New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1149925 = | 104 (1.110) | 6 (0.070) | 5/234 | NT | 6.3% | intergenic (‑166/+91) | PP_1008/gapA | RNA polymerase subunit sigma‑24/glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase |
? | NC_002947 | 1150004 = | 81 (0.930) | intergenic (‑245/+12) | PP_1008/gapA | RNA polymerase subunit sigma‑24/glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase |
GGATGCCGTTTGCTTTTTTTGGGAGCAACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAAGATCGACGACAGCGG > NC_002947/1149858‑1150153 | ggATGCCGTTTGCTTTTTTTGGGAGCAACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGTTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCacac < 2:496936/150‑1 (MQ=255) gTTTGCTTTTTTTGGGAGCAACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTcgc < 1:1297898/150‑1 (MQ=255) tttGCTTTTTTTGGGTGCAACTGTCTTGCTCTTTTTCTAAAAGCTGGCGCTATCCCTTGGCGAGCGGGCTTGCCCGCAAACACGGGCTAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTCTTGGCTTCGCGCGCCAAACCTCTCCCACACGGGTcgcg > 2:56023/1‑150 (MQ=18) tGCTTTTTTTGGGAGCAACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTc < 1:1055847/150‑1 (MQ=255) gCTTTTTTTGGGAGCAACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTca > 1:2323987/1‑150 (MQ=255) tttttttGGGAGCAACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTTCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGGCGCGTcagc > 1:1474051/1‑150 (MQ=255) tttttttGGGAGCAACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACgg > 2:794453/1‑139 (MQ=255) tttttttGGGAGCAACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACgg < 1:794453/139‑1 (MQ=255) tttttttGGGAGCAACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCAGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGGCGCGTcagc > 1:1473951/1‑150 (MQ=255) ttttttGGGAGCAACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTGGCGGcagcc > 2:1023415/1‑150 (MQ=255) ttGGGAGCAACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCagccagcc < 1:1962190/150‑1 (MQ=255) aaCTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACgg > 1:224170/1‑126 (MQ=255) aaCTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACgg < 2:224170/126‑1 (MQ=255) tCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGt < 1:1275626/141‑1 (MQ=255) tCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGt > 2:1275626/1‑141 (MQ=255) cTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAg < 1:1850382/150‑1 (MQ=255) cTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAg < 1:132144/150‑1 (MQ=255) ttGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCTCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGTAATGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAgg < 1:1023415/150‑1 (MQ=255) tGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGc > 2:555279/1‑150 (MQ=255) 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tCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGt > 2:534194/1‑150 (MQ=255) tCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCATCACAACAACCACACTGTACGGTTCGATGTCGTTGCTGCCCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGt > 2:1462186/1‑150 (MQ=18) cAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGtt < 1:555279/150‑1 (MQ=255) aaTTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTg > 1:1365057/1‑150 (MQ=255) aaTTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGACTTGCCCGTGACCAACGCAGACGCCGCTTCCACGCACCACGGTCTTTGCTTCTCCTGCAAGGCCGCTCCCCCACGGGTACAGTCAACCAGCCCGCTTCAACGCCACGCAGGTg > 2:514149/1‑150 (MQ=12) aTTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGt < 2:2427979/150‑1 (MQ=255) tCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCa > 2:1869845/1‑150 (MQ=255) tAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGc > 2:45177/1‑150 (MQ=255) aaaaGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGCAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCa < 1:2367530/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCa < 2:2299597/135‑1 (MQ=255) gCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCa > 1:2299597/1‑135 (MQ=255) cTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCgg < 1:180540/150‑1 (MQ=255) ggCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGtt < 2:2323987/150‑1 (MQ=255) gcgATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCACGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCt < 1:453285/150‑1 (MQ=255) aTCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGaa > 1:1645543/1‑150 (MQ=255) 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acGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCgg < 1:265161/150‑1 (MQ=255) ggTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGt < 1:2069793/150‑1 (MQ=255) gtTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGtt < 1:1335157/102‑1 (MQ=255) gtTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGtt > 2:1335157/1‑102 (MQ=255) ttGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGccc < 1:160265/142‑1 (MQ=255) ttGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGccc > 2:160265/1‑142 (MQ=255) ggCTGCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGtt < 1:514149/150‑1 (MQ=255) gCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCATCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTg > 1:1353698/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGc > 1:654596/1‑150 (MQ=255) cgcgGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTAGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCAt < 1:2121979/150‑1 (MQ=255) gggCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGa > 2:281391/1‑150 (MQ=255) ggCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGaa < 1:1349666/150‑1 (MQ=255) ggCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGaa < 1:2028916/150‑1 (MQ=255) gcaagcccgctcccCCACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAAg < 2:2124321‑M2/136‑1 (MQ=255) aaGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAAGAt > 2:1044106/1‑150 (MQ=255) gCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAAGATcga > 1:1313020/1‑150 (MQ=255) ccACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGc < 2:1100627‑M2/59‑1 (MQ=255) ccACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGc > 1:1100627‑M2/3‑61 (MQ=255) acacGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCa < 1:2285535/84‑1 (MQ=255) acacGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCa > 2:2285535/1‑84 (MQ=255) acacGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAAGATCGACGACAGCgg < 2:1645543/150‑1 (MQ=255) acacGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAAGATCGACGACAGCgg > 2:630835/1‑150 (MQ=255) acacGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAAGATCGACGACAGCgg < 1:1044106/150‑1 (MQ=255) | GGATGCCGTTTGCTTTTTTTGGGAGCAACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCACGGTGTTGGCTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAAGATCGACGACAGCGG > NC_002947/1149858‑1150153 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |