New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2516982 = | 96 (1.030) | 6 (0.070) | 6/236 | NT | 6.3% | coding (300/864 nt) | PP_2210 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 2517002 = | 88 (1.000) | coding (320/864 nt) | PP_2210 | LysR family transcriptional regulator |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
GACCGAGGAGGGCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCT > NC_002947/2516853‑2517143 | gACCGAGGAGGGCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGAGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCGAGCTTCCGCCCCAATGACAGTTGCTTACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATAGGGTCTTT‑‑CCGGTGCt > 1:768332/1‑150 (MQ=255) gggCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCCTGCTTGAGGGTAACCTCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCgctgct > 1:1486203/1‑150 (MQ=255) gggCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGgcgc < 1:1554666/146‑1 (MQ=255) ggCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGgc < 1:1866125/143‑1 (MQ=255) ggCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGgc > 2:1866125/1‑143 (MQ=255) ggCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGctgctg > 1:1443309/1‑150 (MQ=255) ggCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGctgctg > 1:245602/1‑150 (MQ=255) gCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCTATCTGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGAAATCGGTCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCtgctgc < 1:191000/150‑1 (MQ=255) aCGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGt > 1:2206793/1‑150 (MQ=255) gcCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGc > 2:1434016/1‑150 (MQ=255) gcCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGc > 2:276351/1‑150 (MQ=255) cTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCgg > 2:208016/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGt < 2:849715/150‑1 (MQ=255) 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ccgccgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGaaa < 2:354680/150‑1 (MQ=255) ccgccgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGaaa > 2:196286/1‑150 (MQ=255) gccgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCATGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATc > 2:1891214/1‑150 (MQ=255) gccgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATc > 1:2216755/1‑150 (MQ=255) gccgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATc > 1:1226872/1‑150 (MQ=255) agcagcgccaGCATCGG‑‑CATGACCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAg > 1:1043233‑M1/11‑92 (MQ=255) agcagcgccaGCATCGG‑‑CATGACCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAg < 2:1043233‑M1/82‑1 (MQ=255) gcagcgccaGCATCGG‑‑CATGACCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCtt > 1:162456‑M1/10‑99 (MQ=255) gcagcgccaGCATCGG‑‑CATGACCCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCtt < 2:162456‑M1/90‑1 (MQ=255) cgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGa < 1:340600/150‑1 (MQ=255) cgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGa < 1:213412/150‑1 (MQ=255) cgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCCGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGa < 1:24846/150‑1 (MQ=255) cgACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCCCTCCGCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGa < 1:24577/150‑1 (MQ=255) gACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAg < 2:2216755/150‑1 (MQ=255) gACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAg < 2:2284358/150‑1 (MQ=255) ggCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCcg > 2:1236002/1‑150 (MQ=255) ccGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCg < 2:323022/118‑1 (MQ=255) ccGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCg > 1:323022/1‑118 (MQ=255) ccagcatcggcatgacccgatgcGGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCcgcg > 2:1770088‑M2/24‑150 (MQ=255) cGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCa < 2:315536/150‑1 (MQ=255) GCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCGGCGCaa < 1:1218047‑M1/150‑1 (MQ=255) ATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAgg > 1:650515‑M1/1‑150 (MQ=255) TCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAggg > 2:2206793‑M1/1‑150 (MQ=255) GGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCAAGCCGCGGaagggggt < 2:1714514‑M1/150‑3 (MQ=255) gcatgacccgatgcGGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCt < 1:1770088‑M2/136‑1 (MQ=255) g‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCt < 2:1870117/150‑1 (MQ=255) ccgatgcTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGc > 2:1631196‑M2/8‑101 (MQ=255) ccgatgcTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGc < 1:1631798‑M2/94‑1 (MQ=255) ccgatgcTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGc > 2:1631798‑M2/8‑101 (MQ=255) | GACCGAGGAGGGCACGCGCCTGGCGGCCATCACGCGCGCCATGTTCGGCCTGGCCGAAGAAGCGCAGGCCATGCTTGAGGCCAACCGCCAGTTGCTGACCGGGCGCCTGGAGGTAGCCGCCGACGGCCCGCATCGGGTCATG‑‑CCGATGCTGGCGCTGCTGCGTGAGCGGTACCCTGGTGTCACCGTCAACTTGCGCCTGGGCAATGCTCAGGAGACCTTGGCTGCGCTGCTCGGCGAGCATGCCGACGTGGCGGTGCTGACCGAAATCGAGCCGCGCAAGGGGCTGCATCT > NC_002947/2516853‑2517143 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |