| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5665825 | 83 (0.890) | 6 (0.070) | 6/230 | NT | 7.1% | intergenic (‑70/‑213) | PP_4973/nhaP | membrane protein/NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
| ? | NC_002947 | = 5665884 | 81 (0.940) | intergenic (‑129/‑154) | PP_4973/nhaP | membrane protein/NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GCTCGCCACTGAATTTGATCAAGGTATTCCAGGTTGCATGCAGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCA > NC_002947/5665677‑5665972 | gcTCGCCACTGAATTTGATCAAGGTATTCCAGGTTGCATGCAGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCa < 2:1396671/150‑1 (MQ=255) tCGCCACTGAATTTGATCAAGGTATTCCAGGTTGCATGCAGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATg > 2:1245147/1‑150 (MQ=255) gCCACTGAATTTGATCAAGGTATTCCAGGTTGCATGCAGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGAGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGcc > 2:1216479/1‑150 (MQ=255) cACTGAATTTGATCAAGGTATTCCAGGTTGCATGCAGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCg > 1:1749269/1‑150 (MQ=255) cACTGAATTTGATCAAGGTATTCCAGGTTGCATGCAGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTGCTGGGGGGCTTTGGCGGAGCGGGCATGCCCg > 2:2407850/1‑150 (MQ=255) tGAATTTGATCAAGGTATTCCAGGTTGCATGCAGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTga > 2:2031645/1‑150 (MQ=255) tGAATTTGATCAAGGTATTCCAGGTTGCATGCAGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCAGGCCGGTgc > 1:2112185/1‑149 (MQ=255) aTTTGATCAAGGTATTCCAGGTTGCATGCAGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTgaaga > 2:1765788/1‑150 (MQ=255) tttGATCAAGGTATTCCAGGTTGCATGCAGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTgaagaa > 1:1431744/1‑150 (MQ=255) ttGATCAAGGTATTCCAGGTTGCATGCAGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAAt < 2:2154113/150‑1 (MQ=255) tCAAGGTATTCCAGGTTGCATGCAGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGC < 1:1967653‑M1/131‑1 (MQ=255) tCAAGGTATTCCAGGTTGCATGCAGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGC > 2:1967653‑M1/1‑131 (MQ=255) ttCCAGGTTGCATGCAGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAAcctggaa > 1:997450/1‑143 (MQ=255) ttCCAGGTTGCATGCAGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTCGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGc < 2:2423891/127‑1 (MQ=255) ttCCAGGTTGAATGCAGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCGTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGc > 1:2423891/1‑127 (MQ=255) cAGGTTGCATGCAGCAGGGCGGCAACCAGCGCCAGAGATGTTGCCAACACGCTTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATg < 2:2338963/150‑1 (MQ=255) cAGGTTGCATGCAGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATg > 1:1402965/1‑150 (MQ=255) gTTGCATGCAGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCa > 1:861618/1‑150 (MQ=255) gcatgcaGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCg < 1:551756/150‑1 (MQ=255) atgcaGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCg > 2:787693/1‑135 (MQ=255) atgcaGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCg < 1:787693/135‑1 (MQ=255) agcagGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGcaaa < 2:1787552/149‑4 (MQ=255) agcagGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGcaaa > 1:1787552/1‑146 (MQ=255) agGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCg < 1:1489591/150‑1 (MQ=255) ggcggcAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGgt < 2:725174/150‑1 (MQ=255) aCCAGCACCAGAGCTGTTGCCCACACCCCTTGTTGGCCGTATGTCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCgtgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccatacaccgagttgcattcttcacg < 2:1453723‑M1/150‑55 (MQ=255) aCCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTcgcg < 1:264555/150‑1 (MQ=255) aGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGgt < 1:784498/118‑1 (MQ=255) aGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGgt > 2:784498/1‑118 (MQ=255) gCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCgg > 1:1976327/1‑147 (MQ=255) gCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCgg < 2:1976327/147‑1 (MQ=255) cAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTgaaga > 1:949286/1‑101 (MQ=255) cAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTgaaga < 2:949286/101‑1 (MQ=255) cAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACgcc < 2:2223876‑M2/150‑4 (MQ=255) agagATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACgccc < 1:255456‑M2/150‑5 (MQ=255) gagaTGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATATCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACgccc < 2:1676115‑M2/149‑5 (MQ=255) gagaTGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATATCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACgccc > 1:1676115‑M2/1‑145 (MQ=255) gCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcaca > 1:1412103/1‑150 (MQ=255) aaCACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCgtgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccatacaccgagttgcattcttcacgggcatgcccgctcc > 2:2303357‑M1/1‑75 (MQ=255) aaCACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCgtgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccatacaccgagttgcattcttcacgggcatgcccgctcc < 1:2303357‑M1/143‑69 (MQ=255) aaCACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCGCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATTGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAggg > 1:509827/1‑150 (MQ=255) aaCACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAggg > 2:1801581/1‑150 (MQ=255) acGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGccc > 1:2203974/1‑78 (MQ=255) acGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGccc < 2:2203974/78‑1 (MQ=255) acGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAg > 2:796358/1‑150 (MQ=255) cGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGc < 1:176936/150‑1 (MQ=255) gCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCAGGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGTCCGGGCCGACAGGGTAGcc > 2:2395073/1‑150 (MQ=38) ccTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCgtgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccatacaccgagttgcattcttcacgg < 2:1060013‑M1/124‑56 (MQ=255) ccTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCgtgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccatacaccgagttgcattcttcacgg > 1:1060013‑M1/1‑69 (MQ=255) ccTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCa < 2:1175813/150‑1 (MQ=255) cttGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGGATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGc < 2:635015/150‑1 (MQ=255) ttGTCCGTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCCCAGCTGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCa < 1:323611/150‑1 (MQ=38) gTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGTTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCCCCTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGa < 1:417494/150‑1 (MQ=255) gTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGa < 2:1749269/150‑1 (MQ=255) gTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGa < 2:1815811/150‑1 (MQ=255) cTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGc < 2:960918/138‑1 (MQ=255) cTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGc > 1:960918/1‑138 (MQ=255) cTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGATCCCACATGGTAGCCAGTGCAGACTg < 2:1402965/150‑1 (MQ=255) aTGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCg < 1:1912661/79‑1 (MQ=255) aTGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCa > 1:2192376/1‑150 (MQ=255) aTGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCa > 2:464246/1‑150 (MQ=255) gCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTCCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACgg < 1:1245147/150‑1 (MQ=255) ttCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAAc > 2:70639/1‑150 (MQ=255) aTGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGAt > 1:1444298/1‑150 (MQ=255) tGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGAtt < 2:2192376/150‑1 (MQ=255) ggCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACgc > 2:1772439‑M2/1‑103 (MQ=255) ggCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACgc < 1:1772439‑M2/105‑3 (MQ=255) ggCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGAttt > 2:1462905/1‑150 (MQ=255) tgtgAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGa < 2:255456/150‑1 (MQ=255) gtgtATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGAc > 1:1664783/1‑150 (MQ=255) gtgAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGAc < 2:149527/150‑1 (MQ=255) gAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTa > 1:1321258/1‑150 (MQ=255) aGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGAc > 2:744030/1‑140 (MQ=255) aGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGAc < 1:744030/140‑1 (MQ=255) aGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTc < 1:70639/150‑1 (MQ=255) aGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTc < 2:2112185/150‑1 (MQ=255) aGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCt < 2:1431744/150‑1 (MQ=255) ggggggCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCa > 1:554710/1‑103 (MQ=255) ggggggCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCa < 2:554710/103‑1 (MQ=255) ggggggCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCtg > 1:1066013/1‑150 (MQ=255) gggggCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGCCTAATTCGGTCAAACCCtgt > 2:306290/1‑150 (MQ=255) ggggCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCtgtg > 1:2097178/1‑150 (MQ=255) gggCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGc > 1:433096/1‑150 (MQ=255) cTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTaa > 1:596466/1‑129 (MQ=255) cTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTaa < 2:596466/129‑1 (MQ=255) tttGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGAtt > 2:388603/1‑120 (MQ=255) tttGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGAtt < 1:388603/120‑1 (MQ=255) tttGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCg > 2:1609767/1‑150 (MQ=255) ttGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGAc > 2:1289286/1‑124 (MQ=255) ttGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGAc < 1:1289286/124‑1 (MQ=255) ggggAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCg > 2:469712/1‑128 (MQ=255) ggggAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCg < 1:469712/128‑1 (MQ=255) ggAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACgcccgctcccccaaagcccccctgaacgctatatattcacagccatgaacagccataaggacaagaaggcgtgtt < 1:2303357‑M2/143‑76 (MQ=255) aGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGt < 1:1462905/150‑1 (MQ=255) aGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGt > 1:1269410/1‑150 (MQ=255) gggCgtgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccatacaccgagttgcattcttcacgggcatgcccgctcccccaaagcccccctgaacgatatatattcacagccatgaacagccataaggacaagaaggcgtgttggcaacatctc > 1:1676115‑M1/1‑4 (MQ=255) gggCgtgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccatacaccgagttgcattcttcacgggcatgcccgctcccccaaagcccccctgaacgatatatattcacagccatgaacagccataaggacaagaaggcgtgttggcaacatctc < 2:1676115‑M1/149‑146 (MQ=255) ggCgtgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccatacaccgagttgcattcttcacgggcatgcccgctcccccaaagcccccctgaacgctatatattcacagccatgaacagccataaggacaagaaggcgtgttggcaacatctctg < 2:2223876‑M1/150‑148 (MQ=255) gCgtgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccatacaccgagttgcattcttcacgggcatgcccgctcccccaaagcccccctgaacgctatatattcacagcc > 2:1772439‑M1/1‑2 (MQ=255) gCgtgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccatacaccgagttgcattcttcacgggcatgcccgctcccccaaagcccccctgaacgctatatattcacagcc < 1:1772439‑M1/105‑104 (MQ=255) | GCTCGCCACTGAATTTGATCAAGGTATTCCAGGTTGCATGCAGCAGGGCGGCAACCAGCACCAGAGATGTTGCCAACACGCCTTCTTGTCCTTATGGCTGTTCATGGCTGTGAATATATAGCGTTCAGGGGGGCTTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGTGAAGAATGCAACTCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAGCCAGTGCAGACTGTCACGGGAACGATTTGGACTAATTCGGTCAAACCCTGTGCCCCGAACCCCGTGCCA > NC_002947/5665677‑5665972 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |