New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 3403942 = | 71 (0.760) | 5 (0.060) | 3/238 | NT | 7.2% | coding (317/360 nt) | PP_3014 | hypothetical protein |
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CCACGCAGAAGTCGATAGCCCACGGCTACCGGCTCACGGCGCCAAGCGCCGTGGCAAGCGACGATGTGCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCAGTGACCCGAGCGGGTTGTGCCGCCCCGATCGCCTGCAGTTACCCCAACTCATCCCGCTTGTTCAAATGTTCGCACTTCACCTGCGCCTCCATTCGGCTCGGATAGCTGGGTTTGAGCCG > NC_002947/3403813‑3404108 | ccACGCAGAAGTCGATAGCCCACGGCTACCGGCTCACGGCGCCAAGCGCCGTGGCAAGCGACGATGTGCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAgg > 1:1009194/1‑150 (MQ=255) gCAGAAGTCGATAGCCCACGGCTACCGGCTCACGGCGCCAAGCGCCGTGGCAAGCGACGATGTGCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑TGCCAGGCTGt > 1:366502/1‑150 (MQ=255) aGAAGTCGATAGCCCACGGCTACCGGCTCACGGCGCCAAGCGCCGTGGCAAGCGACGATGTGCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCa > 1:97629/1‑150 (MQ=255) aGAAGTCGATAGCCCACGGCTACCGGCTCACGGCGCCAAGCGCCGTGGCAAGCGACGATGTGCTTGATGGGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAATTTA‑CGCCACGCTGTCa > 2:1225022/1‑150 (MQ=255) gAAGTCGATAGCCCACGGCTACCGGCTCACGGCGCCAAGCGCCGTGGCAAGCGACGATGTGCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAg > 1:196863/1‑150 (MQ=255) gATAGCCCACGGCTACCGGCTCACGGCGCCAAGCGCCGTGGCAAGCGACGATGTGCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATg > 1:18070/1‑150 (MQ=255) aTAGCCCACGGCTACCGGCTCACGGCGCCAAGCGCCGTGGCAAGCGACGATGTGCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGc > 2:886078/1‑150 (MQ=255) tAGCCCACGGCTACCGGCTCACGGCGCCAAGCGCCGTGGCAAGCGACGATGTGCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGcc < 2:97629/150‑1 (MQ=255) aGCCCACGGCTACCGGCTCACGGCGCCAAGCGCCGTGGCAAGCGACGATGTGCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCt < 2:1215021/150‑1 (MQ=255) gCCCACGGCTACCGGCTCACGGCGCCAAGCGCCGTGGCAAGCGACGATGTGCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTg < 1:1735473/150‑1 (MQ=255) ccACGGCTACCGGCTCACGGCGCCAAGCGCCGTGGCAAGCGACGATGTGCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGa < 1:1441569/150‑1 (MQ=255) aggtgaagtgcgaacatttgaacaagcgggatgagttggggtaactgcaggcgatcggggcggcacaacccgctcgggtcactgattcaatccaggcattgcccgacagcctggcgacaagttacgccagGCTGTCAGGCAATGCCTGGa < 1:1134867‑M2/20‑1 (MQ=255) ggCTACCGGCTCACGGCGCCAAGCGCCGTGGCAAGCGACGATGTGCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGa < 1:984304/150‑1 (MQ=255) ggCTACCGGCTCACGGCGCCAAGCGCCGTGGCAAGCGACGATGTGCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGa < 1:984327/150‑1 (MQ=255) aCCGGCTCACGGCGCCAAGCGCCGTGGCAAGCGACGATGTGCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCa < 1:1165903/150‑1 (MQ=255) aCCGGCTCACGGCGCCAAGCGCCGTGGCAAGCGACGATGTGCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCa < 2:1928586/150‑1 (MQ=255) ccGGCTCACGGCGCCAAGCGCCGTGGCAAGCGACGATGTGCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCAg < 1:1866799/150‑1 (MQ=255) ccGGCTCACGGCGCCAAGCGCCGTGGCAAGCGACGATGTGCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCAg < 1:2080247/150‑1 (MQ=255) 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gcCGTGGCAAGCGACGATGTGCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCAGTGACCCGAGCGGGTTGTgc > 1:734185/1‑150 (MQ=255) aaGCGACGATGTGCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCAGTGACCCGAGCGGGTTGTGCCGCCCCGa > 2:151466/1‑150 (MQ=255) tgtgCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCAGTGACCCGAGCGGGTTGTGCCGCCCCGATCGCCTGCa < 1:1032967/150‑1 (MQ=255) cTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCAGTGACCCGAGCGGGTtgt > 2:94470/1‑127 (MQ=255) cTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCAGTGACCCGAGCGGGTtgt < 1:94470/127‑1 (MQ=255) cTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCAGTGACCCGAGCGGGTTGTGCCGCCCCGATCGCCTGCAGTTa > 2:1221696/1‑150 (MQ=255) tGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCAGTGACCCGAGCGGGTTGTGCCGCCCCGATCGCCTGCAGTTAcc < 1:151466/150‑1 (MQ=255) gtgGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCAGTGACCCGAGCGGGTTGTGCCGCCCCGATCGCCTGCAGTTACCCCaa < 1:609910/150‑1 (MQ=255) gTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTATAAGGTCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGGTATGCTGTCAGGCTACTCCTGGATTGAATTAGTTACCCGAGCGGGTTGTGCCGCCCCGATCGACTGCTGCGACTCCAACTc > 1:1355711/1‑150 (MQ=255) gACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCAGTGACCCGAGCGGGTTGTGCCGCCCCGATCGCCTGCAGTTACCCCAACTCATc > 2:1874085/1‑150 (MQ=255) aCGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCTACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCAGTGACCCGAGCGGGTTGTGCCGCCCCGATCGCCTGCAGTTACCCCAACTCATcc > 1:2295222/1‑150 (MQ=255) 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cAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCAGCGACCCGAGCGGGTTGTGCCGCCCCGATCGCCTGCAGTTACCCCAACTCATCCCGCTTGTTCAAATGTTCGCACTTCACCTGCGCCTCCATTCGGCTCGGCTAGCTgg < 2:1173465/150‑1 (MQ=255) ttA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCAGTGACCCGAGCGGGTTGTGCCGCCCCGATCGCCTGCAGTTACCCCAACTCATCCCGCTTGTTCAAATGTTCGCACTTCACCTGCGCCTCCATTCGGCTCGGATAGCTGGGttt > 2:706185/1‑150 (MQ=255) ttA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCAGTGACCCGAGCGGGTTGTGCCGCCCCGATCGCCTGCAGTTACCCCAACTCATCCCGCTTGTTCAAATGTTCGCACTTCACCTGCGCCTCCATTCGGCTCGGATAGCTGGGttt > 2:1723636/1‑150 (MQ=255) cgccagGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCAGTGACCCGAGCGGGTTGTGCCGCCCCGATCGCCTGCAGTTACCCCAACTCATCCCGCTTGTTCAAATGTTCGCACTTCACCTGCGCCTCCATTCGGCTCGGATAGCTGGGTTTGAg < 1:1671242‑M2/144‑1 (MQ=255) gccagGCTGTCAGGCAATGCCTGGCTTGAATCAGTGACCCGAGCGGGTTGTGCCGCCCCGATCGCCTGCAGTTACCCCAACTCATCCCGCTTGTTCAAATGTTCGCACTTCACCTGCGCCTCCATTCGGCTCGGATAGCTGGGTTTGAGc > 2:1625075‑M2/6‑150 (MQ=255) ctgGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCAGTGACCCGAGCGGGTTGTGCCGCCCCGATCGCCTGCAGTTACCCCAACTCATCCCGCTTGTTCAAATGTTCGCACTTCACCTGCGCCTCCATTCGGCTCGGATAGCTGGGTTTGAGCCg > 2:11205‑M2/4‑150 (MQ=255) | CCACGCAGAAGTCGATAGCCCACGGCTACCGGCTCACGGCGCCAAGCGCCGTGGCAAGCGACGATGTGCTTGATGTGGTTGACGCTCACGAGGGCAGCCGCGCGACCTTCTACAAGGGCAGCTTTCTGTCTGGCGACAAGTTA‑CGCCAGGCTGTCAGGCAATGCCTGGATTGAATCAGTGACCCGAGCGGGTTGTGCCGCCCCGATCGCCTGCAGTTACCCCAACTCATCCCGCTTGTTCAAATGTTCGCACTTCACCTGCGCCTCCATTCGGCTCGGATAGCTGGGTTTGAGCCG > NC_002947/3403813‑3404108 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |