| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 3944242 | 104 (1.110) | 6 (0.070) | 5/234 | NT | 5.7% | coding (198/507 nt) | PP_5605 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 3944252 | 103 (1.180) | coding (188/507 nt) | PP_5605 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
TCACCCATGCGGCCGATGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGCCCAGGCCAGCGCCGCGCTCACGCCG > NC_002947/3944105‑3944401 | tCACCCATGCGGCCGATGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGcc < 2:2215099‑M2/150‑3 (MQ=255) ccATGCGGCCGATGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGcctgtt < 1:1719786‑M2/150‑7 (MQ=255) ccATGCGGCCGATGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGcctgtt < 2:1794491‑M2/150‑7 (MQ=255) cATGCGGCCGATGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGcctgttc < 2:2203951‑M2/150‑8 (MQ=255) tGCGGCCGATGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCg < 2:1530955/150‑1 (MQ=255) gAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTcgc < 2:1365028/150‑1 (MQ=255) gAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTcgc < 2:1129231/150‑1 (MQ=255) aCTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCgg > 2:576360/1‑150 (MQ=255) aCTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCgg < 1:1697567/150‑1 (MQ=255) aCTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCgg < 2:130731/150‑1 (MQ=255) ctggcccggCCGTTCCGGGGCAGGCGTTTCTGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCggg < 2:1719786/143‑1 (MQ=255) tGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGc > 1:2187823/1‑150 (MQ=255) tGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGc > 1:1532220/1‑150 (MQ=255) tGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGCCTCCCGCGAcctgttcccaacccagcaatgga > 1:98925‑M2/1‑127 (MQ=255) gAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCaa > 1:763808/1‑150 (MQ=255) gAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCaa > 1:1537245/1‑150 (MQ=255) gAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCaa < 2:378554/150‑1 (MQ=255) aaGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGc > 1:985155/1‑150 (MQ=255) 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tCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGt > 1:2129228/1‑150 (MQ=255) tCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGt > 2:1839088/1‑150 (MQ=255) cATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATg < 2:1647291/146‑1 (MQ=255) cATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATg > 1:1647291/1‑146 (MQ=255) cATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATg < 2:1642331/146‑1 (MQ=255) aTTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTa < 2:1706884/92‑1 (MQ=255) aTTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTa > 1:1706884/1‑92 (MQ=255) aTTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCg > 2:703848/1‑150 (MQ=255) tGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGt < 1:1103217/150‑1 (MQ=255) cTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGc > 2:193229/1‑150 (MQ=255) tGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAAc > 2:797978/1‑135 (MQ=255) tGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGcc < 2:2391261/150‑1 (MQ=255) ttGGGAACAGGTCGCGGGAGGcctgttcccaacccagcaatggacccaacccaaaaccctggccacggtcaccgaacaacccgtgatgaccgcacctgtcgtcgccgcggccccgacggccccggaactgcctttccagttcatcggccg < 1:300707‑M2/150‑130 (MQ=255) ggAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGCCCAGGCCa > 1:1151479/1‑150 (MQ=255) gAACAGGTCGCGGGAGGcctgttcccaacccagcaatggacccaacccaaaaccctggccacggtcaccgaacaacccgtgatgaccgcacctgtcgtcgccgcggccccgacggccccggaactgcctttccagttcaccggccgcatg < 2:66088‑M2/150‑134 (MQ=255) aCAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTAGAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGCCCAGGCCAgcg > 1:1126547/1‑150 (MQ=255) gTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGCCCAGGCCAGcgccgc > 2:1895367/1‑150 (MQ=255) gTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGCCCAGGCCAGcgccgc > 1:333692/1‑150 (MQ=255) gTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGCCCAGGCCAGcgccgc > 1:900472/1‑150 (MQ=255) cgcgGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGCCCAGGCCAGCGCCgcgc < 1:438486/150‑1 (MQ=255) gggAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGCCCAGGCCAGCGCCGCGCTCa > 1:1384826/1‑150 (MQ=255) gCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTAAAATTGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGCCCAGGCCAGCGCCGCGCTCACGCCg > 1:1495994/1‑150 (MQ=255) | TCACCCATGCGGCCGATGAACTGGAAAGGCAGTTCCGGGGCCGTCGGGGCCGCGGCGACGACAGGTGCGGTCATCACGGGTTGTTCGGTGACCGTGGCCAGGGTTTTGGGTTGGGTCCATTGCTGGGTTGGGAACAGGTCGCGGGAGGCCTGTTCCGGCCCTTTCGCGGGCAAGCTCGCGCCTACAATGGACGCAGCGCTTTCTGTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGCCGCGACGCCATCGTCCTGGCCAAACCAATGGTCCGGTGCCCAGGCCAGCGCCGCGCTCACGCCG > NC_002947/3944105‑3944401 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |