| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 86750 = | 85 (0.910) | 9 (0.110) | 6/218 | NT | 11.4% | intergenic (‑33/+112) | PP_0075/PP_0076 | choline sulfate transporter/choline betaine‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 86841 = | 66 (0.810) | intergenic (‑124/+21) | PP_0075/PP_0076 | choline sulfate transporter/choline betaine‑binding protein | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGAAGCTGA > NC_002947/86693‑86986 | gcagcaGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGtt > 1:562864/1‑150 (MQ=255) ggCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGGTGGTGTGTTGCTTtgt > 1:1672313/1‑150 (MQ=255) ggCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTCGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTtgt > 2:1148722/1‑150 (MQ=255) gCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTATGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgtgtgt < 2:1584221/141‑1 (MQ=255) gCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTATGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgtgtgt > 1:1584221/1‑141 (MQ=255) aTGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGTCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTAc > 1:1048462/1‑150 (MQ=255) aTGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTAc > 2:481279/1‑150 (MQ=255) aTGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTAc > 1:626325/1‑150 (MQ=255) tGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACa < 1:2399202/150‑1 (MQ=255) gTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGtt < 1:2219407/150‑1 (MQ=255) ttATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGttt < 1:105670/150‑1 (MQ=255) ttATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGttt > 1:1639062/1‑150 (MQ=255) ttATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGttt < 1:1198638/150‑1 (MQ=255) gtATCCACAAGCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGttt < 2:2406791/149‑1 (MQ=255) 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aGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTcc < 2:562864/150‑1 (MQ=255) gggTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCTGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgt < 1:1039691/107‑1 (MQ=255) gggTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCTGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgt > 2:1039691/1‑107 (MQ=255) gggTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAg < 2:1568700/150‑1 (MQ=255) ggTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAgg < 2:723600/150‑1 (MQ=255) ggTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAgg > 2:1762983/1‑150 (MQ=255) 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gtgtTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAgg > 2:1302530/1‑79 (MQ=255) gcccgctcccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATgc > 2:252151‑M2/17‑125 (MQ=255) cccgctcccacagggcTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCtt > 1:1669724‑M2/17‑150 (MQ=255) cccgctcccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGTCACCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTc < 1:1207922‑M2/135‑1 (MQ=255) cccgctcccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCGACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTc > 1:1657283‑M2/16‑150 (MQ=255) ccgctcccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCa > 1:1482772‑M2/15‑66 (MQ=255) ccgctcccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCa < 2:1482772‑M2/52‑1 (MQ=255) ccgctcccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCa > 2:313497‑M2/15‑150 (MQ=255) cgctcccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCAt > 2:1236776‑M2/14‑150 (MQ=255) tctacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGaa < 1:522715‑M2/141‑1 (MQ=255) ccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCCCCCACCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGAAg < 2:1672313‑M2/142‑1 (MQ=255) ccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGaa < 1:2301787‑M2/141‑1 (MQ=255) ccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGaa > 2:2301787‑M2/9‑149 (MQ=255) ccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGAAg < 1:1236776‑M2/142‑1 (MQ=255) cacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAgg < 2:258016‑M2/49‑1 (MQ=255) cacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAgg > 1:258016‑M2/8‑56 (MQ=255) cacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGAAGc > 2:240241‑M2/8‑150 (MQ=255) agggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGAAGCTGa > 1:898213‑M2/5‑150 (MQ=255) | GCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGAAGCTGA > NC_002947/86693‑86986 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |