New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 6174329 | 202 (2.160) | 3 (0.030) | 3/244 | NT | 1.5% | coding (366/1368 nt) | glmU | bifunctional N‑acetyl glucosamine‑1‑phosphate uridyltransferase/glucosamine‑1‑phosphate acetyl transferase |
? | NC_002947 | = 6174366 | 196 (2.150) | coding (329/1368 nt) | glmU | bifunctional N‑acetyl glucosamine‑1‑phosphate uridyltransferase/glucosamine‑1‑phosphate acetyl transferase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
TTTGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCTGTTTATCCTGCATGACGAAATTCAGGTCGTCAGCAGCCAGCCGCTCG > NC_002947/6174217‑6174515 | tttGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCa < 1:1515513/150‑1 (MQ=255) tGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAgg > 2:1641455‑M2/1‑148 (MQ=255) gtcgtTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTAACCTGCGCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGGCGGCTCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAggggctc < 1:1354315‑M2/150‑8 (MQ=255) gtTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCCGAAGCCCCGGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCAc < 2:928982/150‑1 (MQ=255) tGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACtt < 2:202782/150‑1 (MQ=255) gCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCg > 1:693602/1‑150 (MQ=255) cGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGa < 2:661085/150‑1 (MQ=255) cGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGa > 2:301948/1‑150 (MQ=255) gTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGAt > 1:1956915/1‑150 (MQ=255) ttGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCaca > 2:970108/1‑148 (MQ=255) ttGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCaaa < 1:990630/150‑1 (MQ=255) gtgCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAgg < 1:614361/150‑1 (MQ=255) gtgCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAgg < 2:1148370/150‑1 (MQ=255) gtgCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAgg < 1:1743629/150‑1 (MQ=255) gcgCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACCCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCCGCTGCTGATCGTTGGCTCTGGCTAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAgg < 1:880305/148‑1 (MQ=255) gCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCGCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCa < 2:1545942/150‑1 (MQ=255) tCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAgg > 2:102398‑M2/1‑124 (MQ=255) tCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAgg < 1:102398‑M2/126‑3 (MQ=255) tCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAg > 1:1039930‑M2/1‑124 (MQ=255) tCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACg > 1:438100/1‑150 (MQ=255) aGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTacaa > 1:528520/1‑150 (MQ=255) ttACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTacaaca > 2:209970/1‑150 (MQ=255) ccTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCa > 1:2182587/1‑150 (MQ=255) ccTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGACGTACTACACCa > 2:1995390/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) tGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACa > 1:199890/1‑107 (MQ=255) tGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCTGTTTATCCTGCATGACGAAATTCa < 1:256305/150‑1 (MQ=255) ggCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCTGTTTATCCTGCATGACGAAATTCAg < 1:1121974/150‑1 (MQ=255) cTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTgtcagcg < 1:457709/77‑1 (MQ=255) tttGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTgtca > 2:633433/1‑73 (MQ=255) tttGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTgtca < 1:633433/73‑1 (MQ=255) tttGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCTGTTTATCCTGCATGACGAAATTCAGgtc < 2:2182587/150‑1 (MQ=255) tGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCTGTTTATCCTGCATGACGAAATTCAGgtcgt < 1:303770/150‑1 (MQ=255) ccAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCTGTTTATCCTGCATGACGAAATTCAGGTCGTcag > 2:2196982/1‑150 (MQ=255) ccAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCTGTTTATCCTGCATGACGAAATTCAGGTCGTcag < 1:942847/150‑1 (MQ=255) cAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCTGTTTATCCTGCATGACGAAATTCAGGTCGTcagc > 1:345035/1‑150 (MQ=255) aaCAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCTGTTTATCCTGCATGa < 1:1478331/130‑1 (MQ=255) aCAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCTGTTTATCCTGCATGACGAAATTCAGGTCGTcagcag > 2:305488/1‑150 (MQ=255) cAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCTGTTTATCCTGCATGACGAAATTCAGGTCGTCagcagc < 1:2045970/150‑1 (MQ=255) gACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCTGTTTATCCTGCATGACGAAATTCAGGTCGTCAGcagcca > 1:1292433/1‑150 (MQ=255) gCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCTGTTTATCCTGCATGACGAAATTCAGGTCGTCAGCagccagcc < 2:424393/150‑1 (MQ=255) aGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCTGTTTATCCTGCATGACGAAATGCAGGTCGTCAGAAGCCAGCCGCTcg < 2:1845619/150‑1 (MQ=255) | TTTGCGCGTCGTTGGCGTCCTTGTGCTCAACGATGGCAGTTACCTTGCCCTGCTCGTCACGCACGATCCGGCCATAGCCGGTCGGATCGTCGAGGGTGACTGTCAGAAGCCCCAGCTGCTGATCGTTGGCTTTGGCCAACAGACGCTGCAGGGTCTCCACTTCGATCAAAGGCACGTCGCCGTACAACACCAGCACGGTGTCAGCGGTCAGCGCTGGCAGTGCCTGGGCAACAGCATGACCGGTACCCAGCTGTTTATCCTGCATGACGAAATTCAGGTCGTCAGCAGCCAGCCGCTCG > NC_002947/6174217‑6174515 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |