| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 5655139 | 79 (0.850) | 6 (0.070) | 6/236 | NT | 7.2% | coding (458/1059 nt) | epd | D‑erythrose 4‑phosphate dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | = 5655159 | 79 (0.900) | coding (438/1059 nt) | epd | D‑erythrose 4‑phosphate dehydrogenase | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
CTTCGTGGTGATAGGCATCGATCACCGGCTGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCG > NC_002947/5654990‑5655288 | cTTCGTGGTGATAGGCATCGATCACCGGCTGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGC < 2:1148352‑M1/150‑1 (MQ=255)cTTCGTGGTGATAGGCATCGATCACCGGCTGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGCTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGC < 1:2289852‑M1/150‑1 (MQ=255) gtggtgATAGGCATCGATCACCGGCTGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGcgctc < 1:2084710/150‑1 (MQ=255) gtggtgATAGGCATCGATCACCGGCTGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGcgctc > 1:127648/1‑150 (MQ=255) gtggtgATAGGCATCGATCACCGGCTGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGcgctc < 2:548872/150‑1 (MQ=255) aGGCATCGATCACCGGCTGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGCTGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCgg > 2:866342/1‑150 (MQ=255) aGGCATCGATCACCGGCTGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGcgctc < 2:2071458/142‑1 (MQ=255) aTCGATCACCGGCTGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAag > 1:1872830/1‑150 (MQ=255) accACCGGCTGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTACACAGATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAaggcag < 1:258804/148‑1 (MQ=255) aTCACCGGCTGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAaggcag > 1:1725979/1‑150 (MQ=255) tCACCGGCTGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAagg < 1:401816/146‑1 (MQ=255) tCACCGGCTGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAagg > 2:401816/1‑146 (MQ=255) tCACCGGCTGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGg < 2:941600‑M2/150‑2 (MQ=255) 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ccAGGCctgccttaccggcagcgagcgcctggtgtccaacgcctcgtgcaccaccaactgcggcgtgccgctgctgcgtgtgctggaccaggcgtttggcatcgaatatgtgcagatcacaaccatccactcggcgatgaacgaccagcc > 2:2183918‑M1/1‑6 (MQ=255) ccAGGCctgccttaccggcagcgagcgcctggtgtccaacgcctcgtgcaccaccaactgcggcgtgccgctgctgcgtgtgctggaccaggcgtttg > 2:481902‑M1/1‑6 (MQ=255) cAGGCctgccttaccggcagcgagcgcctggtgtccaacgcctcgtgcaccaccaactgcggcgtgccgctgctgcgtgtgctggaccaggcgtttggcatcgaatatgtgcagatcacaaccatccactcggcgatgaacgaccagccg > 2:1628386‑M1/1‑5 (MQ=255) cAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGgcctggtgtccaacgcctcgtgcaccaccaactgcggcgtgccgctgctgcgtgtgctggaccaggcgtttggcatcgaatatgtgcagatcacaaccatccactcggcgatgaacgaccagccg < 1:99173‑M2/150‑126 (MQ=255) cAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACa > 2:2288474/1‑92 (MQ=255) cAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACa < 1:2288474/92‑1 (MQ=255) cAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAg > 1:1762296/1‑148 (MQ=255) cAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAg < 2:1762296/148‑1 (MQ=255) gcgcTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCa < 1:1570604/92‑1 (MQ=255) gcgcTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCa > 2:1570604/1‑92 (MQ=255) gcgcTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCAcc > 1:1834876/1‑150 (MQ=255) gcctgccttaccggcagcgagcgcctggtgtccaacgcctcgtgcaccaccaactgcggcgtgccgctgctgcgtgtgctggaccaggcgtttggcatcgaatatgtgcagatcacaaccatc > 1:1628530‑M1/1‑2 (MQ=255) gcctgccttaccggcagcgagcgcctggtgtccaacgcctcgtgcaccaccaactgcggcgtgccgctgctgcgtgtgctggaccaggcgtttggcatcgaatatgtgcagatcacaaccatc < 2:1628530‑M1/123‑122 (MQ=255) gcctgccttaccggcagcgagcgcctggtgtccaacgcctcgtgcaccaccaactgcggcgtgccgctgctgcgtgtgctggaccaggcgtttggcaacgaatatgtgcagatcacaaccatccactcggcgatgaacgaccagccggtg > 1:866342‑M1/1‑2 (MQ=255) cctgccttaccggcagcgagcgcctggtgtccaacgcctcgtgcaccaccaactgcggcgtgccgctgctgcgtgtgctggaccaggcgtttggcatcgaatatgtgcagatcacaaccatccactcggcgatgaacgaccagccggtga < 2:941600‑M1/150‑150 (MQ=255) | CTTCGTGGTGATAGGCATCGATCACCGGCTGGTCGTTCATCGCCGAGTGGATGGTTGTGATCTGCACATATTCGATGCCAAACGCCTGGTCCAGCACACGCAGCAGCGGCACGCCGCAGTTGGTGGTGCACGAGGCGTTGGACACCAGGCGCTCGCTGCCGGTAAGGCAGGCCTGGTTGATGCCGTAGACAACCGTGGCGTCAACGTCGGCCTCGCTGGCCATGGGCTGCGAGAACAGCACCCTTGGCGCACCGGCTTCGAGGAAACGCTGGCCATCGGCACGGGTGTTATAGGCACCG > NC_002947/5654990‑5655288 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |