| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 5796767 | 100 (1.070) | 7 (0.080) | 7/238 | NT | 6.8% | coding (1189/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
| ? | NC_002947 | = 5796785 | 96 (1.080) | coding (1171/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
CAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGAT > NC_002947/5796636‑5796932 | cAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCtt < 1:256170/150‑1 (MQ=255) aGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTg > 1:411635‑M2/1‑149 (MQ=255) gCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTgg > 2:2267349‑M2/1‑148 (MQ=255) gCCTGGATGCGGGTAGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGTATCTGGCCGGTCTCGGTGTCCACGTCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGc > 2:490411/1‑150 (MQ=255) cTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCAc > 1:306253/1‑150 (MQ=255) tGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACt > 1:1686024/1‑150 (MQ=255) tGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACt > 2:175706/1‑150 (MQ=255) gATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTc < 2:726047/150‑1 (MQ=255) gATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTc < 1:2201357/150‑1 (MQ=255) gATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTc < 1:2007073/150‑1 (MQ=255) gggTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAg < 1:1555203/150‑1 (MQ=255) gTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGc < 2:45710/150‑1 (MQ=255) gCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGa < 2:2370488/150‑1 (MQ=255) tGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTggccaga < 2:1872776‑M2/132‑8 (MQ=255) tGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTggccaga > 1:1872776‑M2/1‑125 (MQ=255) tGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGccc > 1:2381908/1‑150 (MQ=255) tcGCATCCAGCGCGTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCa < 2:854133/149‑1 (MQ=255) gCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATa > 1:263052/1‑150 (MQ=255) 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tCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgctacccgtacaagcgctggctgcgtcagcacg < 1:1659781‑M2/134‑110 (MQ=255) tCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgacgccatcgacaaccgcctgaagtcgcgctacccgtacaagcgctggctgcgtcagcacg > 2:1659781‑M2/1‑25 (MQ=255) ggCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTggc > 1:431846/1‑150 (MQ=255) ccGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTggcggc < 2:445817/150‑1 (MQ=255) ggCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACTCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCtt < 1:2005697/150‑1 (MQ=255) ccGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCg < 2:431846/150‑1 (MQ=255) ccGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCg < 1:1924168/150‑1 (MQ=255) acacGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTc > 2:1658719/1‑150 (MQ=255) acacGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTc > 1:939737/1‑150 (MQ=255) ggCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGca < 1:700780/124‑1 (MQ=255) ggCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGca > 2:700780/1‑124 (MQ=255) ggCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGa > 1:1074638/1‑150 (MQ=255) ggCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGa < 1:1950326/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGa > 1:208000/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGCTAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGc > 2:1623953/1‑115 (MQ=255) cTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGc < 1:1623953/115‑1 (MQ=255) cTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGATCGATCAGGCACACCGCGTTGCGGCCGTCGGTCATGAcaga > 2:1705973/1‑147 (MQ=255) | CAGCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCCGGGCCGACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACGCCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGAT > NC_002947/5796636‑5796932 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |