New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 5712282 | 93 (1.020) | coding (295/624 nt) | PP_5012 | hypothetical protein |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TGCCCGATGAAGAGGGCCTGATGCTCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGG > NC_002947/5712136‑5712430 | tGCCCGATGAAGAGGGCCTGATGCTCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGgcg < 2:210297‑M2/150‑4 (MQ=255) cccGATGAAGAGGGCCTGATGCTCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGGCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGAc > 2:418791/1‑150 (MQ=255) gATGAAGAGGGCCTGATGCTCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAg‑c > 2:1846386/1‑150 (MQ=255) 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tccagcgagcgcgcaggcggatatggccggccagcattgccgtggcgaccgggccaagccagcgttgcagctcgtgctcccagtccagctccaggtcctgctgcacagcccgCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTc > 2:2065432‑M1/113‑148 (MQ=255) ccagcgagcgcgcaggcggatatggccggccagcattgccgtggctaccgggccaagccagcgttgcagctcgtgctcccagtccagctccaggtcctgcagcacaccgaaCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGAc > 2:280802‑M1/112‑150 (MQ=255) aTGCTCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGAc < 1:962649/150‑1 (MQ=255) gCTCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCAGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCt > 2:2029035/1‑150 (MQ=255) cTCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGANCTg < 2:1496497/150‑1 (MQ=255) tCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGt > 2:110578/1‑150 (MQ=255) gcctccCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCAACATTTTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTc < 1:257999/150‑1 (MQ=255) gccgccCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCg < 2:767358/133‑1 (MQ=255) gccgccCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCg > 1:767358/1‑133 (MQ=255) gccgccCATTCGCAGCGCGAGGTCGACTGCCTCCTGCGCGCCCCCGCCGTTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTc < 1:797949/150‑1 (MQ=255) 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gTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAg > 1:1412876/1‑150 (MQ=255) cGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCt < 2:435059/150‑1 (MQ=255) gACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTg > 1:395715/1‑150 (MQ=255) aCTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTgg < 1:1641104/150‑1 (MQ=255) gccgccTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACt < 1:210297/150‑1 (MQ=255) cgccTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTgg < 1:527965/150‑1 (MQ=255) cgccTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTgg < 2:1011126/150‑1 (MQ=255) ccTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCTACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGgt > 1:301917/1‑121 (MQ=255) ccTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCTACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGgt < 2:301917/121‑1 (MQ=255) ccTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGa < 2:544475/150‑1 (MQ=255) ccccGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGGGCTGGACTGGGAGCACGAGCt < 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cccGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTgcgcgc > 1:374119/1‑150 (MQ=255) cGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGcgctc > 2:1548465/1‑150 (MQ=255) cGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTATGCTGCAGGAACTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGAGACGCTGGATTGGCCCGGTCGCCACGGCAACGCTGGCCGGCGATATCCTCCTgagcaccc > 2:313416/1‑146 (MQ=255) gCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGTCCGGCCATATCCGCCTGCGcgctcg > 1:603302/1‑150 (MQ=255) AGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGcgctcgct > 1:489110‑M1/1‑150 (MQ=255) AGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGcgctcgct > 2:2078566‑M1/1‑150 (MQ=255) GGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTg > 2:374119‑M1/1‑150 (MQ=255) GGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTg > 1:1047687‑M1/1‑150 (MQ=255) GTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGc < 2:170496‑M1/94‑1 (MQ=255) GTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGc > 1:170496‑M1/1‑94 (MQ=255) TCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGa > 1:419047‑M1/1‑150 (MQ=255) GCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCg < 2:2159789‑M1/150‑1 (MQ=255) CTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGc > 2:2321278‑M1/1‑150 (MQ=255) cACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGc > 1:139538/1‑73 (MQ=255) aCGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAg < 2:1426533/150‑1 (MQ=255) aCGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAg > 2:1829009/1‑150 (MQ=255) aCGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAg > 2:1821718/1‑150 (MQ=255) | TGCCCGATGAAGAGGGCCTGATGCTCGCCGCCCATTGGCAGGGCGAGGTCGACTGCCGCCTGCGCGCCCCCGCCGGTAGCCTGGCGCAACTGGCCTTGGTCAAGGACAAGACCGCTGTGCTGCACAGCCCGCAGGTCGAGCTGCACGGCGACAG‑CGCCGTACTGCTCGACCTGTTCGGTGTGCTGCAGGACCTGGAGCTGGACTGGGAGCACGAGCTGCAACGCTGGCTTGGCCCGGTCGCCACGGCAATGCTGGCCGGCCATATCCGCCTGCGCGCTCGCTGGACTCGCCAAGG > NC_002947/5712136‑5712430 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |