| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
CTGGCTCTGGATGATTTGGCAGTGACCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCAGCTACGGCCCGCTGGATGCGGTGGGTGAGAGCTTGTCGCGTACCTGGAACATGAGCGTCCTGACCCTTGAATCGCT > NC_002947/1792137‑1792432 | cTGGCTCTGGATGATTTGGCAGTGCCCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAg > 2:452224‑M2/1‑149 (MQ=255)cTGGCTCTGGATGATTTGGCAGTGACCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAg > 1:384767‑M2/1‑149 (MQ=255)cTGGCTCTGGATGATTTGGCAGTGACCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAg > 1:1303803‑M2/1‑149 (MQ=255) tGGCTCTGGATGATTTGGCAGTGACCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAgg > 1:50457‑M2/1‑148 (MQ=255) ggCTCTGGATGATTTGGCAGTGACCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAggc > 1:572606‑M2/1‑147 (MQ=255) tctGGATGATTTGGCAGTGACCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAggcagt < 2:838133‑M2/150‑7 (MQ=255) tctGGATGATTTGGCAGTGACCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAg < 1:237502‑M2/145‑2 (MQ=255) tctGGATGATTTGGCAGTGACCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAg > 2:237502‑M2/1‑144 (MQ=255) tctGGATGATTTGGCAGTGACCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGAAACGGTGGTGCTTTTAGTGGTGCGCGAGGTCTCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAggcagt > 1:1485102‑M2/1‑144 (MQ=255) ctGGATGATTTGGCAGTGACCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTc < 2:681826/150‑1 (MQ=255) ggATGATTTGGCAGTGACCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCgg < 2:2204878/150‑1 (MQ=255) ggATGATTTGGCAGTGACCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCgg > 2:384969/1‑150 (MQ=255) tgatTTGGCAGTGACCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTgg < 1:1951885/150‑1 (MQ=255) gatTTGGCAGTGACCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGc < 1:1252247/150‑1 (MQ=255) atTTGGCAGTGACCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAg > 1:712909‑M2/1‑136 (MQ=255) atTTGGCAGTGACCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAg < 2:712909‑M2/137‑2 (MQ=255) ggaGTGACCGAATGGCAGCAGGTAGTAGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGGGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGGACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCtt < 1:941762/148‑1 (MQ=255) gCAGTGACCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCtt > 2:447171/1‑150 (MQ=255) gTGACCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGgc > 2:467327/1‑150 (MQ=255) tGACCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGCAACTGCCGGGGACCTGGGCCCGCAAGGGGGGGGGCAAGGCAGTCGGGGGCTAGCTTGgcg > 2:284894/1‑150 (MQ=255) ccGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTg < 1:2020047/150‑1 (MQ=255) cGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCTCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTgg > 2:373170/1‑150 (MQ=255) cagcagGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCaaa < 2:74926/150‑1 (MQ=255) cagcagGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCaaa < 1:454282/150‑1 (MQ=255) agcagGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAg > 2:1041361/1‑150 (MQ=255) gTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCACGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGTTCTTTGGTCAAAGGTGGc < 2:1165694/150‑1 (MQ=255) gTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGt > 1:1563594/1‑120 (MQ=255) gTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGt < 2:1563594/120‑1 (MQ=255) gTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGc < 1:311445/150‑1 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2:1632348/1‑113 (MQ=255) ttGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCAGCTACGGCCCGCTGGATGCGGTGGGTGAGAGCTTGTCGCGTACCTGGAACATGAGc < 2:1786397/150‑1 (MQ=255) cccGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCAGCTACGGCCCGCTGGATGCGGTGGGTGAGAGCTTGt > 2:2245734/1‑126 (MQ=255) cccGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCAGCTACGGCCCGCTGGATGCGGTGGGTGAGAGCTTGt < 1:2245734/126‑1 (MQ=255) cccGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCAGCTACGGCCCGCTGGATGCGGTGGGTGAGAGCTTGTCGCGTACCTGGAACATGAGCGTcc < 1:109413/150‑1 (MQ=255) ccGCGAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTcc > 2:397262/1‑80 (MQ=255) ccGCGAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTcc < 1:397262/80‑1 (MQ=255) ccGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTTGTGTCAAAGGTGGCGATTGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCAGCTACGGCCCGCTGGATGCGGTGGGTGAGAGCTTGTCGCGTACCTGGAACATGAGCGTCCt > 2:1928731/1‑150 (MQ=255) ccGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCAGCTACGGCCCGCTGGATGCGGTGGGAGAGAGCTTGTCGCGTACCTGGAACATGAGCGTCCt > 2:1687737/1‑150 (MQ=255) gCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCAGc < 1:1582192/89‑1 (MQ=255) gCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCAGc > 2:1582192/1‑89 (MQ=255) gCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCAGCTACGGCCCGCTGGATGCGGTGGGTGAGAGCTTGTCGCGTACCTGGAACATGAGAGTCATgc > 2:1451685/1‑149 (MQ=255) cAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCAGCTACGGCCCGCTGGATGCGGTGGGTGAGAGCTTGTCGCGTACCTGGAACATGAGCGTCCTGAc < 1:1201277/150‑1 (MQ=255) gggAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCAGCTACGGCCCGCTGGATGCGGTGGGTGAGAGCTTGTcg < 2:2157458/119‑1 (MQ=255) gggAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTACCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCAGCTACGGCCCGCTGGATGCGGTGGGTGAGAGCTTGTcg > 1:2157458/1‑119 (MQ=255) gAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCAGCTACGGCCCGCTGGATGCGGTGGGTGAGAGCTTGTCGCGTAACTGGAACATGAGCGTCCTGACCCTTGaa < 2:2264504/150‑1 (MQ=255) cAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCAGCTACGGCCCGCTGGATGCGGTGGGTGAGAGCTTGTCGCGt < 1:1436696/115‑1 (MQ=255) cAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCAGCTACGGCCCGCTGGATGCGGTGGGTGAGAGCTTGTCGCGt > 2:1436696/1‑115 (MQ=255) cAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCAGCTACGGCCCGCTGGATGCGGTGGGTGAGAGCTTGTCGCGTACCTGGAACATGAGCGTCCTGACCCTTGAATCGCt < 1:1667595/150‑1 (MQ=255) aaGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCa > 1:1613522/1‑73 (MQ=255) aaGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCa > 1:1613255/1‑73 (MQ=255) aaGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCa < 2:1613522/73‑1 (MQ=255) aaGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCa < 2:1613255/73‑1 (MQ=255) | CTGGCTCTGGATGATTTGGCAGTGACCGAATGGCAGCAGGTAGTCGACCGCGTGCGCGCCCGCCCGGATGCCAAGGTCGTGGTGCGAGTGGAGCGCGACGGCGCTGCCCTGGAACTGCCGGTGACCTTGGCCCGCAAGGGGGAGGGCAAGGCAGTCGGTGGCTATCTTGGCGCTGGTGTCAAAGGTGGCGAATGGCCTGCCAACATGCTCCGCGAAATCAGCTACGGCCCGCTGGATGCGGTGGGTGAGAGCTTGTCGCGTACCTGGAACATGAGCGTCCTGACCCTTGAATCGCT > NC_002947/1792137‑1792432 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |