New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 6174329 | 202 (2.160) | 3 (0.030) | 3/244 | NT | 1.5% | coding (366/1368 nt) | glmU | bifunctional N‑acetyl glucosamine‑1‑phosphate uridyltransferase/glucosamine‑1‑phosphate acetyl transferase |
? | NC_002947 | = 6174366 | 196 (2.150) | coding (329/1368 nt) | glmU | bifunctional N‑acetyl glucosamine‑1‑phosphate uridyltransferase/glucosamine‑1‑phosphate acetyl transferase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
AGGCCAGAATGCCGGTGTTGCCTTCCTTGATCGCTTTTTGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCTGTTTATCCT > NC_002947/6174181‑6174477 | aGGCCAGAATGCCGGTGTTGCCTTCCTTGATCGCTTTTTGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCa < 1:611145/150‑1 (MQ=255) aGGCCAGAATGCCGGTGTTGCCTTCCTCGATCGCTTTTTGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCa < 2:1269741/150‑1 (MQ=255) gCCAGAATGCCGGTGTTGCCTTCCTTGATCGCTTTTTGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTCACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAgc > 1:2195806/1‑150 (MQ=255) gCCAGAATGCCGGTGTTGCCTTCCTTGAGAGCTTTTTGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAgc > 1:1777421/1‑150 (MQ=255) cAGAATGCCGGTGTTGCCTTCCTTGATCGCTTTTTGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCGCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGGCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAgctg > 2:1613238/1‑150 (MQ=255) aTGCCGGTGTTGCCTTCCTTGATCGCTTTTTGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGa < 1:548170/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGTTGCCTTCCTTGATCGCTTTTTGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATc < 1:2235750/150‑1 (MQ=255) ggTGTTGCCTCCCCTGATCGCTTTGTGCGCGTCGTTCGCGTCCTTGCGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGtt < 1:618676/150‑1 (MQ=255) gtgtTGCCTTCCTTGATCGCTTTTTGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTg < 2:476049/150‑1 (MQ=255) gtgtTGCCTTCCTTGATCGCTTTTTGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTAACTTCACTCGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTg < 2:1380945/150‑1 (MQ=255) cttccttGCTCGCTTTTTGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCCGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGACCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTgg < 2:1550392/150‑1 (MQ=255) cttccttGATCGCTTTTTGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTgg > 1:431391/1‑150 (MQ=255) ttccttGATCGCTTTTTTTTTTTTTTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGc > 2:1743629/1‑150 (MQ=255) ttccttGATCGCTTTTTTCGTTTCGTTTGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGc > 2:1886165/1‑150 (MQ=255) ttccttGATCGCTTTTTGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGc > 2:614361/1‑150 (MQ=255) tCGCTTTTTGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGAc < 1:826135/150‑1 (MQ=255) tCGCTTTCTGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCACAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGCGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTTGCTTTGGCCAACAGAc < 2:1228509/150‑1 (MQ=255) gCTTTTTGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGc > 2:1837450/1‑150 (MQ=255) 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2:1989387/1‑150 (MQ=255) tCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGgtgt > 1:1280128/1‑120 (MQ=255) ggATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACa < 2:1945197/150‑1 (MQ=255) ggATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACa < 1:1875703/150‑1 (MQ=255) ggATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACa > 2:1121974/1‑150 (MQ=255) gATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCaaa > 2:1409763/1‑86 (MQ=255) gATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTgg < 2:1764339/143‑1 (MQ=255) aTCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGc > 2:882229/1‑150 (MQ=255) tcgAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACCATGAGAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAACATGa > 1:1842578/1‑150 (MQ=255) gAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGAcc < 1:1038980/150‑1 (MQ=255) gAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGAcc < 1:2444586/150‑1 (MQ=255) aCTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTAccc > 1:1094577/1‑150 (MQ=255) cTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCa < 2:693602/150‑1 (MQ=255) tGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCTGTACCCAg > 2:1184880/1‑150 (MQ=255) tCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCCCTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCt < 2:1777421/150‑1 (MQ=255) tCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGcc < 2:2317139/79‑1 (MQ=255) tCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTgg > 2:790104/1‑125 (MQ=255) tCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCt < 1:2355552/150‑1 (MQ=255) cccAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGtc < 2:291311/45‑1 (MQ=255) cctgcagcgtctgttggccaaagccaacgatcagcagctggggcttctgacagtcaccctcgacgatccgaccggctatggccggatcgtgcgtgacgagcagggcaaggtaactgccatcgttga < 1:102398‑M1/126‑125 (MQ=255) cctgcagcgtctgttggccaaagccaacgatcagcagctggggcttctgacagtcaccctcgacgatccgaccggctatggccggatcgtgcgtgacgagcagggcaaggtaactgccatcgttga > 2:102398‑M1/1‑2 (MQ=255) ccAGCTGCTGATCGTTGGCTTTTGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCTGTTTATCCt > 2:1471429/1‑150 (MQ=255) ccAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAggggcttctgacagtcaccctcgacgatccgaccggctatggccggatcgtgcgtgacgagcag > 2:507778‑M2/1‑39 (MQ=255) ccAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCTGTTTATCCt > 1:1426390/1‑150 (MQ=255) ccAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACATCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCTGTTTATCCt > 1:1635454/1‑150 (MQ=255) | AGGCCAGAATGCCGGTGTTGCCTTCCTTGATCGCTTTTTGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCTGTTTATCCT > NC_002947/6174181‑6174477 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |