New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 1472891 | 80 (0.920) | intergenic (‑58/+20) | alg8/algD | glycosyltransferase Alg8/GDP‑mannose 6‑dehydrogenase |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
AGGGCCAGGGCGATCAGCATGAGCAGGCTCATGTAGAGCAGCCACCCGGCGCACTGCAACAGCACTGTCTGGAGCCTTTGCATGTTCAGCATCCGTCGAGAATTCGGGAAAGGGTGGGCAGCGAGGAG‑GCGGCTCTTGTCGAGTGCCTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCATGAAGCCGACCAGGTCGATCACCTGCTTGCCGGCTGGCGCTTGCAGGGCCAGCGCACGGAACTGCTCGTCACGGTTGCCG > NC_002947/1472742‑1473040 | agggtcagggcGATCAGCATGAGCAGGCTCATGTAGAGCAGCCACCCGGCGCACCGCAACAGGACTGGCTGGAGCCTTTGCATGTTCAGCATCCGTCGAGAATTCGGGAAAGGGTGGGCAGCGAGGAG‑GCGGCTCTCGTCGAGTGGCTCa > 2:454815/1‑150 (MQ=255) agggccagggcGATCAGCATGAGCAGGCTCATGTAGAGCAGCCACCCGGCGCACTGCAACAGCACTGTCTGGAGCCTTTGCATGTTCAGCATCCGTCGAGAATTCGGGAAAGGGTGGGCAGCGAGGAG‑GCGGCTCTTGTCGAGTGCCTCa < 2:2395547/150‑1 (MQ=255) gCCAGGGCGATCAGCATGAGCAGGCTCATGTAGAGCAGCCACCCGGCGCACTGCAACAGCACTGTCTGGAGCCTTTGCATGTTCAGCATCCGTCGAGAATTCGGGAAAGGGTGGGCAGCGAGGAG‑GCGGCTCTTGTCGAGTGCCTCAtcg < 1:855164‑M2/150‑4 (MQ=255) 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tCATGTAGAGCAGCCACCCGGCGCACTGCAACAGCACTGTCTGGAGCCTTTGCATGTTCAGCATCCGTCGAGAATTCGGGAAAGGGTGGGCAGCGAGGAG‑GCGGCTCTTGTCGAGTGCCTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACcagca > 2:69513/1‑150 (MQ=255) aTGTAGAGCAGCCACCCGGCGCACTGCAACAGCACTGTCTGGAGCCTTTGCATGTTCAGCATCCGTCGAGAATTCGGGAAAGGGTGGGCAGCGAGGAG‑GCGGCTCTTGTCGAGTGCCTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGa > 1:156079/1‑150 (MQ=255) tGTAGAGCAGCCACCCGGCGCACTGCAACAGCACTGTCTGGAGCCTTTGCATGTTCAGCATCCGTCTAGAATTCGGGAAAGGGTGGGCAGCGAGGAG‑GCGGCTCTTGTCGAGTGCCTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGAt > 2:1182779/1‑150 (MQ=255) tAGAGCAGCCACCCGGCGCACTGGAACAGCACTGGCTGGAGCCTGTGCATGTTCAGCATCCGTCGAGAATGCGGGAAAGGGTGGGCAGCGAGGAG‑GCGGCTCTTGTCGAGTGCCTCATCGCTGCCCGTCCGGGCACTTACCAGCAGATGc < 2:492817/150‑1 (MQ=255) tAGAGCAGCCACCCGGCGCACTGCAACAGCACTGTCTGGAGCCTTTGCATGTTCAGCATCCGTCGAGAATTCGGGAAAGGGTGGGCAGCGAGGAG‑GCGGCTCTTGTCGAGTGCCTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGc > 1:381473/1‑150 (MQ=255) 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ggcTCTTGTCGAGTGCCTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCATGAAGCCGACCAGGTCGATCACCTGCTTGCCGGCTGGCGCTTGCAGGGCCAGCGCACGGaa < 1:1716019/150‑1 (MQ=255) tctTGTCGAGTGCCTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCATGAAGCCGACCAGGTCGATCACCTGCTTGCCGGCTg > 1:1064398/1‑122 (MQ=255) tctTGTCGAGTGCCTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCATGAAGCCGACCAGGTCGATCACCTGCTTGCCGGCTg < 2:1064398/122‑1 (MQ=255) tctTGTCGAGTGCCTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCATGAAGCCGACCAGGTCGATCACCTGCTTGCCGGCTGGCGCTTGCAGGGCCAGCGCACGGAACTg > 1:254620/1‑150 (MQ=255) ttGTCGAGTGCCTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGttt < 2:1999237/79‑1 (MQ=255) ttGTCGAGTGCCTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGttt > 1:1999237/1‑79 (MQ=255) tGTCGAGTGCCTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCATGAAGCCGACCa < 1:776127/95‑1 (MQ=255) tGTCGAGTGCCTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCATGAAGCCGACCa > 2:776127/1‑95 (MQ=255) tGTCGAGTCCCGCATCGCTGCCCGGCCGGGCACCTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGCGCGGTGGTGTTGGTCGGTTTGTTCATGACGCCGACCCGGTCGATCACCTGCTTGCCGGCTGGCGCTTGCAGGGCCAGCGCACGGAACTGCTc < 2:1306224/150‑1 (MQ=255) tCGAGTGCCTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCa > 1:1301189/1‑81 (MQ=255) tCGAGTGCCTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCa < 2:1301189/81‑1 (MQ=255) gAGTGCCTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCATGAAGCCGACCAGGTCGATCACCTGCTTGCCGGCTGGCGCTTGCAGGGCCAGCGCACGGAACTGCTCGTCa < 1:69513/150‑1 (MQ=255) gTGCCTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCATGAAGCCGACCAGGTCGATCACCTGCTTGCCGGCTGGCGCTTGCAGGGCCAGCGCACGGAACTGCTCGTCACg > 2:2023610/1‑150 (MQ=255) ccTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCATGAAGCCGACCAGGTCGATCACCTGCTTGCCGGCTGGCGCt < 1:1690158/115‑1 (MQ=255) ccTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCATGAAGCCGACCAGGTCGATCACCTGCTTGCCGGCTGGCGCt > 2:1690158/1‑115 (MQ=255) cTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCATGAAGCCGACCAGGTCGATCACCTGCt < 1:1040510/100‑1 (MQ=255) cTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCATGAAGCCGACCAGGTCGATCACCTGCt > 2:1040510/1‑100 (MQ=255) cTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCATGAAGCCGACCAGGTCGATCACCTGCTTGCCGGCTGGCGCTTGCAGGGCCAGCGCACGGAACTGCTCGTCACGGTTg > 2:560412/1‑150 (MQ=255) cTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCATGAAGCCGACCAGGTCGATCACCTGCTTGCCGGCTGGCGCTTGCAGGGCCAGCGCACGGAACTGCTCGTCACGGTTg > 1:805991/1‑150 (MQ=255) tCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCATGAAGCCGACCAGGTCGATCACCTGCTTGCCGGCTGGCGCTTGCAGGGCCAGCGCACGGAACTGCTCGTCACGGTTGc > 1:1252267/1‑150 (MQ=255) tCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCATGAAGCCGACCAGGTCGATCACCTGCTTGCCGGCTGGCGCTTGCAGGGCCAGCGCACGGAACTGCTCGTCACGGTTGc > 1:731500/1‑150 (MQ=255) cATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCATGAAGCCGACCAGGTCGATCACCTGCTTGCCGGCTGGCGCTTGCAGGGCCAGCGCACGGAACTGCTCGTCACGGTTGcc > 1:411369/1‑150 (MQ=255) aTCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTTTTCATGAAGCCGACCAGGTCGATCACCTGCTTGCCGGCTGGCGCTTGCCGGGCCACCGCAAGGAACTCCACGTCCCGGCTgacc > 2:367977/1‑147 (MQ=255) | AGGGCCAGGGCGATCAGCATGAGCAGGCTCATGTAGAGCAGCCACCCGGCGCACTGCAACAGCACTGTCTGGAGCCTTTGCATGTTCAGCATCCGTCGAGAATTCGGGAAAGGGTGGGCAGCGAGGAG‑GCGGCTCTTGTCGAGTGCCTCATCGCTGCCCGGCCGGGCACTTACCAGCAGATGCCTTCGGTACGGGCGGTGGTGCTGGTCGGTTTGTTCATGAAGCCGACCAGGTCGATCACCTGCTTGCCGGCTGGCGCTTGCAGGGCCAGCGCACGGAACTGCTCGTCACGGTTGCCG > NC_002947/1472742‑1473040 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |