New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_002947 | = 5502769 | 82 (0.880) | 5 (0.060) | 5/240 | NT | 6.1% | coding (169/432 nt) | PP_4837 | hypothetical protein |
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GCCGTACCACCCGCCCTGACCTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCGCTCAGCGC > NC_002947/5502626‑5502917 | gCCGTACCACCCGCCCTGACCTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAacatgccgatggacatgccgatgg < 1:1626693/150‑1 (MQ=255) cGTACCACCCGCCCTGACCTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCATGCGGGCATGTACGTGCCTATGGACATGCCGATgg‑cg > 2:20956/1‑150 (MQ=255) gTACCACCCGCCCTGACCTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATgg‑cgg < 1:2141723/150‑1 (MQ=255) accaccCGCCCTGACCTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCt < 1:765404/150‑1 (MQ=255) caccCGCCCTGACCTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCtgatgggcagccg > 1:1190406‑M1/1‑137 (MQ=255) caccCGCCCTGACCTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGc < 2:1755093/150‑1 (MQ=255) accCGCCCTGACCTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGcc > 1:1416904/1‑150 (MQ=255) ccGCCCTGACCTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCa > 1:832417/1‑150 (MQ=255) cGCCCTGACCTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCAt > 2:827646/1‑150 (MQ=255) gCCCTGACCTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCagc < 1:1705120/150‑3 (MQ=255) gCCCTGACCTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCATc > 1:464475/1‑150 (MQ=255) ccTGACCTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCATCAg < 1:72681‑M2/150‑2 (MQ=255) gACCTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCtgatgggcagccgccatcggcat < 2:1190406‑M1/150‑24 (MQ=255) cTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCATCAGCATggc > 1:1999374/1‑150 (MQ=255) cTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCACCAGCATggc > 2:216757/1‑150 (MQ=255) tCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCATCAGCATggcg > 2:1529803/1‑150 (MQ=255) tCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCATCAGCATggcg > 2:1936415/1‑150 (MQ=255) tCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCATCAGCATggcg > 1:2444563/1‑150 (MQ=255) 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gatggacatgccgatgg‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGcc < 2:1984904/125‑1 (MQ=255) gatggacatgccgatgg‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGcc > 1:1984904/1‑125 (MQ=255) atggacatgccgatgg‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCg > 1:1611182/1‑150 (MQ=255) atggacatgccgatgg‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGAGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCg < 1:362568/150‑1 (MQ=255) ggacatgccgatgg‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCa > 2:2096494/1‑69 (MQ=255) ggacatgccgatgg‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCa < 1:2096494/69‑1 (MQ=255) acatgccgatgg‑CGGCTGCCCATCAgcatgtccatcggcatgttcatgcccgcgtggtggtccatcggcatcgactgggatatcagcgggc > 2:1659413‑M2/1‑25 (MQ=255) acatgccgatgg‑CGGCTGCCCATCAgcatgtccatcggcatgttcatgcccgcgtggtggtccatcggcatcgactgggatatcagcgggc < 1:1659413‑M2/91‑67 (MQ=255) acatgccgatgg‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCa < 2:28958/141‑1 (MQ=255) acatgccgatgg‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCa > 1:28958/1‑141 (MQ=255) acatgccgatgg‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCGCTCa > 2:2043186/1‑150 (MQ=255) acatgccgatgg‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGACCGATct < 2:2444563/150‑2 (MQ=255) atgccgatgg‑CGGCTGCCCATCAgcatgtccatcggcatgttcatgcccgcgtggtggtccatcggcatcgactgggatatcagcgggccgatgaagatcatccacatggcgaacaggctcagccatccgccaccggcgcgcctgaggtc < 2:1190406‑M2/150‑128 (MQ=255) tgccgatgg‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCGCTCAg < 2:100811/148‑1 (MQ=255) tgccgatgg‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCGCTCAg > 1:100811/1‑148 (MQ=255) tgccgatgg‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGCTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCGCTCAgcg > 1:1060969/1‑150 (MQ=255) ctgatgggcagccgccatcggcatgtccatcggcatgttcatgcccgcgtggtggtccatcggcatcgactgggatatcagcgggccgatgaagatcatccacatggcgaacaggctcagccatccgccaccggcgcgcctgaggtcagg < 1:72681‑M1/150‑150 (MQ=255) | GCCGTACCACCCGCCCTGACCTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCGCTCAGCGC > NC_002947/5502626‑5502917 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |