ=255) gCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACgg < 2:573010/119‑1 (MQ=255) gCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACgg > 1:573010/1‑119 (MQ=255) ttCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTg > 2:2348940/1‑150 (MQ=255) ttCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTg > 2:249603/1‑150 (MQ=255) tCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGa < 1:1977815/150‑1 (MQ=255) tCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGGGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGa < 1:426479/150‑1 (MQ=255) ggCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCa < 2:1866588/150‑1 (MQ=255) ggCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCa < 2:2227512/150‑1 (MQ=255) gCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATATCTTTAGCAGCATGCGAGTGGGGTGCGCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAg < 1:1487156/150‑1 (MQ=255) cggcgTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCAtt < 1:844225/116‑1 (MQ=255) cggcgTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCAtt > 2:844225/1‑116 (MQ=255) cggcgTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGcgcgcg < 1:1355006/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGcgaggccgacgccgccactgcccgcgggaacagcccggccggtaccacattgggcaacagcgcctgggttgccggcat > 1:38984‑M2/1‑48 (MQ=255) gTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGcgaggccgacgccgccactgcccgcgggaacagcccggccggtaccacattgggcaacagcgcctgggttgccggcat < 2:38984‑M2/126‑79 (MQ=255) cctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTg > 1:728666/1‑41 (MQ=255) cctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTg < 2:728666/41‑1 (MQ=255) cctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGc < 1:1928589/109‑1 (MQ=255) ctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGcgaggccgacgccgccactgcccacgggaacagcccggccggtaccacattgggcaacagcgcctgggttgccggcatttcgaatgagcggctggcgccgagcaggaa < 2:1986430‑M2/150‑109 (MQ=255) ctcggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGc > 2:826755/1‑150 (MQ=255) cggccACCCAGTCGGCGACAATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGccc > 2:1040715/1‑150 (MQ=255) cGcccaccgccggcgccacgatggtcgccgactgggtggccgaggccgacgccgccactgcccgcgggaacagcccggccggtaccacattgggcaacagcgcctgggttgccggcatttcgaatgagcggctggcgccgagcaggaagg > 2:1185467‑M1/1‑2 (MQ=255) ggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGcgaggccgacgccgccactgcccgcgggaacagcccggccggtaccacattgggcaacagcgcctgggttgccggcatttcgaatgagcggctggcgccgagcaggaaatc < 2:698296‑M2/150‑112 (MQ=255) ggccACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCa > 1:1462333/1‑150 (MQ=255) | CACCGACAACGTCACCCGCGAACTGATCTTTGCTCTGGCCTTCCTGCTCGGCGCCAGCCGCTCATTCGAAATGCCGGCAACCCAGGCGCTGTTGCCCAATGTGGTACCGGCCGGGCTGTTCCCGCGGGCAGTGGCGGCGTCGGCCTCGGCCACCCAGTCGGCGACCATCGTGGCGCCGGCGGTGGGCGGATTCCTGTATGCCTTTGGCAGCATGTGGGTGTACGGCCCGACGGTGGCCTTGTACGCCATTGCCTGCGTGCTGACCCTGAGCCTGCAGGCGCGCGGCCAGGTCGCCCA > NC_002947/5277387‑5277683 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |