New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2626249 = | 72 (0.770) | 5 (0.060) | 5/232 | NT | 7.3% | intergenic (+9/‑141) | PP_t40/PP_2298 | tRNA‑His/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2626282 = | 61 (0.700) | intergenic (+42/‑108) | PP_t40/PP_2298 | tRNA‑His/hypothetical protein |
AAGGTTGTACCGCAAGACCGCAATATGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGCCGGTTGAAACACCGGCCCGTTTGGCCGGCAAAGGACACCACGA > NC_002947/2626138‑2626429 | aaGGTTGTACCGCAAGACCGCAATATGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTttttgttt > 1:2288458/1‑150 (MQ=255) aGGTTGTACCGCAAGACCGCAATATGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTttttgtttt < 2:2065740/150‑1 (MQ=255) aGGTTGTACCGCAAGACCGCAATATGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTttttgtttt < 2:1777027/150‑1 (MQ=255) aGGTTGTACCGCAAGACCGCAATATGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTttttgtttt < 2:2288458/150‑1 (MQ=255) ggTTGTACCGCAAGACCGCAATATGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTttttgttttg < 1:166586/150‑1 (MQ=255) ggTTGTACCGCAAGACCGCAATATGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTAAACAATGTATGCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTttttgttttg > 2:1882670/1‑150 (MQ=21) gTTGTACCGCAAGACCGCAATATGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTgg < 1:2161945/150‑1 (MQ=255) gTTGTACCGCAAGACCGCAATATGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTgg < 2:518926/150‑1 (MQ=255) gTTGTACCGCAAGACCGCAATATGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGAACGGTAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTgg < 1:1882670/150‑1 (MQ=255) gTACCGCAAGACCGCAATATGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGAGCGCCTTTTTGTTTTGGGTc < 1:1400176/150‑1 (MQ=255) cGCAAGACCGCAATATGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCg > 1:355119/1‑150 (MQ=255) aaGACCGCAATATGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAg > 1:163091/1‑150 (MQ=255) gACCGCAATATGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCg > 1:611786/1‑150 (MQ=255) cGCAATATGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGtg < 1:2115957/150‑1 (MQ=255) gCAATATGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGtga < 2:782992/150‑1 (MQ=255) gCAATATGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGtga < 1:42094/150‑1 (MQ=255) gCAATATGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGtga < 2:184529/150‑1 (MQ=255) gCAATATGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGtga < 1:87738/150‑1 (MQ=255) tatGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGt < 2:2260904/132‑1 (MQ=255) tatGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGt > 1:2260904/1‑132 (MQ=255) gtggGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGCTTCCGGTTGTGGTGGGTGCGAGTCCGATGGTCGACCCCATATGCCTGAAATTCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCcgc > 2:1466261/1‑150 (MQ=25) gtggGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCcgc > 1:1514289/1‑150 (MQ=255) tAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAg < 2:163091/150‑1 (MQ=255) cagtggattacaaggggcaggaggtgttttggctggggcgcggctcatcaccgctacgcagacccaaaacaaAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTttttgtttt > 1:1306956‑M1/73‑112 (MQ=255) cagtggattacaaggggcaggaggtgttttggctggggcgcggctcatcaccgctacgcagacccaaaacaaAAAGGCGCCTAGATCGTGAGATCGGGCGCCTttttgtttt < 2:1306956‑M1/40‑1 (MQ=255) ttGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAaca > 2:1554937/1‑150 (MQ=255) tAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAACGGGGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAGAACAcctc > 1:1991976/1‑150 (MQ=255) tGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCt > 1:1138150/1‑150 (MQ=255) ggATTGTGACTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATGCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCATGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGCTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCtt < 2:69584/150‑1 (MQ=38) aTTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCa > 2:2093682/1‑150 (MQ=255) aTTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCa > 1:1552946/1‑150 (MQ=255) ttCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCAc < 2:688431/150‑1 (MQ=255) tCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGc < 1:2199440/135‑1 (MQ=255) tCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGc > 2:2199440/1‑135 (MQ=255) ccAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACtg < 2:2076160/150‑1 (MQ=255) aGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACtggg > 2:2058264/1‑149 (MQ=255) gTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACtggtg > 2:849919/1‑150 (MQ=255) gTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACtggtg > 2:95478/1‑150 (MQ=255) tCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTttttgttt < 1:974773/77‑1 (MQ=255) tCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTttttgttt > 2:974773/1‑77 (MQ=255) ttCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACtg < 1:1456249/136‑1 (MQ=255) ttCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACtg > 2:1456249/1‑136 (MQ=255) ttCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATa > 2:2386401/1‑150 (MQ=255) gATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAACGGCCCCTTGCTCGTCCGATCTGGTGTCTTTTGGTTGTGGGTTTATGGAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATaaaa < 1:535120/150‑1 (MQ=255) gATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTttttgtt < 2:364278/66‑1 (MQ=255) gATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTttttgtt > 1:364278/1‑66 (MQ=255) gATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCaaaa < 2:2206034/107‑1 (MQ=255) gATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCaaaa > 1:2206034/1‑107 (MQ=255) gATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATaaaa < 1:849919/150‑1 (MQ=255) ttCCCATCGTCCCCCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACATACTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGc < 1:1295196/150‑1 (MQ=255) tCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCt > 1:356255/1‑150 (MQ=255) tCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCt < 2:1552946/150‑1 (MQ=255) tCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCt > 1:2091355/1‑150 (MQ=255) ccATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGACCGGGGAGCGTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCACTAGTCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGt > 1:1637560/1‑150 (MQ=255) aTCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTa > 2:397161/1‑150 (MQ=255) gTCCACCCCCTCTTCCTGCTAGGCGACCAGGAAGTCAGATCGGTCGCCTTTTTTGTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGAt < 2:2091355/150‑1 (MQ=255) aCCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCa > 1:1619153/1‑150 (MQ=255) ccATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGcc < 2:1470913/150‑1 (MQ=255) cATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGCCg < 1:1588017/150‑1 (MQ=255) aaaacaaaaaggcgcccgatctcacgatctaggcgcctttTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACtg < 2:1306956‑M2/72‑1 (MQ=255) aaaacaaaaaggcgcccgatctcacgatcaaggcgcctttTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACtg > 1:1306956‑M2/41‑112 (MQ=255) cTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGCCGGTTGaaa > 2:2288932/1‑150 (MQ=255) tGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGCCGGTTGAAac > 1:1528043/1‑150 (MQ=255) gAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTATATTTCAGCCGGTTGAAaca > 2:2077326/1‑150 (MQ=255) AAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGt > 2:160840‑M1/1‑127 (MQ=255) AAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGt < 1:160840‑M1/127‑1 (MQ=255) gcgcccgatctcacgatcaaggcgcctttTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGCCGGTTGAAACACCGGc > 1:1516807‑M2/30‑150 (MQ=255) GCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGCCGGTTGAAACACCGGc < 1:334303‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGCCGGTTGAAACACCGGccc < 1:40763‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCAAGGCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGCCGGTTGAAACACCGGccc < 1:42283‑M1/150‑1 (MQ=255) CCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGCCGGTTGAAACACCGGCCCg < 1:241304‑M1/150‑1 (MQ=255) tGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGCCGGTTGAAACACCGGCCCGttt < 1:95478/150‑1 (MQ=255) tGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGCCGGTTGAAACACCGGCCCGttt > 1:255299/1‑150 (MQ=255) tGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGCCGGTTGAAACACCGGCCCGttt < 2:1138150/150‑1 (MQ=255) gatctcacgatcaaggcgcctttTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGtga > 1:1080427‑M2/24‑48 (MQ=255) gatctcacgatcaaggcgcctttTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGtga < 2:1080427‑M2/25‑1 (MQ=255) tCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATTAAAGCTGTTAGATTTCAGCCGGTTGAAACACCGGCCCGTTTGGCCGGCAAAg < 2:919349/150‑1 (MQ=255) tCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGCCGGTTGAAACACCGGCCCGTTTGGCCGGCAAAg < 1:1466261/150‑1 (MQ=255) ccgcgcgccttgTGTTTTTGGGCCTCCCTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCGAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGCCGGTTGAAACCCCGGCCCGTTTGGCCGGCAAAg < 2:897455‑M2/138‑1 (MQ=255) gcgcctttTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGGGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACtggtgg > 2:92449‑M2/9‑84 (MQ=255) gcgcctttTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGGGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACtggtgg < 1:92449‑M2/76‑1 (MQ=255) gcgcctttTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGcc < 2:2403038‑M2/106‑1 (MQ=255) gcgcctttTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGcc > 1:2403038‑M2/9‑114 (MQ=255) gcctttTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATaaaa < 2:2109717‑M2/89‑1 (MQ=255) gcctttTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATaaaa > 1:2109717‑M2/7‑95 (MQ=255) gcctttTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGCCGGTTGAAACACCGGCCCGTTTGGCCGGCAAAGGAcacc < 1:2386401‑M2/144‑1 (MQ=255) tttTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGCCGGTTGAAACACCGGCCCGTTTGGCCGGCAAAGGACACCACg > 1:666321‑M2/4‑150 (MQ=255) ttTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGCCGGTTGAAACACCGGCCCGTTTGGCCGGCAAAGGACACCNCGa < 2:1514289‑M2/148‑1 (MQ=255) | AAGGTTGTACCGCAAGACCGCAATATGGTGGGCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCATATTCCTGAAAGGCGCCTTGATCGTGAGATCGGGCGCCTTTTTGTTTTGGGTCTGCGTAGCGGTGATGAGCCGCGCCCCAGCCAAAACACCTCCTGCCCCTTGTAATCCACTGGTGGCACCCCAATAAAAGCTGTTAGATTTCAGCCGGTTGAAACACCGGCCCGTTTGGCCGGCAAAGGACACCACGA > NC_002947/2626138‑2626429 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |