New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_002947 | = 5502769 | 82 (0.880) | 5 (0.060) | 5/240 | NT | 6.1% | coding (169/432 nt) | PP_4837 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 5502788 | 76 (0.850) | coding (188/432 nt) | PP_4837 | hypothetical protein |
CCTGACCTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCGCTCAGCGCCGGCAGCATCGCCCCCACCA > NC_002947/5502640‑5502937 | ccTGACCTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCATCAg < 1:72681‑M2/150‑2 (MQ=255) cTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCATCAGCATggc > 1:1999374/1‑150 (MQ=255) cTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCACCAGCATggc > 2:216757/1‑150 (MQ=255) 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ccGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGccc < 2:832417/150‑1 (MQ=255) cGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCa < 1:1529803/150‑1 (MQ=255) gTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGTTATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCTGATGGGCAGCCGCC‑ATCGgcatgtccatcggcatgttc > 2:1025674‑M2/1‑130 (MQ=255) gCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATcacg < 1:972028/150‑1 (MQ=255) ggATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATcacggc > 2:2073298/1‑150 (MQ=255) 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cggcTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGAAGTTACTTCAGTCTGTTAATCAACATCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCGCTCAGCGCCGgcagca < 1:647188/150‑1 (MQ=255) cggcTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTCCAGTGTGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCGCTCAGCGCCGgcagca < 1:147309/150‑1 (MQ=255) ggcTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCGCTCAGCGCCGGCAGCAt > 2:685968/1‑150 (MQ=255) gcTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCGCTCAGCGCCGGCAGCATc < 2:1999374/150‑1 (MQ=255) gcTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCGCTCAGCGCCGGCAGCATc < 1:1314879/150‑1 (MQ=255) cccATCAGCATGGCTGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCGCTCAGCGCCGGCAGCCTCGccc > 2:1058517/1‑150 (MQ=255) cccATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGaaaa < 2:2112357/70‑1 (MQ=255) cccATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGaaaa > 1:2112357/1‑70 (MQ=255) ccATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCGCTCAGCGCCGGCAGCATCGcccc > 2:517807/1‑150 (MQ=255) cATCAGCATGGCGGCGACGCGCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGGTGTTCAAGTGCCCGGCCCTGCCCACGGCCTACAGCCCGCTCAGCGCCGGCAGCATCGccccc > 2:789324/1‑150 (MQ=255) cATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCg > 2:1015500/1‑73 (MQ=255) cATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCg < 1:1015500/73‑1 (MQ=255) aTCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCATGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCGCTCAGCGCCGGCAGCATCGCCCcca > 2:354968/1‑150 (MQ=255) aTCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCGCTCAGCGCCGGCAGCATCGCCCcca > 2:815174/1‑150 (MQ=255) aTCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCGCTCAGCGCCGGCAGCATCACCCcca > 1:1916868/1‑150 (MQ=255) aGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCATGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCGCTCAGCGCCGGCAGCATCGCCCccacca < 1:354968/150‑1 (MQ=255) | CCTGACCTCAGGCGCGCCGGTGGCGGATGGCTGAGCCTGTTCGCCATGTGGATGATCTTCATCGGCCCGCTGATATCCCAGTCGATGCCGATGGACCACCACGCGGGCATGAACATGCCGATGGACATGCCGATGG‑CGGCTGCCCATCAGCATGGCGGCGACGCCCATCACGGCCACGGCGGCGATGGCCAGTTGCATGTGATGTGGGAAAAGTGCGGTTACTGCAGCCTGTTGTTCAACTGCCCGGCCCTGCCCCAGGCCCTCAGCCCGCTCAGCGCCGGCAGCATCGCCCCCACCA > NC_002947/5502640‑5502937 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |