| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 2298415 | 103 (1.100) | 5 (0.060) | 5/232 | NT | 5.1% | coding (1750/3645 nt) | sbcC | exonuclease subunit SbcC |
| ? | NC_002947 | = 2298442 | 91 (1.050) | coding (1723/3645 nt) | sbcC | exonuclease subunit SbcC | |||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GCTCTGCAGCAGCGCTTCTGGCTGATGGAAGGGGTGTTCGGCGCTGCCACAGACCGGGCAGGGTTCGCCGTCACGCAGTTGGTTACGCAGTTCTTCGACGCTGGTGTTGCGTGCCAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGCCTTGGCGGCGGTGCCTTCGGTAATCAGTTGCTGGCGTTGCAGCATGGCCTGCTGCTGCCGTTCGCGCAGGGCATCCAGCTGCTGGCGCAGCTCCTGTTCACGGCCGTGCAGGC > NC_002947/2298293‑2298585 | gCTCTGCAGCAGCGCTTCTGGCTGATGGAAGGGGTGTTCGGCGCTGCCACAGACCGGGCAGGGTTCGCCGTCACGCAGTTGGTTACGCAGTTCTTCGACGCTGGTGTTGCGTGCCAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGt < 1:56324/150‑1 (MQ=255) ctctGCAGCAGCGCTTCTGGCTGATGGAAGGGGTGTTCGGCGCTGCCACAGACCGGGCAGGGTTCGCCGTCACGCAGTTGGTTACGCAGTTCTTCGACGCTGGTGTTGCGTGCCAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTc > 2:2332607‑M2/1‑149 (MQ=255) tGCAGCAGCGCTTCTGGCTGATGGAAGGGGTGTTCGGCGCTGCCACAGACCGGGCAGGGTTCGCCGTCACGCAGTTGGTTACGCAGTTCTTCGACGCTGGTGTTGCGTGCCAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTcaac > 1:1456309‑M2/1‑146 (MQ=255) cagcagCGCTTCTGGCTGATGGAAGGGGTGTTCGGCGCTGCCACAGACCGGGCAGGGTTCGCCGTCACGCAGTTGGTTACGCAGTTCTTCGACGCTGGTGTTGCGTGCCAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTcaacgc > 1:1650938‑M2/1‑144 (MQ=255) agcagcGCTTCTGGCTGATGGAAGGGGTGTTCGGCGCTGCCACAGACCGGGCAGGGTTCGCCGTCACGCAGTTGGTTACGCAGTTCTTCGACGCTGGTGTTGCGTGCCAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTcaacgcc < 2:112984‑M2/150‑8 (MQ=255) agcGCTTCTGGCTGATGGAAGGGGTGTTCGGCGCTGCCACAGACCGGGCAGGGTTCGCCGTCACGCAGTTGGTTACGCAGTTCTTCGACGCTGGTGTTGCGTGCCAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGt > 1:1711862/1‑150 (MQ=255) gcgcTTCTGGCTGATGGAAGGGGTGTTCGGCGCTGCCACAGACCGGGCAGGGTTCGCCGTCACGCAGTTGGTTACGCAGTTCTTCGACGCTGGTGTTGCGTGCCAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGtt > 1:1410908/1‑150 (MQ=255) gcTTCTGGCTGATGGAAGGGGTGTTCGGCGCTGCCACAGACCGGGCAGGGTTCGCCGTCACGCAGTTGGTTACGCAGTTCTTCGACGCTGGTGTTGCGTGCCAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTcg > 1:1553732/1‑150 (MQ=255) tCTGGCTGATGGAAGGGGTGTTCGGCGCTGCCACAGACCGGGCAGGGTTCGCCGTCACGCAGTTGGTTACGCAGTTCTTCGACGCTGGTGTTGCGTGCCAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTcggcg < 2:2370561/150‑1 (MQ=255) cTGGCTGATGGAAGGGGTGTTCGGCGCTGCCACAGACCGGGCAGGGTTCGCCGTCACGCAGTTGGTTACGCAGTTCTTCGACGCTGGTGTTGCGTGCCAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGCCAACGCCTGTTcggcgg > 1:1397093/1‑150 (MQ=255) tGGCTGATGGAAGGGGTGTTCGGCGCTGCCACAGACCGGGCAGGGTTCGCCGTCACGCAGTTGGTTACGCAGTTCTTCGACGCTGGTGTTGCGTGCCAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCggcggc > 1:212172/1‑150 (MQ=255) ggCTGATGGAAGGGGTGTTCGGCGCTGCCACAGACCGGGCAGGGTTCGCCGTCACGCAGTTGGTTACGCAGTTCTTCGACGCTGGTGTTGCGTGCCAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGcc > 2:1141439/1‑150 (MQ=255) ggCTGATGGAAGGGGTGTTCGGCGCTGCCACAGACCGGGCAGGGTTCGCCGTCACGCAGTTGGTTACGCAGTTCTTCGACGCTGGTGTTGCGTGCCAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGcc < 1:2228678/150‑1 (MQ=255) tGATGGAAGGGGTGTTCGGCGCTGCCACAGACCGGGCAGGGTTCGCCGTCACGCAGTTGGTTACGCAGTTCTTCGACGCTGGTGTTGCGTGCCAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTcc > 2:2082775/1‑150 (MQ=255) ggAAGGGGTGTTCGGCGCTGCCACAGACCGGGCAGGGTTCGCCGTCACGCAGTTGGTTACGCAGTTCTTCGACGCTGGTGTTGCGTGCCAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCt > 2:2207189/1‑150 (MQ=255) ggggTGTTCGGCGCTGCCACAGACCGGGCAGGGTTCGCCGTCACGCAGTTGGTTACGCAGTTCTTCGACGCTGGTGTTGCGTGCCAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGc < 1:1693928/150‑1 (MQ=255) ggggTGTTCGGCGCTGCCACAGACCGGGCAGGGTTCGCCGTCACGCAGTTGGTTACGCAGTTCTTCGACGCTGGTGTTGCGTGCCAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGACCTCCAGCTCGGc < 2:833763/150‑1 (MQ=255) ggTGTTCGGCGCTGCCACAGACCGGGCAGGGTTCGCCGTCACGCAGTTGGTTACGCAGTTCTTCGACGCTGGTGTTGCGTGCCAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGCCt > 2:498985/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) ccAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGCCTTGGCGGCGGTGCCTTCGGTAATCAGTTGCTGGCGTTGCAGCATGGCCTGCTGCTGCCGTTCGCGCAGGGCATCCAgctgct < 2:1823941/150‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGCCTTGGCGGCGGTGCCTTCGGTAATCAGTTGCTGGCGTTGCAGCATGGCCTGCTGCTGCCGTTCGCGCAGGGCATCCAGctgctg > 2:1068460/1‑150 (MQ=255) ggcgttggcgttCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTcaacgcctggcacgcaacaccagcgtcgaagaactgcgtaaccaactgcgtgacggcgaaccctgcccggtctgtggcagcgccgaacaccccttccatcagccagaagcgctgct < 1:128265‑M2/150‑117 (MQ=255) ttggcgttCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTcaacgcctggcacgcaacaccagcgtcgaagaactgcgtaaccaactgcgtgacggcgaaccctgcccggtctgtggcagcgccgaacac < 1:2032702‑M2/120‑91 (MQ=255) ttggcgttCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTcaacgcctggcacgcaacaccagcgtcgaagaactgcgtaaccaactgcgtgacggcgaaccctgcccggtctgtggcagcgccgaacac > 2:2032702‑M2/1‑30 (MQ=255) ttggcgttCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGCCTTGGCGGCGGTGCCTTCGGTAATCAGTTGCTGGCGTTGCAGCATGGCctgctgctg > 2:1846011/1‑117 (MQ=255) ttggcgttCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGCCTTGGCGGCGGTGCCTTCGGTAATCAGTTGCTGGCGTTGCAGCATGGCctgctgctg < 1:1846011/117‑1 (MQ=255) tggcgttCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTcaacgcctggcacgcaacaccagcgtcgaagaactgcgtaaccaactgcgtgacggcgaaccctgcccggtctgtggcagcgccgaacaccccttccatcagccagaagcgctgctgcaga < 1:1569053‑M2/150‑122 (MQ=255) gcgttCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGCCTTGGCGGCGGTGCCTTCGGTAATCAGTTGCTGGCGTTGCAGCATGGCCTGCTGCTGCCGTTCGCGCAGGGCATCCAGCTGCTGGCGCAGCTc < 2:212172/150‑1 (MQ=255) gttCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGCCTTGGCGGCGGTGCCTTCGGTAATCAGTTGCTGGCGTTGCAGCATGGCCTGCTGCTGCCGTTCGCGCAGGGCATCCAGCTGCTGGCGCAGCTCCt > 1:699270/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGCCTTGGCGGCGGTGCCTTCGGTAATCAGTTGCTGGCGTTGCAGCATGGCCTGCTGCTGCCGTTCGCGCAGGGCATCCAGCTGCTGGCGCAGCTCCTg < 1:2311773/150‑1 (MQ=255) ttCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGCCTTGGCGGCGGTGCCTTCGGTAATCAGTTGCTGGCGTTGCAGCATGGCCTGCTGCTGCCGTTCGCGCAGGGCATCCAGCTGCTGGCGCAGCTCCTg < 2:2223199/150‑1 (MQ=255) cagcagTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGCCTTGGCGGCGGTGCCTTCGGTAATCAGTTGCTGGCGTTGCAGCATGGCCtgctgctgc < 1:2075594/109‑1 (MQ=255) cagcagTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGCCTTGGCGGCGGTGCCTTCGGTAATCAGTTGCTGGCGTTGCAGCATGGCCtgctgctgc > 2:2075594/1‑109 (MQ=255) cagcagTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCCCCAGCTCGGCCTTGGCGGCGGTGCCCTCGGGAATCACTTGCCGGCGTTGCTGCATGGAAAACTGCTGCCGCTCGCGCAGGGCATCCAGCTGCTGGCGCAGCTGCTGTTc > 2:673965/1‑150 (MQ=255) agcagTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGCCTTGGCGGCGGTGCCTTCGGTAATCAGTTGCTGGCGTTGCAGCATGGCCTGCTGCTGCCGTTCGCGCAGGGCATCCAGCTGCTGGCGCAGCTCCTGTTCa > 1:1447376/1‑150 (MQ=255) agcagTTGACGGGTGAGCGTAAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGCCTTGGCGGCGGTGCCTTCGGTaa > 1:533159/1‑73 (MQ=255) agcagTTGACGGGTGAGCGTAAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGCCTTGGCGGCGGTGCCTTCGGTaa < 2:533159/73‑1 (MQ=255) tGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGCCTTGGCGGCGGTGCCTTCGGTAATCAGTTGCTGGCGTTGCAGCATGGCCTGCTGCTGCCGTTCGCGCAGGGCATCCAGCTGCTGGCGCAGCTCCTGTTCACGGCCg < 2:533439/150‑1 (MQ=255) gggTGAGCGTcaacgcctggcacgcaacaccagcgtcgaagaactgcgtaaccaactgcgtgacggcgaaccctgcccggtctgtggcagcgccgaacaccccttccatcagccagaagcgctgctgcagagcctgggccgccatgacca > 2:128265‑M2/1‑10 (MQ=255) tGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGCCTTGGCGGCGGTGCCTTCGGTAATCAGTTGCTGGCGTTGCAGCATGGCCTGCTGCTGCCGTTCGCGCAGGGCATCCAGCTGCTGGCGCAGCTCCTGTTCACGGCCGTGCAGGc < 1:938499/150‑1 (MQ=255) cGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGTCTTggcgg < 1:2040075/41‑1 (MQ=255) cGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGTCTTggcgg > 2:2040075/1‑41 (MQ=255) | GCTCTGCAGCAGCGCTTCTGGCTGATGGAAGGGGTGTTCGGCGCTGCCACAGACCGGGCAGGGTTCGCCGTCACGCAGTTGGTTACGCAGTTCTTCGACGCTGGTGTTGCGTGCCAGGCGTTGGCGTTCCAGCAGTTGACGGGTGAGCGTCAACGCCTGTTCGGCGGCCTCCAGCTCGGCCTTGGCGGCGGTGCCTTCGGTAATCAGTTGCTGGCGTTGCAGCATGGCCTGCTGCTGCCGTTCGCGCAGGGCATCCAGCTGCTGGCGCAGCTCCTGTTCACGGCCGTGCAGGC > NC_002947/2298293‑2298585 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |