New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 317421 = | 94 (1.010) | 5 (0.060) | 5/236 | NT | 5.5% | coding (512/1407 nt) | dctD‑I | C4‑dicarboxylate transport transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 317465 = | 84 (0.950) | coding (468/1407 nt) | dctD‑I | C4‑dicarboxylate transport transcriptional regulator |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
GCCACGAACGGCCCTTCGCTGCGGCTGGACAGGTCGTGCAGCGCGCGGGCCACCACCTCTTTGCCGGCGCCGGTTTCGCCCAGAATCAACACGTCGGCGCGGGTGCCGGCCAAAGCGCCGATCTGCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGGGCGTCTGTGGCAAAGGGTTTTTCCAGGAAGT > NC_002947/317316‑317613 | gCCACGAACGGCCCTTCGCTGCGGCTGGACAGGTCGTGCAGCGCGCGGGCCACCACCTCTTTGCCGGCGCCGGTTTCGCCCAGAATCAACACGTCGGCGCGGGTGCCGGCCAAAGCGCCGATCTGCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGt < 2:213183/150‑1 (MQ=255) gCCACGAACGGCCCTTCGCTGCGGCTGGACAGGTCGTGCAGCGCGCGGGCCACCACCTCTTTGCCGGCGCCGGTTTCGCCCAGAATCAACACGTCGGCGCGGGTGCCGGCCAAAGCGCCGATCTGCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGt < 1:2013688/150‑1 (MQ=255) gCCACGAACGGCCCTTCGCTGCGGCTGGACAGGTCGTGCAGCGCGCGGGCCACCACCTCTTTGCCGGCGCCGGTTTCGCCCAGAATCAACACGTCGGCGCGGGTGCCGGCCAAAGCGCCGATCTGCTCGCGCAGGCGCAGAATGGCCGGt < 2:1852067/150‑1 (MQ=255) ccACGAACGGCCCTTCGCTGCGGCTGGACAGGTCGTGCAGCGCGCGGGCCACCACCTCTTTGCCGGCGCCGGTTTCGCCCAGAATCAACACGTCGGCGCGGGTGCCGGCCAAAGCGCCGATCTGCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTg > 1:1293489/1‑150 (MQ=255) ccACGAACGGCCCTTCGCTGCGGCTGGACAGGTCGTGCAGCGCGCGGGCCACCACCTCTTTGCCGGCGCCGGTTTCGCCCAGAATCAACACGTCGGCGCGGGTGCCGGCCAAAGCGCCGATCTGCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTg > 1:1119966/1‑150 (MQ=255) gAACGGCCCTTCGCTGCGGCTGGACAGGTCGTGCAGCGCGCGGGCCACCACCTCTTTGCCGGCGCCGGTTTCGCCCAGAATCAACACGTCGGCGCGGGTGCCGGCCAAAGCGCCGATCTGCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATg < 2:158759/150‑1 (MQ=255) gAACGGCCCTTCGCTGCGGCTGGACAGGTCGTGCAGCGCGCGGGCCACCACCTCTTTGCCGGCGCCGGTTTCGCCCAGAATCAACACGTCGGCGCGGGTGCCGGCCAAAGCGCCGATCTGCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATg < 2:158392/150‑1 (MQ=255) cgcgccctggctttgcgccggctggtgctggacaaccgtagcctgcgtctggcactgagcgaccgccagcaactggcaacccgcctggtcggccattcaCCGGCCAAAGCGCCGATCTGCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATg‑g > 1:952321‑M1/100‑150 (MQ=255) aaCGGCCCTTCGCTGCGGCTCGACAGGTCGTGCAGCGCGCGGGCCACCACCTCTTTGCCGGCGCCGGTTTCGCCCAGAATCAACACGTCGGCGCGGGTGCCGGCCAAAGCGCCGATCTGCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATg‑g < 1:17873/150‑1 (MQ=255) cGGCCCTTCGCTGCGGCTGGACAGGTCGTGCAGCGCGCGGGCCACCACCTCTTTGCCGGCGCCGGTTTCGCCCAGAATCAACACGTCGGCGCGGGTGCCGGCCAAAGCGCCGATCTGCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATG‑Gcc < 1:562897/150‑1 (MQ=255) cgcgcgctgcacgacctgtccagccgcagcgaagggccACCACCTCTTTGCCGGCGCCGGTTTCGCCCAGAATCAACACGTCGGCGCGGGTGCCGGCCAAAGCGCCGATCTGCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATG‑GCCGACCa > 2:2058075‑M2/39‑150 (MQ=255) tttgcgccggctggtgctggacaaccgtagcctgcgtctggcactgagcgaccgccagcaactggcaacccgcctggtcggcgcgggtgCCGGCCAAAGCGCCGATCTGCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGc > 2:850110‑M1/90‑150 (MQ=255) gCTGCGGCTGGACAGGTCGTGCAGCGCGCGGGCCACCACCTCTTTGCCGGCGCCGGTTTCGCCCAGAATCAACACGTCGGCGCGGGTGCCGGCCAAAGCGCCGATCTGCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGCg > 1:2416108/1‑150 (MQ=255) 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gcCGATCTGCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACg > 2:2056255/1‑96 (MQ=255) gcCGATCTGCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAg > 1:1826790/1‑150 (MQ=255) gcCGATCTGCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGGCGAGCAg < 2:2042256/150‑1 (MQ=255) ccGATCTGCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAgg < 2:1826790/150‑1 (MQ=255) cGATCTGCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTAAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAggg > 1:1982737/1‑150 (MQ=255) gCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGTGCGTCtg < 2:1142814/150‑1 (MQ=255) gCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGGGCGCCtg > 2:732220/1‑150 (MQ=255) cTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGGGCGTCtgt < 2:806079/150‑1 (MQ=255) cTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGGGCGTCtgt > 1:310197/1‑150 (MQ=255) cTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGAAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGGGCGTCtgt > 1:1841337/1‑150 (MQ=255) tCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGGGCGTCtgtg > 1:779047/1‑150 (MQ=255) aggcgcagCATGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGGGCGTCTGTGGCAAAg > 1:1134232/1‑150 (MQ=255) cgcagCATGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTTCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGGGCGTCTGTGGCAAAGGGt < 1:103900/150‑1 (MQ=255) gcagcaTGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCGCCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGTGCAGGGCGTCTGTGGCAAAGGGtt > 2:1208059/1‑150 (MQ=255) gcagcaTGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGGGCGTCTGTGGCAAAgg < 1:1005469/147‑1 (MQ=255) gcagcaTGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGGGCGTCTGTGGCAAAgg > 2:1005469/1‑147 (MQ=255) gcagcaTGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGGGCGTCTGTGGCAAAGGGtt > 2:2256281/1‑150 (MQ=255) tggccggTGAATG‑TCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGGGCGTCTGTGGCAAAGGGTTTTTCCa < 2:1293489‑M2/143‑1 (MQ=255) tggccggTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGGGCGTCTGTGGCAAAGGGTTTTTCCa < 2:582718‑M2/143‑1 (MQ=255) tggccggTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCATGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGGGCGTCTGTGGCAAAGGGTTTTTCCa < 1:61379‑M2/143‑1 (MQ=255) ggccggTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGGGCGTCTGTGGCAAAGGGTTTTTCCAg < 2:899052‑M2/144‑1 (MQ=255) gccggTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAgg < 1:2160544‑M2/58‑1 (MQ=255) gccggTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAgg > 2:2160544‑M2/6‑63 (MQ=255) ccggTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGGGCGTCTGTGGCAAAGGGTTTTTCCAGGa > 2:1746531‑M2/5‑150 (MQ=255) ggTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGGGCGTCTGTGGCAAAGGGttt > 1:1162582‑M2/3‑140 (MQ=255) ggTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGGGCGTCTGTGGCAAAGGGttt < 2:1162582‑M2/138‑1 (MQ=255) gTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGGGCGTCTGTGGCAAAGGGTTTTTCCAGGAAGt < 1:732220‑M2/149‑1 (MQ=255) | GCCACGAACGGCCCTTCGCTGCGGCTGGACAGGTCGTGCAGCGCGCGGGCCACCACCTCTTTGCCGGCGCCGGTTTCGCCCAGAATCAACACGTCGGCGCGGGTGCCGGCCAAAGCGCCGATCTGCTCGCGCAGGCGCAGCATGGCCGGTGAATG‑GCCGACCAGGCGGGTTGCCAGTTGCTGGCGGTCGCTCAGTGCCAGACGCAGGCTACGGTTGTCCAGCACCAGCCGGCGCAAAGCCAGGGCGCGGCGCACGCTGTCGAGCAGGGCGTCTGTGGCAAAGGGTTTTTCCAGGAAGT > NC_002947/317316‑317613 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |