New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
ACACCCTGGTCGTCGGTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGC > NC_002947/5796619‑5796916 | acacCCTGGTCGTCGGTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGccc > 1:2370488/1‑150 (MQ=255) acCNTGGTCGTCGGTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCgg > 2:1496937/1‑150 (MQ=255) ccTGGTCGTCGGTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGc < 1:957323/150‑1 (MQ=255) ccTGGTCGTCGGGCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTTACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGc > 1:84389/1‑150 (MQ=255) cTGGTCGTCGGTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTGCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGcc > 1:1473279/1‑150 (MQ=255) cTGGTCGTCGGTCAGCGTCGCCTGGATGCGCGTGGCCTGCTGACGCANCCAGCGCTTGTACAGGTGGAGCTACTTCAGGCGTTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGcc > 1:364804/1‑150 (MQ=255) gtcgtcGGTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGAAGACAGCGCCCGCACGGGTGGCGCGACGGCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGac > 1:45710/1‑150 (MQ=255) tcgtcgGTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGTCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGaca > 2:1804607/1‑150 (MQ=255) gTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGccc < 1:200472/150‑1 (MQ=255) aGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTg > 1:411635‑M2/1‑149 (MQ=255) gCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTgg > 2:2267349‑M2/1‑148 (MQ=255) tCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCggg > 1:1188825/1‑131 (MQ=255) gCCTGGATGCGGGTAGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGTATCTGGCCGGTCTCGGTGTCCACGTCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGc > 2:490411/1‑150 (MQ=255) ccTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGa < 1:1527927/132‑1 (MQ=255) cTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCAc > 1:306253/1‑150 (MQ=255) tGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACt > 1:1686024/1‑150 (MQ=255) tGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACt > 2:175706/1‑150 (MQ=255) gATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTc < 1:2201357/150‑1 (MQ=255) 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aGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACAcc < 2:2381908/150‑1 (MQ=255) aTCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgccaccc > 2:356674‑M2/1‑26 (MQ=255) aTCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgccaccc < 1:356674‑M2/109‑84 (MQ=255) tCTGGCCaagggccgtgtcggcccgggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgccacccgtacaagcgctggctgcgtcagca > 1:1872776‑M1/1‑7 (MQ=255) tCTGGCCaagggccgtgtcggcccgggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgccacccgtacaagcgctggctgcgtcagca < 2:1872776‑M1/132‑126 (MQ=255) tCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgctacccgtacaagcgctggctgcgtcagcacg < 1:1659781‑M2/134‑110 (MQ=255) tCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgctacccgtacaagcgctggctgcgtcagcacg > 2:1659781‑M2/1‑25 (MQ=255) ggCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTggc > 1:431846/1‑150 (MQ=255) ccGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTggcggc < 2:445817/150‑1 (MQ=255) caagggccgtgtcggcccgggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgccacccgtacaagcgctggctgcgtcagcacgccacccgcatccaggcgacgct > 1:411635‑M1/1‑1 (MQ=255) | ACACCCTGGTCGTCGGTCAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGC > NC_002947/5796619‑5796916 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |