New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 4666548 | 112 (1.200) | 7 (0.080) | 9/232 | NT | 6.2% | coding (268/1854 nt) | nuoL | NADH‑quinone oxidoreductase subunit L |
? | NC_002947 | = 4666557 | 109 (1.260) | coding (277/1854 nt) | nuoL | NADH‑quinone oxidoreductase subunit L |
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
CCACGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAACCTGCTGTTCATCTAC > NC_002947/4666408‑4666706 | ccACGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCg > 2:2232567/1‑150 (MQ=255) ccACGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCg > 2:313261/1‑150 (MQ=255) cACGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTTCCTGGAAGGCCTGTCGGTAACCATGCTCG‑GCGt < 2:957495‑M2/150‑2 (MQ=255) tcgGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAGCGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGTGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGCCGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GTGtg > 2:148097‑M2/2‑148 (MQ=255) aCGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGtg > 1:819663‑M2/1‑148 (MQ=255) cGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGCGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCTGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGtgg > 1:758058‑M2/1‑147 (MQ=255) cGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGtgg > 1:172296‑M2/1‑147 (MQ=255) cGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGtgg > 1:243956‑M2/1‑147 (MQ=255) ccTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGtggtgaccg < 1:2056294‑M2/150‑10 (MQ=255) ccTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGtggtgaccg > 1:313261‑M2/1‑141 (MQ=255) cTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCg‑g > 2:276817/1‑150 (MQ=255) tACGTCATCTTGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑gt > 1:1605582/1‑150 (MQ=255) tCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCACGC‑CGAGCAtggtgaccgacag < 2:1683642‑M2/145‑14 (MQ=255) tCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCACGC‑CGAGCAtggtgaccgacag > 1:1683642‑M2/1‑132 (MQ=255) ggCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGTCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTcc > 1:1118092/1‑150 (MQ=255) ggCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTcc > 2:652281/1‑150 (MQ=255) ggCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTcc < 1:1538467/150‑1 (MQ=255) gCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCt > 2:1116227/1‑150 (MQ=255) ttCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGtggtgac > 1:611246‑M2/1‑124 (MQ=255) ttCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGtggtgac < 2:611246‑M2/131‑8 (MQ=255) ttCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATc > 2:1890990/1‑150 (MQ=255) ttCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATc < 2:1597444/150‑1 (MQ=255) ttCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATc > 1:1991190/1‑150 (MQ=255) tCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATcc < 2:1126084/150‑1 (MQ=255) accGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGCACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGCCCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCAc < 2:1123473/148‑1 (MQ=255) aaCGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCAc < 1:562854/150‑1 (MQ=255) gTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTg > 1:815858/1‑150 (MQ=255) tCGCCCCGCCTAGGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGt < 1:1693224/150‑1 (MQ=255) 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cTGGAAGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTg > 2:874558/1‑150 (MQ=255) tGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGa < 1:2232567/150‑1 (MQ=255) tGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGa > 2:1389666/1‑150 (MQ=255) gACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATc < 1:963262/150‑1 (MQ=255) gCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTAGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTg < 2:1579073/150‑1 (MQ=255) ccTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTgg < 1:874558/150‑1 (MQ=255) ccTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTAAGACTCGTAGTCCTACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTgg < 1:2255488/150‑1 (MQ=255) ccTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTCTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTgg < 1:978562/150‑1 (MQ=255) cTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGGGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTTGc > 2:884804/1‑150 (MQ=255) gTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGa < 1:40762/150‑1 (MQ=255) ggTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGTCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATaa < 2:1094591/150‑1 (MQ=255) gTCACCATGCTCG‑GCGtggtgaccgacaggccgtccaggtacagggtgaagttcggcgc > 2:1294595‑M2/1‑16 (MQ=255) gTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAAc < 1:1040022/150‑1 (MQ=255) tCACCATGCTCG‑GCGtggtgaccgacaggccgtccaggtacagggtgaagttcggcgcgaagccgtccaccgacatccactgccacag < 2:765631‑M2/88‑74 (MQ=255) aCCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAACctg > 1:1747000/1‑150 (MQ=255) ccATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAACctgc > 1:1910372/1‑150 (MQ=255) cATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCATCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAACctgct > 2:419145/1‑150 (MQ=255) cATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAACctgct > 1:2280917/1‑150 (MQ=255) tCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTc > 2:1238316/1‑122 (MQ=255) tCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTc < 1:1238316/122‑1 (MQ=255) g‑gCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAACCTGCTGTTCATc < 2:1762307/150‑1 (MQ=255) gtggtgACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAACCTGCTGTTCATCTAc > 2:1736341/1‑150 (MQ=255) | CCACGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCG‑GCGTGGTGACCG‑GTGTCGGCTTCCTGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAACCTGCTGTTCATCTAC > NC_002947/4666408‑4666706 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |