New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
TCGTGGTCGCACTGGTGTGTGCCGCCTTCCTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCGGGTCATGACAGATGCGGCGGTGGAGGT > NC_002947/6141360‑6141657 | tCGTGGTCGCACTGGTGTGTGCCGCCTTCCTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCG > 1:1340492‑M1/1‑150 (MQ=255) gTGGTCGCACTGGTGTGTGCCGCCTTCCTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGcatcg‑cc > 1:931654/1‑150 (MQ=255) tCGCACTGGTGTGTGCCGCCTTCCTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCCCTGGGCGGcaccg‑ccat‑‑cg > 1:712273/1‑150 (MQ=255) 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cTTCCTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGCTTGCAACCGTGTCATTGCCTGTGGGTGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTcga > 2:744527‑M2/1‑147 (MQ=255) ttCCTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCGaccattgcgccaatggcgatggagag < 1:461683‑M1/150‑27 (MQ=255) ccTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTcgatgc > 2:273837‑M2/1‑144 (MQ=255) ccTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTcgatgc > 2:1340492‑M2/1‑144 (MQ=255) tgtgGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTcgatgccg < 1:983376‑M2/150‑9 (MQ=255) 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1:1671092/150‑1 (MQ=255) cAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCGGGt < 2:1947744/150‑1 (MQ=255) aaCATCATGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCGGGTc > 1:1719194/1‑150 (MQ=255) catcatGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCGGGTCAt < 1:2044501/150‑1 (MQ=255) tcatGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCGGGTCATGa > 2:2062618/1‑150 (MQ=255) catGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCAATGGCGGGTCATGAc < 1:894994/150‑1 (MQ=255) 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2:376715/150‑1 (MQ=255) ggcggcATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCGGGTCATGACAGATg > 2:177411/1‑145 (MQ=255) gcggcATCGaccattgcgccaatggcgatggcgatgccgcccagagacataaagtttgtgttgatgccctggtgccgcatgatgatgagcgcgatcagtactcccaccggcaatgacacgattgcaaccagcgacgagcgcaggtgccac < 2:1883182‑M1/150‑142 (MQ=255) ggcATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCGGGTCATGACAGATGCGGCGGTg < 1:129467/150‑1 (MQ=255) atcg‑ccat‑‑cgccATTGGCGCAATGGTcgatgccgcccagagacatgatgttggcgttgatgccctggtgccgcatgatgatgagcgcgatcagtactcccaccggcaatgacacgattgcaaccagcgacgagcgcaggtgccacaggaa < 1:1369437‑M2/150‑125 (MQ=255) atcg‑ccat‑‑cgccATTGGCGCAATGGTcgatgccgcccagagacatgatgttggcgttgatgccctggtgccgcatgatgatgagcgcgatcagtactcccaccggcaatgacacgattgc < 1:1979190‑M2/120‑95 (MQ=255) atcg‑ccat‑‑cgccATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTgg > 2:13288/1‑78 (MQ=255) tCGaccattgcgccaatggcgatggcgatgccgcccagagacatgatgttggcgttgatgccctggtgccgcatgatgatgagcgcgatcagtacacccacaggcaatgacacggttgcaagcagcgacgagcgcaggtgccacaggaag > 2:744527‑M1/1‑3 (MQ=255) tCGaccattgcgccaatggcgatggcgatgccgcccagagacatgatgttggcgttgatgccctggtgccgcatgatgatgagcgcgatcagta > 1:1016604‑M1/1‑3 (MQ=255) cg‑ccat‑‑cgccatTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCGGGTCATGACAGATGCGGCGGTGGAGGt < 1:1063862/150‑1 (MQ=255) gaccattgcgccaatggcgatggcgatgccgcccagagacatgatgttggcgttgatgccctggtgccgcatgatgatgagcgcgatcagtactcccaccggcaatgac > 1:297287‑M1/1‑1 (MQ=255) gaccattgcgccaatggcgatggcgatgccgcccagagacatgatgttggcgttgatgccctggtgccgcatgatgatgagcgcgatcagtactcccaccggcaatgac < 2:297287‑M1/109‑109 (MQ=255) gaccattgcgccaatggcgatggcgatgccgcccagagacatgatgttggcgttgatgccctagtgccgcatgatgatgagcgcgatcagtactcccaccggcaatgacacgattgcaaccagcgacgagcgcaggtgccacaggaaggc < 2:263620‑M1/150‑150 (MQ=255) gaccattgcgccaatggcgatggcgatgccgcccagagacatgatgttggcgttg < 1:1780544‑M1/55‑55 (MQ=255) gaccattgcgccaatggcgatggcgatgccgcccagagacatgatgttggcgttg > 2:1780544‑M1/1‑1 (MQ=255) | TCGTGGTCGCACTGGTGTGTGCCGCCTTCCTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCGGGTCATGACAGATGCGGCGGTGGAGGT > NC_002947/6141360‑6141657 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |